42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1222 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_1222  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  595  1e-169  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1221  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.46 
 
 		 427 aa  75.9  0.0000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.53 
 
 		 413 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0078  putative secretion protein HlyD  22.89 
 
 		 409 aa  50.4  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.36335 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1953  RND family efflux transporter MFP subunit  30.21 
 
 		 367 aa  50.1  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0078  hypothetical protein  21.54 
 
 		 381 aa  49.3  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0335  HlyD family secretion protein  32.93 
 
 		 411 aa  48.5  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0739  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.85 
 
 		 362 aa  48.9  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.941037  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0307  HlyD family secretion protein  31.71 
 
 		 411 aa  46.6  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.556263  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2521  secretion protein HlyD  35.14 
 
 		 435 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.770973  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01876  hypothetical protein  30.85 
 
 		 359 aa  46.2  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1924  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.93 
 
 		 352 aa  46.2  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.896235 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4319  RND family efflux transporter MFP subunit  36.21 
 
 		 460 aa  45.8  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0569861 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2445  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 		 424 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0377313 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2286  RND family efflux transporter MFP subunit  30.14 
 
 		 423 aa  45.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5686  RND family efflux transporter MFP subunit  22.86 
 
 		 401 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.214167 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.89 
 
 		 450 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.736393 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1054  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.85 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.153115  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0742  secretion protein HlyD  27.4 
 
 		 400 aa  45.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.460648 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  26.16 
 
 		 408 aa  44.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  26.16 
 
 		 408 aa  45.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2293  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.76 
 
 		 430 aa  44.3  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4313  RND family efflux transporter MFP subunit  22.45 
 
 		 409 aa  44.3  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.583259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2808  membrane fusion protein; cation efflux system protein  25.98 
 
 		 353 aa  43.5  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31870  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  25.58 
 
 		 426 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5483  HlyD family secretion protein  33.33 
 
 		 396 aa  43.1  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0155996  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0715  RND family efflux transporter MFP subunit  21.45 
 
 		 404 aa  43.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1658  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 360 aa  43.1  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000232607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2072  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 		 379 aa  43.1  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4148  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.67 
 
 		 560 aa  43.1  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2447  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.21 
 
 		 462 aa  43.1  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2097  RND family efflux transporter MFP subunit  21.48 
 
 		 391 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.902105  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3560  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.33 
 
 		 393 aa  43.1  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2410  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 360 aa  42.7  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000315716  hitchhiker  0.00636413 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 360 aa  42.7  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00136978  hitchhiker  0.0000141161 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1419  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.38 
 
 		 387 aa  42.7  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.267588  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1124  RND family efflux transporter MFP subunit  38.89 
 
 		 408 aa  42.7  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360909 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3750  secretion protein HlyD  22.86 
 
 		 401 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4618  RND family efflux transporter MFP subunit  22.86 
 
 		 401 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343268  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_003296  RS02155  putative transport transmembrane protein  30.26 
 
 		 421 aa  42.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0572  secretion protein HlyD  29.87 
 
 		 498 aa  42.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0544292  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0882  hypothetical protein  32.18 
 
 		 338 aa  42.4  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>