207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_13070 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_13070  uncharacterized MobA-like protein  100 
 
 
194 aa  372  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  49.49 
 
 
193 aa  139  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  48.66 
 
 
210 aa  136  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5126  hypothetical protein  51.72 
 
 
184 aa  134  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3976  hypothetical protein  52.72 
 
 
185 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326622  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0199  hypothetical protein  50.27 
 
 
213 aa  133  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182952  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4967  hypothetical protein  49.73 
 
 
193 aa  125  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4770  molybdenum cofactor biosynthesis protein  48.57 
 
 
174 aa  122  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2977  hypothetical protein  44.89 
 
 
195 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000274563  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2799  hypothetical protein  46.99 
 
 
189 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2846  hypothetical protein  47.45 
 
 
193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449385  decreased coverage  0.00911048 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  46.56 
 
 
195 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0328  hypothetical protein  42.03 
 
 
227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1662  hypothetical protein  45.41 
 
 
181 aa  111  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4787  hypothetical protein  44.51 
 
 
175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171606  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3415  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  43.52 
 
 
191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  39.25 
 
 
211 aa  108  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1881  hypothetical protein  45.3 
 
 
200 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1283  hypothetical protein  44.57 
 
 
181 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260926  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1300  hypothetical protein  44.57 
 
 
181 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0119759  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1312  hypothetical protein  45.41 
 
 
181 aa  101  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4741  hypothetical protein  47.09 
 
 
213 aa  99.8  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  37.31 
 
 
212 aa  97.8  9e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.51 
 
 
189 aa  94  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  33.5 
 
 
204 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3203  hypothetical protein  40.83 
 
 
197 aa  93.2  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.950597  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  34.74 
 
 
187 aa  91.7  6e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2068  hypothetical protein  39.66 
 
 
189 aa  91.3  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2979  hypothetical protein  40.24 
 
 
197 aa  90.9  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.220075 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1827  hypothetical protein  38.12 
 
 
195 aa  89  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.563205  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  38.04 
 
 
192 aa  89  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  27.46 
 
 
190 aa  86.7  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3196  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  38.31 
 
 
211 aa  87  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.82 
 
 
197 aa  85.1  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  38.17 
 
 
455 aa  83.6  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.38 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.37 
 
 
202 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2512  hypothetical protein  30.26 
 
 
221 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10350  hypothetical protein  40.14 
 
 
136 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2964  hypothetical protein  42.25 
 
 
196 aa  81.3  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  34.39 
 
 
538 aa  81.3  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  36.09 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  37.5 
 
 
191 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.14 
 
 
539 aa  80.1  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.83 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  34.41 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  41.18 
 
 
203 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  33.66 
 
 
534 aa  77.4  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4204  MobA-like protein-like protein  26.22 
 
 
204 aa  77.4  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212178  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  33.51 
 
 
216 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0984  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.5 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0360339  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  30.12 
 
 
199 aa  76.3  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4310  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  38.6 
 
 
228 aa  76.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.707183  normal  0.580614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  31.89 
 
 
199 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1689  hypothetical protein  57.83 
 
 
225 aa  74.3  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0654906  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  34.21 
 
 
544 aa  73.9  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1224  MobA-like protein-like protein  22.87 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.607114  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2617  hypothetical protein  34.39 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  33.67 
 
 
575 aa  72.8  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  33.16 
 
 
214 aa  72  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.51 
 
 
194 aa  72  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.78 
 
 
202 aa  71.6  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1079  molybdopterin biosynthesis enzyme  33.16 
 
 
218 aa  71.2  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  34.55 
 
 
191 aa  71.2  0.000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.81 
 
 
533 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.65 
 
 
534 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0358  hypothetical protein  35.26 
 
 
198 aa  69.3  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  34.72 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  36.51 
 
 
367 aa  69.3  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3432  metal dependent phosphohydrolase  29.84 
 
 
408 aa  68.9  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0530  hypothetical protein  31.09 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0306  hypothetical protein  37.43 
 
 
206 aa  68.6  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0203  hypothetical protein  39.44 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.761699  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1554  metal dependent phosphohydrolase  32.26 
 
 
370 aa  68.2  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.307535  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1467  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  28.27 
 
 
368 aa  67.4  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700168  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1816  metal dependent phosphohydrolase  31.02 
 
 
372 aa  65.9  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0328  hypothetical protein  37.63 
 
 
207 aa  65.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0317  hypothetical protein  37.63 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.449595  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  35.75 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  31.82 
 
 
534 aa  65.5  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  35.26 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.16 
 
 
533 aa  65.1  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1989  hypothetical protein  32.98 
 
 
208 aa  64.7  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3554  uncharacterized MobA-related protein  36.98 
 
 
194 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4813  uncharacterized MobA-related protein  36.98 
 
 
194 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.913909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5470  uncharacterized MobA-related protein  36.98 
 
 
194 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0663776 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2658  hypothetical protein  32.09 
 
 
197 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421379  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0890  uncharacterized MobA-related protein  35.94 
 
 
194 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.28742  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  35.08 
 
 
546 aa  63.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1188  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.32 
 
 
197 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143953  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5450  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.95 
 
 
201 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2695  hypothetical protein  29.8 
 
 
202 aa  63.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0332984  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2712  MobA-like protein-like  25.93 
 
 
208 aa  63.5  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  30.32 
 
 
198 aa  63.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1634  MobA-like protein  34.76 
 
 
188 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1545  metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 
393 aa  62.8  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4230  hypothetical protein  34.22 
 
 
188 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3796  hypothetical protein  34.57 
 
 
185 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328726  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1433  hypothetical protein  32.61 
 
 
208 aa  62  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.170444 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1413  hypothetical protein  27.6 
 
 
202 aa  62  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0598562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>