More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0068 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0068  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
368 aa  748    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.521735  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1207  short chain dehydrogenase  65.72 
 
 
337 aa  429  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2744  short chain dehydrogenase  62.24 
 
 
334 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.972914  normal  0.0520687 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5249  short chain dehydrogenase  60.38 
 
 
318 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.109132  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5297  short chain dehydrogenase  58.54 
 
 
317 aa  378  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.460339 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1817  short chain dehydrogenase  60.41 
 
 
337 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0460  short chain dehydrogenase  56.36 
 
 
291 aa  330  2e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.9 
 
 
301 aa  301  1e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36870  putative short-chain dehydrogenase  53.02 
 
 
286 aa  288  7e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.71 
 
 
287 aa  285  8e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5467  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.88 
 
 
305 aa  285  9e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.26 
 
 
285 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.47 
 
 
282 aa  282  5.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.43 
 
 
287 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11090  Short-chain dehydrogenase/reductase  51.64 
 
 
286 aa  281  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1180  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.4 
 
 
293 aa  276  5e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0727781  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.99 
 
 
284 aa  276  5e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.22798  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.85 
 
 
285 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.566144  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4376  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.96 
 
 
285 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896027  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0632  short chain dehydrogenase  49.45 
 
 
288 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000680928  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27180  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  49.45 
 
 
281 aa  273  5.000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2428  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.92 
 
 
285 aa  271  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441007 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0912  short chain dehydrogenase  49.09 
 
 
288 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.96 
 
 
306 aa  270  2.9999999999999997e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0818  short chain dehydrogenase  48.36 
 
 
288 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.43 
 
 
297 aa  269  7e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0712  short chain dehydrogenase  48.36 
 
 
288 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.712851  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0663  short chain dehydrogenase  48.36 
 
 
288 aa  267  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0748  short chain dehydrogenase  48.36 
 
 
288 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0805  short chain dehydrogenase  49.09 
 
 
288 aa  267  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0667  short chain dehydrogenase  48.73 
 
 
288 aa  267  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0824  short chain dehydrogenase  48.36 
 
 
288 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.87827e-53 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3667  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.21 
 
 
284 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.847413  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4753  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.28 
 
 
284 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163262  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4525  short chain dehydrogenase  48.36 
 
 
288 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.193288 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.99 
 
 
284 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.361211  hitchhiker  0.00000740353 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0655  short chain dehydrogenase  47.64 
 
 
288 aa  264  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000332724  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1426  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.45 
 
 
296 aa  264  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.530393 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.64 
 
 
291 aa  264  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.608035  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.26 
 
 
288 aa  262  8e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000784864  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.11 
 
 
289 aa  261  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0121  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
286 aa  260  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.984934 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.45 
 
 
284 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.102631 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.54 
 
 
285 aa  259  7e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.359984 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.1 
 
 
308 aa  259  8e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.278854  normal  0.143787 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.91 
 
 
285 aa  257  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.19 
 
 
284 aa  257  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.757824  normal  0.126466 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.1 
 
 
284 aa  257  3e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.14 
 
 
293 aa  256  4e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.116516  normal  0.834143 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.35 
 
 
285 aa  256  5e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716847  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.35 
 
 
285 aa  256  5e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.110576 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1525  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.46 
 
 
283 aa  255  9e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.623157  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.91 
 
 
285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.957314  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3899  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.45 
 
 
284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.190456 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.54 
 
 
285 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136189  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2925  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.77 
 
 
296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.27 
 
 
286 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.99 
 
 
285 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0775551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.99 
 
 
285 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603842  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.34 
 
 
288 aa  253  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306467  normal  0.765133 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1317  Short-chain dehydrogenase  49.08 
 
 
288 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169913  normal  0.0434292 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0452  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.57 
 
 
287 aa  251  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259282  normal  0.969458 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.02 
 
 
287 aa  251  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.59 
 
 
285 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000245222 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.07 
 
 
282 aa  250  3e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.144902 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.23 
 
 
286 aa  249  5e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392241  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.62 
 
 
285 aa  249  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.539155  normal  0.142405 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.18 
 
 
288 aa  249  7e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2584  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  47 
 
 
292 aa  249  7e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.72 
 
 
285 aa  248  8e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0575  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.62 
 
 
282 aa  248  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2025  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.14 
 
 
288 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000209901 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.28 
 
 
298 aa  247  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.795136 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.34 
 
 
286 aa  246  4e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239121  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2905  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  46.29 
 
 
292 aa  246  4e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.62 
 
 
288 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.207761 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22650  short-chain alcohol dehydrogenase like protein  46.48 
 
 
306 aa  246  6.999999999999999e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.7 
 
 
285 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00277313  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6461  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.7 
 
 
285 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.18 
 
 
283 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1134  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.18 
 
 
285 aa  244  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4486  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.15 
 
 
292 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0684702 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15410  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  46.95 
 
 
313 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.170308  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.94 
 
 
285 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0516293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.84 
 
 
286 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1505  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 
286 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.64 
 
 
301 aa  242  6e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2695  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.45 
 
 
285 aa  242  9e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00727931 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.81 
 
 
285 aa  242  9e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0246755  normal  0.0427159 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.45 
 
 
286 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.45 
 
 
286 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.317832 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2677  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  48.5 
 
 
286 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822958  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3986  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.21 
 
 
297 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.21 
 
 
286 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.43 
 
 
285 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.11398  normal  0.546447 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2129  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.69 
 
 
289 aa  239  5e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.79 
 
 
286 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453828  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2292  short-chain dehydrogenase/reductase, oxidoreductase  45.96 
 
 
291 aa  239  5e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.253121  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.55 
 
 
293 aa  239  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.133433  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.08 
 
 
285 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.798039  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>