More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0575 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0575  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
282 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4586  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.44 
 
 
284 aa  401  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4753  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.26 
 
 
284 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163262  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.39 
 
 
285 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716847  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.39 
 
 
285 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.110576 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.23 
 
 
284 aa  359  3e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.757824  normal  0.126466 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.39 
 
 
285 aa  358  5e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603842  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.86 
 
 
285 aa  357  9.999999999999999e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.957314  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27180  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  61.43 
 
 
281 aa  350  1e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2428  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.97 
 
 
285 aa  308  5.9999999999999995e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441007 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.72 
 
 
285 aa  298  9e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.71 
 
 
284 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.102631 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0121  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.91 
 
 
286 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.984934 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0667  short chain dehydrogenase  50.54 
 
 
288 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.75 
 
 
300 aa  281  8.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319997  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
286 aa  279  5e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
286 aa  279  5e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.317832 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.18 
 
 
286 aa  278  6e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0818  short chain dehydrogenase  50.18 
 
 
288 aa  277  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0805  short chain dehydrogenase  50.18 
 
 
288 aa  276  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.29 
 
 
306 aa  276  2e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0712  short chain dehydrogenase  49.46 
 
 
288 aa  276  3e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.712851  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0663  short chain dehydrogenase  49.46 
 
 
288 aa  276  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0748  short chain dehydrogenase  49.46 
 
 
288 aa  276  3e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0824  short chain dehydrogenase  49.46 
 
 
288 aa  276  3e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.87827e-53 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.82 
 
 
288 aa  275  6e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000784864  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0655  short chain dehydrogenase  49.82 
 
 
288 aa  275  7e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000332724  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.54 
 
 
285 aa  275  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.539155  normal  0.142405 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.54 
 
 
286 aa  275  9e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453828  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0912  short chain dehydrogenase  49.82 
 
 
288 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4525  short chain dehydrogenase  49.46 
 
 
288 aa  273  3e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.193288 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.27 
 
 
285 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.359984 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0632  short chain dehydrogenase  48.2 
 
 
288 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000680928  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2292  short-chain dehydrogenase/reductase, oxidoreductase  48.74 
 
 
291 aa  270  2e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.253121  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52 
 
 
293 aa  270  2.9999999999999997e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.116516  normal  0.834143 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.81 
 
 
285 aa  269  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0775551 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.72 
 
 
285 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000245222 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.17 
 
 
297 aa  268  8.999999999999999e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4486  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.81 
 
 
292 aa  268  8.999999999999999e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0684702 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.45 
 
 
285 aa  267  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.45 
 
 
285 aa  268  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136189  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.35 
 
 
284 aa  266  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.25 
 
 
287 aa  266  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1180  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.24 
 
 
293 aa  266  4e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0727781  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3667  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.54 
 
 
284 aa  265  5e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.847413  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36870  putative short-chain dehydrogenase  48.78 
 
 
286 aa  265  5e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1505  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.81 
 
 
286 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1426  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.76 
 
 
296 aa  264  1e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.530393 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2925  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.09 
 
 
296 aa  264  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.4 
 
 
286 aa  263  2e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392241  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.38 
 
 
285 aa  263  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.566144  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.47 
 
 
297 aa  263  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5588  dehydrogenase  47.79 
 
 
285 aa  263  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.86 
 
 
287 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.71 
 
 
288 aa  263  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3986  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.36 
 
 
297 aa  262  4.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.18 
 
 
285 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4376  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.84 
 
 
285 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896027  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.95 
 
 
285 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00277313  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6461  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.95 
 
 
285 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4304  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.16 
 
 
311 aa  258  5.0000000000000005e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2025  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.18 
 
 
288 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000209901 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1317  Short-chain dehydrogenase  48.18 
 
 
288 aa  258  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169913  normal  0.0434292 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.19 
 
 
285 aa  258  6e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0516293 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.69 
 
 
285 aa  258  8e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0246755  normal  0.0427159 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5467  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.6 
 
 
305 aa  257  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.69 
 
 
285 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.11398  normal  0.546447 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.06 
 
 
282 aa  256  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.144902 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0460  short chain dehydrogenase  46.24 
 
 
291 aa  256  3e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2695  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.27 
 
 
285 aa  255  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00727931 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.08 
 
 
285 aa  255  7e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.319892  normal  0.963036 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.86 
 
 
288 aa  254  8e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306467  normal  0.765133 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.18 
 
 
288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.207761 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5297  short chain dehydrogenase  47.25 
 
 
317 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.460339 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2744  short chain dehydrogenase  48.36 
 
 
334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.972914  normal  0.0520687 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0919  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.72 
 
 
285 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.73 
 
 
282 aa  253  2.0000000000000002e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.69 
 
 
285 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217132 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.45 
 
 
285 aa  253  3e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11090  Short-chain dehydrogenase/reductase  47.6 
 
 
286 aa  252  4.0000000000000004e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.08 
 
 
285 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.402229  normal  0.230445 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0991  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  46.98 
 
 
291 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.123495  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1971  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  46.98 
 
 
285 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0942003  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1370  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  46.98 
 
 
285 aa  252  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.473076  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2253  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  46.98 
 
 
285 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3020  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  46.98 
 
 
285 aa  252  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3899  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.67 
 
 
284 aa  251  6e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.190456 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19840  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  49.46 
 
 
297 aa  252  6e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1278  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  46.98 
 
 
285 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.93331  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3149  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  46.98 
 
 
285 aa  252  6e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.653242  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.04 
 
 
291 aa  251  7e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.608035  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1817  short chain dehydrogenase  48 
 
 
337 aa  251  9.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.21 
 
 
286 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.36 
 
 
308 aa  251  9.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.278854  normal  0.143787 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.59 
 
 
289 aa  250  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.16 
 
 
291 aa  249  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.791141  normal  0.178884 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.45 
 
 
285 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.798039  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.32 
 
 
283 aa  248  8e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.84 
 
 
286 aa  248  9e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0068  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.62 
 
 
368 aa  248  9e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.521735  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>