138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0306 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0306  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  391  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0317  hypothetical protein  98.05 
 
 
207 aa  384  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.449595  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0328  hypothetical protein  98.04 
 
 
207 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  45.45 
 
 
211 aa  137  7.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  38.66 
 
 
204 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  34.92 
 
 
199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  33.7 
 
 
190 aa  122  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  41.27 
 
 
198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4204  MobA-like protein-like protein  30.32 
 
 
204 aa  117  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212178  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  43.37 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  40.2 
 
 
194 aa  103  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1989  hypothetical protein  39.09 
 
 
208 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  37.31 
 
 
205 aa  99  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  37.89 
 
 
455 aa  94.7  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0825  MobA-like protein-like protein  42.49 
 
 
196 aa  91.7  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207801  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  34.92 
 
 
216 aa  90.5  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.32 
 
 
197 aa  88.2  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.82 
 
 
204 aa  87.8  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.57 
 
 
202 aa  87  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  37.3 
 
 
538 aa  85.1  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  37.37 
 
 
544 aa  85.1  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.52 
 
 
539 aa  84.7  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  27.46 
 
 
195 aa  84  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.32 
 
 
533 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1745  hypothetical protein  29.65 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.34 
 
 
534 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  36.41 
 
 
534 aa  82  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.5 
 
 
538 aa  81.3  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0214  hypothetical protein  39.2 
 
 
220 aa  80.5  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  38.86 
 
 
546 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  36.96 
 
 
575 aa  79.3  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2695  hypothetical protein  35.45 
 
 
202 aa  77.8  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0332984  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  36.56 
 
 
534 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.65 
 
 
533 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0984  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  42.29 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0360339  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1188  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  40.91 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143953  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  42.33 
 
 
195 aa  74.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0921  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  41.54 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.370175  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  34.38 
 
 
534 aa  74.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  40.72 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3215  hypothetical protein  43.78 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4656  hypothetical protein  34.9 
 
 
203 aa  71.6  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720744  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  34.67 
 
 
210 aa  71.2  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0203  hypothetical protein  35.23 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.761699  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5450  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  50 
 
 
201 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1573  hypothetical protein  40.31 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0210508  normal  0.559729 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.33 
 
 
533 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3029  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.6 
 
 
203 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.098074  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3300  hypothetical protein  42.29 
 
 
201 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20416  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2928  hypothetical protein  40.21 
 
 
199 aa  66.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  35.08 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1381  MobA-like protein  32.64 
 
 
293 aa  66.2  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.223593  normal  0.271333 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  39.39 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.134734 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13070  uncharacterized MobA-like protein  37.85 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2846  hypothetical protein  39.11 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449385  decreased coverage  0.00911048 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  40.59 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4741  hypothetical protein  41.48 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.75 
 
 
202 aa  64.7  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6027  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.52 
 
 
207 aa  64.7  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1079  molybdopterin biosynthesis enzyme  33.33 
 
 
218 aa  63.5  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1484  hypothetical protein  36.13 
 
 
201 aa  61.6  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205253  normal  0.364405 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0243  MobA-like protein  29.06 
 
 
216 aa  61.2  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00192406  normal  0.367058 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2037  hypothetical protein  31.91 
 
 
222 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0186754  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5614  hypothetical protein  32.37 
 
 
185 aa  61.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1805  MobA-like protein-like  27.54 
 
 
243 aa  60.5  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.16103 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10376  hypothetical protein  36.45 
 
 
197 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000126755  normal  0.572936 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2977  hypothetical protein  37.29 
 
 
195 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000274563  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2512  hypothetical protein  24.62 
 
 
221 aa  59.7  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  32.18 
 
 
591 aa  59.7  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1554  metal dependent phosphohydrolase  30.48 
 
 
370 aa  58.5  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.307535  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.65 
 
 
193 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3105  hypothetical protein  45.21 
 
 
201 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.247192  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0836  hypothetical protein  30.21 
 
 
196 aa  57  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  30.21 
 
 
208 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3415  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  33.68 
 
 
191 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0036  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  33.17 
 
 
225 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1433  hypothetical protein  32.47 
 
 
208 aa  56.6  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.170444 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  30.69 
 
 
214 aa  56.2  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1757  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  43.79 
 
 
199 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.69 
 
 
208 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  26.67 
 
 
389 aa  55.5  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  36.41 
 
 
212 aa  54.7  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4967  hypothetical protein  44.34 
 
 
193 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02165  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  27.51 
 
 
289 aa  53.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.892695  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  41.35 
 
 
210 aa  52.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2205  hypothetical protein  22.99 
 
 
242 aa  53.1  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0360  hypothetical protein  22.34 
 
 
190 aa  51.6  0.000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000717889  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3547  MobA-like protein-like  30.96 
 
 
384 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871069  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2641  MobA-related protein  18.57 
 
 
394 aa  50.8  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.77 
 
 
189 aa  50.4  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  30.16 
 
 
367 aa  50.4  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  34.59 
 
 
187 aa  50.1  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1816  metal dependent phosphohydrolase  27.32 
 
 
372 aa  50.4  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0199  hypothetical protein  44.71 
 
 
213 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182952  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5126  hypothetical protein  39.32 
 
 
184 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2799  hypothetical protein  38.6 
 
 
189 aa  50.1  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1260  xanthine dehydrogenase accessory protein pucB  32.84 
 
 
212 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2489  hypothetical protein  30.16 
 
 
192 aa  49.3  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.152259  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0530  hypothetical protein  33.01 
 
 
207 aa  49.3  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3196  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  37.19 
 
 
211 aa  48.9  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>