195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2846 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2846  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449385  decreased coverage  0.00911048 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  74.18 
 
 
195 aa  240  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2977  hypothetical protein  68.02 
 
 
195 aa  217  7.999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000274563  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  63.74 
 
 
210 aa  213  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  53.4 
 
 
193 aa  171  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  48.21 
 
 
207 aa  149  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0328  hypothetical protein  48.06 
 
 
227 aa  148  6e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1881  hypothetical protein  53.14 
 
 
200 aa  139  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  46.15 
 
 
212 aa  135  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4741  hypothetical protein  51.45 
 
 
213 aa  132  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0199  hypothetical protein  48.62 
 
 
213 aa  128  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182952  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3415  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  46.6 
 
 
191 aa  127  7.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4967  hypothetical protein  46.49 
 
 
193 aa  119  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13070  uncharacterized MobA-like protein  45.11 
 
 
194 aa  114  7.999999999999999e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5126  hypothetical protein  46.82 
 
 
184 aa  112  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3196  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  45.59 
 
 
211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.19 
 
 
208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  37.19 
 
 
208 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  32.99 
 
 
204 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  40.74 
 
 
211 aa  106  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2799  hypothetical protein  44.26 
 
 
189 aa  103  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  39.38 
 
 
455 aa  100  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4787  hypothetical protein  47.73 
 
 
175 aa  100  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171606  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.79 
 
 
194 aa  97.1  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1662  hypothetical protein  45.76 
 
 
181 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  31.75 
 
 
190 aa  95.1  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  36.27 
 
 
575 aa  95.1  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.75 
 
 
539 aa  94.7  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  35.98 
 
 
216 aa  94.7  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3976  hypothetical protein  41.53 
 
 
185 aa  91.3  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326622  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  39.38 
 
 
546 aa  90.9  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.18 
 
 
189 aa  88.6  5e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.2 
 
 
533 aa  88.6  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3203  hypothetical protein  40 
 
 
197 aa  88.2  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.950597  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  35 
 
 
534 aa  88.2  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1779  hypothetical protein  38.25 
 
 
186 aa  88.6  6e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  31.79 
 
 
199 aa  88.2  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.59 
 
 
202 aa  87.4  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1283  hypothetical protein  44.38 
 
 
181 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260926  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1300  hypothetical protein  44.38 
 
 
181 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0119759  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2979  hypothetical protein  38.86 
 
 
197 aa  87.8  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.220075 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  35.75 
 
 
534 aa  87  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  34.9 
 
 
534 aa  86.3  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.79 
 
 
534 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  37.82 
 
 
200 aa  85.5  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  35.53 
 
 
210 aa  85.1  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.69 
 
 
533 aa  85.1  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4310  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  34.1 
 
 
228 aa  84.7  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.707183  normal  0.580614 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  37.57 
 
 
191 aa  84.7  8e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  37.3 
 
 
367 aa  83.6  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0793  hypothetical protein  38.12 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  34.97 
 
 
187 aa  80.9  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0903  hypothetical protein  30.81 
 
 
216 aa  80.5  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.631928  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.72 
 
 
204 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.12 
 
 
202 aa  80.5  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  36.73 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4204  MobA-like protein-like protein  26.37 
 
 
204 aa  80.5  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212178  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  35.26 
 
 
544 aa  80.1  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.38 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0328  hypothetical protein  39.6 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0317  hypothetical protein  39.6 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.449595  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1554  metal dependent phosphohydrolase  31.66 
 
 
370 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.307535  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  33.85 
 
 
214 aa  78.2  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0306  hypothetical protein  39.11 
 
 
206 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1827  hypothetical protein  39.33 
 
 
195 aa  77  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.563205  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0984  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.97 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0360339  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6199  hypothetical protein  38.68 
 
 
251 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.326394  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.61 
 
 
197 aa  77  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2964  hypothetical protein  41.01 
 
 
196 aa  76.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4770  molybdenum cofactor biosynthesis protein  39.43 
 
 
174 aa  73.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.34 
 
 
203 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1312  hypothetical protein  43.82 
 
 
181 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0123  MobA-like protein  38.33 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.14106  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  34.59 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5450  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.9 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2648  molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.21 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3029  molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.54 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.098074  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  36.84 
 
 
538 aa  72.4  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.5 
 
 
533 aa  72  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0225  hypothetical protein  36.84 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.633552  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1188  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.54 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143953  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  32.14 
 
 
591 aa  71.2  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1224  MobA-like protein-like protein  23.44 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.607114  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1757  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.57 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1989  hypothetical protein  34.74 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0279  hypothetical protein  26.6 
 
 
218 aa  68.9  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2695  hypothetical protein  29.19 
 
 
202 aa  68.9  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0332984  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0825  MobA-like protein-like protein  37.16 
 
 
196 aa  68.6  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207801  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  32.81 
 
 
187 aa  67.8  0.00000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  35.08 
 
 
201 aa  67.4  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.61 
 
 
538 aa  67.4  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3432  metal dependent phosphohydrolase  28.27 
 
 
408 aa  67.4  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1894  hypothetical protein  31.52 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2712  MobA-like protein-like  25.13 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2410  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.73 
 
 
194 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4656  hypothetical protein  34.72 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720744  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  36.07 
 
 
192 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.7 
 
 
197 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.134734 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4726  hypothetical protein  31.98 
 
 
195 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.048995 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0890  uncharacterized MobA-related protein  36.05 
 
 
194 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.28742  normal  0.68349 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>