136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1989 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1989  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  405  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  33.33 
 
 
204 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4204  MobA-like protein-like protein  29.1 
 
 
204 aa  101  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212178  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  31.22 
 
 
199 aa  101  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0306  hypothetical protein  39.09 
 
 
206 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0317  hypothetical protein  39.59 
 
 
207 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.449595  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0328  hypothetical protein  39.59 
 
 
207 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  31.55 
 
 
190 aa  96.3  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1805  MobA-like protein-like  32.72 
 
 
243 aa  96.3  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.16103 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  35.11 
 
 
205 aa  92.4  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2695  hypothetical protein  37.31 
 
 
202 aa  89.4  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0332984  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  33.88 
 
 
455 aa  83.6  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  32.32 
 
 
198 aa  84  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  33.69 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1011  MobA-like protein-like protein  28.69 
 
 
275 aa  79.7  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127889 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  36.84 
 
 
538 aa  75.5  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2512  hypothetical protein  30.37 
 
 
221 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1745  hypothetical protein  33.33 
 
 
185 aa  74.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.28 
 
 
538 aa  73.2  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.02 
 
 
533 aa  68.2  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2712  MobA-like protein-like  26.06 
 
 
208 aa  68.6  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2977  hypothetical protein  33.52 
 
 
195 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000274563  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  23.94 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.81 
 
 
202 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  34.31 
 
 
534 aa  66.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.21 
 
 
208 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.09 
 
 
533 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3300  hypothetical protein  33.51 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20416  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3215  hypothetical protein  33.51 
 
 
201 aa  65.1  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.16 
 
 
193 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  29.69 
 
 
591 aa  63.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13070  uncharacterized MobA-like protein  32.42 
 
 
194 aa  63.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.46 
 
 
539 aa  63.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33 
 
 
534 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2846  hypothetical protein  36.65 
 
 
193 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449385  decreased coverage  0.00911048 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.65 
 
 
197 aa  62.8  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2037  hypothetical protein  29.35 
 
 
222 aa  62.4  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0186754  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  36.56 
 
 
195 aa  62  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.05 
 
 
194 aa  62  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4741  hypothetical protein  34.88 
 
 
213 aa  62.4  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4967  hypothetical protein  44.55 
 
 
193 aa  62  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.39 
 
 
203 aa  62  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3432  metal dependent phosphohydrolase  26.7 
 
 
408 aa  61.6  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3029  molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.41 
 
 
203 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.098074  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.58 
 
 
533 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.16 
 
 
210 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.05 
 
 
204 aa  60.5  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0984  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.99 
 
 
197 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0360339  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1188  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.14 
 
 
197 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143953  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  31.82 
 
 
534 aa  58.2  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  32 
 
 
534 aa  57  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3105  hypothetical protein  32.29 
 
 
201 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.247192  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0225  hypothetical protein  31.55 
 
 
197 aa  56.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.633552  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0825  MobA-like protein-like protein  32.45 
 
 
196 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207801  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  35.08 
 
 
544 aa  56.2  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.12 
 
 
197 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.134734 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  33.33 
 
 
210 aa  55.8  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  29.9 
 
 
216 aa  55.8  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1381  MobA-like protein  34.52 
 
 
293 aa  55.8  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.223593  normal  0.271333 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1413  hypothetical protein  29.21 
 
 
202 aa  55.5  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0598562  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0903  hypothetical protein  25.76 
 
 
216 aa  55.5  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.631928  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  24.47 
 
 
195 aa  55.1  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4656  hypothetical protein  31.25 
 
 
203 aa  55.1  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720744  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0279  hypothetical protein  26.73 
 
 
218 aa  54.3  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  32.82 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06371  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  29.57 
 
 
449 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1554  metal dependent phosphohydrolase  26.56 
 
 
370 aa  53.9  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.307535  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5614  hypothetical protein  33.33 
 
 
185 aa  53.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  32.97 
 
 
191 aa  53.1  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1757  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.36 
 
 
199 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  27.87 
 
 
187 aa  52  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1467  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  23.47 
 
 
368 aa  52  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700168  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3415  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  30.96 
 
 
191 aa  51.6  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3050  hypothetical protein  28.23 
 
 
229 aa  50.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1779  hypothetical protein  28.96 
 
 
186 aa  51.2  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1006  metal dependent phosphohydrolase  29.35 
 
 
373 aa  51.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0199  hypothetical protein  35.12 
 
 
213 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182952  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2410  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.65 
 
 
194 aa  51.2  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0203  hypothetical protein  27.81 
 
 
203 aa  50.1  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.761699  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06671  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  29.57 
 
 
449 aa  49.3  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.432114  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  31.11 
 
 
187 aa  49.3  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  31.1 
 
 
575 aa  48.9  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10376  hypothetical protein  29.02 
 
 
197 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000126755  normal  0.572936 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0611  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  28.95 
 
 
449 aa  48.9  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.255649  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4787  hypothetical protein  32.26 
 
 
175 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171606  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0214  hypothetical protein  33.16 
 
 
220 aa  48.1  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1495  hypothetical protein  29.22 
 
 
234 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06761  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  27.19 
 
 
447 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.78468  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5126  hypothetical protein  29.87 
 
 
184 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10391  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  28.57 
 
 
453 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3547  MobA-like protein-like  27.94 
 
 
384 aa  47  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871069  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0036  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  30.41 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1438  hypothetical protein  27.7 
 
 
228 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  26.18 
 
 
200 aa  46.6  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5450  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.41 
 
 
201 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2348  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  25.81 
 
 
451 aa  47  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1816  hypothetical protein  28.21 
 
 
200 aa  46.6  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1816  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 
372 aa  46.6  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1545  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 
393 aa  45.4  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4421  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  31.58 
 
 
453 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0508871  normal  0.0915045 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>