216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1221 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_1221  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 427 aa  845    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2072  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.1 
 
 		 379 aa  95.5  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1222  hypothetical protein  23.46 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2603  secretion protein HlyD  24.93 
 
 		 389 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.22725  normal  0.133946 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.47 
 
 		 410 aa  72  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.61066  normal  0.83964 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0919  AcrA/AcrE family efflux protein  22.89 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1857  secretion protein HlyD  22.11 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1007  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24 
 
 		 398 aa  67.8  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  21.98 
 
 		 384 aa  66.6  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.08 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.035635  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0635  macrolide-specific efflux protein macA  21.99 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0167041  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1064  macrolide-specific efflux protein macA  23.01 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0267322  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  21.19 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0770  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.07 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0433625  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0695  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.95 
 
 		 353 aa  63.9  0.000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0709  macrolide-specific efflux protein macA  22.44 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2428  RND family efflux transporter MFP subunit  24.82 
 
 		 361 aa  63.2  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00201655  decreased coverage  0.00000151053 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2116  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.01 
 
 		 393 aa  63.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.419105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1080  MacA  23.53 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31870  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  19.19 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2732  RND family efflux transporter MFP subunit  24.19 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0844309  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2586  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.03 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3927  RND family efflux transporter MFP subunit  25.61 
 
 		 392 aa  59.7  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1737  secretion protein HlyD  24.61 
 
 		 360 aa  59.7  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000190652  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3353  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.62 
 
 		 396 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462389  normal  0.0123154 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0747  secretion protein HlyD  23.19 
 
 		 357 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.554021  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3096  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.49 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2708  RND efflux membrane fusion protein precursor  18.92 
 
 		 426 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0286088  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1567  multidrug efflux system subunit MdtA  19.69 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.331208 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0487  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.4 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2754  RND efflux transporter  20.28 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000226253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1423  RND family efflux transporter MFP subunit  20.28 
 
 		 401 aa  57  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1970  secretion protein HlyD  21.22 
 
 		 390 aa  57  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0699832  normal  0.38447 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1866  RND family efflux transporter MFP subunit  26.64 
 
 		 385 aa  57  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000232808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  19.56 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0117238  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2366  multidrug efflux system subunit MdtA  19.56 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2216  multidrug efflux system subunit MdtA  19.56 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1312  RND efflux transporter  19.27 
 
 		 401 aa  56.2  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000130358  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1334  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  20.83 
 
 		 393 aa  56.2  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0169276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  22.65 
 
 		 370 aa  56.2  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1577  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.6 
 
 		 434 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0742  secretion protein HlyD  22.19 
 
 		 400 aa  55.8  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.460648 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  22.65 
 
 		 370 aa  56.2  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1573  RND family efflux transporter MFP subunit  22.39 
 
 		 399 aa  55.8  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  22.65 
 
 		 370 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1159  multidrug efflux system subunit MdtA  19.38 
 
 		 415 aa  55.5  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  24.44 
 
 		 360 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00136978  hitchhiker  0.0000141161 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2410  RND family efflux transporter MFP subunit  24.44 
 
 		 360 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000315716  hitchhiker  0.00636413 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1658  RND family efflux transporter MFP subunit  24.44 
 
 		 360 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000232607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3014  multidrug efflux system subunit MdtA  19.38 
 
 		 415 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.105913 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.1 
 
 		 390 aa  55.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3689  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.07 
 
 		 414 aa  55.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1685  RND family efflux transporter MFP subunit  22.13 
 
 		 387 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  26.53 
 
 		 426 aa  54.7  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0986  multidrug efflux system subunit MdtA  19.56 
 
 		 415 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1651  secretion protein HlyD  22.02 
 
 		 407 aa  53.9  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.986785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1083  RND family efflux transporter MFP subunit  20.62 
 
 		 359 aa  53.9  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0380532  normal  0.959663 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01979  multidrug efflux system, subunit A  19.24 
 
 		 415 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4209  efflux transporter, RND family, MFP subunit  19.49 
 
 		 392 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3883  secretion protein HlyD  21.91 
 
 		 424 aa  53.9  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01971  hypothetical protein  19.24 
 
 		 415 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.99 
 
 		 413 aa  53.5  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  25.79 
 
 		 421 aa  53.5  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2684  multidrug efflux system subunit MdtA  19.75 
 
 		 411 aa  53.5  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  23.51 
 
 		 389 aa  53.1  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.75 
 
 		 416 aa  52.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2907  RND efflux system membrane fusion protein  20.91 
 
 		 433 aa  53.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484522  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0175  hypothetical protein  26.04 
 
 		 380 aa  52.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.109936  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1215  multidrug efflux system subunit MdtA  21.74 
 
 		 444 aa  53.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3533  RND family efflux transporter MFP subunit  19.89 
 
 		 409 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.722317 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3103  multidrug efflux system subunit MdtA  21.74 
 
 		 427 aa  52.8  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01077  HlyD family secretion protein  23.69 
 
 		 376 aa  52.4  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1610  RND family efflux transporter MFP subunit  22.75 
 
 		 394 aa  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.665479  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1881  HlyD family-like protein  24.64 
 
 		 360 aa  52.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1940  secretion protein HlyD  23.65 
 
 		 395 aa  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.345824  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1332  multidrug efflux system subunit MdtA  21.43 
 
 		 444 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.713792  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2454  RND family efflux transporter MFP subunit  22.55 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2179  RND family efflux transporter MFP subunit  23.1 
 
 		 361 aa  52.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000248395  normal  0.140593 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0300  RND family efflux transporter MFP subunit  22.17 
 
 		 407 aa  52  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.83 
 
 		 663 aa  51.6  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1256  membrane fusion protein (MFP) family auxiliary transport protein  23.8 
 
 		 397 aa  51.2  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2160  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.49 
 
 		 390 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.337788  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2617  secretion protein HlyD  22.74 
 
 		 385 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000106145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1084  MacA  24.93 
 
 		 402 aa  50.4  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3412  secretion protein HlyD  21.2 
 
 		 443 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0866166  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5132  RND family efflux transporter MFP subunit  21.37 
 
 		 445 aa  50.4  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0099  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.39 
 
 		 408 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  20.82 
 
 		 408 aa  50.4  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.19 
 
 		 459 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.465461  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3828  secretion protein HlyD  24.86 
 
 		 430 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.88 
 
 		 426 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  21.41 
 
 		 381 aa  50.1  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.53 
 
 		 360 aa  50.1  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1792  secretion protein HlyD  22.36 
 
 		 412 aa  50.1  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.567297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1469  secretion protein HlyD  28.79 
 
 		 421 aa  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.910926 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  22.35 
 
 		 358 aa  50.1  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0962  secretion protein HlyD  20.71 
 
 		 405 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255558  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1796  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 360 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000436323  hitchhiker  0.00000011193 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  21.94 
 
 		 358 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  20.82 
 
 		 408 aa  49.3  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>