179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0203 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0203  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  393  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.761699  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0836  hypothetical protein  46.63 
 
 		 196 aa  151  7e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 		 389 aa  111  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.18 
 
 		 204 aa  111  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1006  metal dependent phosphohydrolase  40.29 
 
 		 373 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1467  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  33.16 
 
 		 368 aa  108  6e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700168  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1816  hypothetical protein  32.65 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3453  metal dependent phosphohydrolase  33.85 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.08 
 
 		 208 aa  99.8  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1816  metal dependent phosphohydrolase  38.68 
 
 		 423 aa  98.6  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.445922  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.6 
 
 		 202 aa  96.7  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  37.43 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1816  metal dependent phosphohydrolase  33.49 
 
 		 372 aa  92.4  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  34.67 
 
 		 591 aa  92.4  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  31.98 
 
 		 455 aa  91.3  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3547  MobA-like protein-like  37.5 
 
 		 384 aa  90.9  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  30.53 
 
 		 216 aa  90.9  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  39.04 
 
 		 534 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3432  metal dependent phosphohydrolase  33.16 
 
 		 408 aa  89.7  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1554  metal dependent phosphohydrolase  37.37 
 
 		 370 aa  89  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.307535  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  37.17 
 
 		 210 aa  89  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  37.95 
 
 		 200 aa  88.2  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1545  metal dependent phosphohydrolase  34.78 
 
 		 393 aa  88.2  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  35.33 
 
 		 575 aa  87  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  37.43 
 
 		 534 aa  85.9  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  34.59 
 
 		 544 aa  83.6  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.69 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.66 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.65 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  34.54 
 
 		 534 aa  81.3  0.000000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0036  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  35.11 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  34.54 
 
 		 534 aa  79.3  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2205  hypothetical protein  25.14 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2410  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.56 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.57 
 
 		 533 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  35.42 
 
 		 367 aa  77.4  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0634  metal dependent phosphohydrolase  37.05 
 
 		 514 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0970853 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  35.23 
 
 		 546 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  39.29 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.32 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2695  hypothetical protein  29.23 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0332984  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0825  MobA-like protein-like protein  33.16 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207801  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  31.41 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0228  uncharacterized MobA-related protein  28.98 
 
 		 363 aa  73.9  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2037  hypothetical protein  33.68 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0186754  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.81 
 
 		 539 aa  73.9  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  25.4 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2091  molybdopterin binding protein  33.86 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.865191  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  32.43 
 
 		 538 aa  71.2  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2392  hypothetical protein  30.3 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  28.21 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.85 
 
 		 533 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.82 
 
 		 538 aa  70.5  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  32.81 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2648  molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.64 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0360  hypothetical protein  27.84 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000717889  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  27.14 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1582  metal dependent phosphohydrolase  35.59 
 
 		 459 aa  67.8  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3415  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  35.11 
 
 		 191 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0225  hypothetical protein  40.78 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.633552  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  31.18 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  31.61 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0328  hypothetical protein  35.75 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0317  hypothetical protein  35.75 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.449595  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4204  MobA-like protein-like protein  26 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212178  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1746  hypothetical protein  30.49 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  32.98 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0903  hypothetical protein  30.05 
 
 		 216 aa  64.7  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.631928  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2658  hypothetical protein  33.85 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421379  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0306  hypothetical protein  35.23 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0530  hypothetical protein  38 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1779  hypothetical protein  31.79 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4741  hypothetical protein  34.04 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  34.25 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10376  hypothetical protein  34.2 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000126755  normal  0.572936 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5470  uncharacterized MobA-related protein  35.17 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0663776 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.69 
 
 		 533 aa  61.6  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3554  uncharacterized MobA-related protein  35.17 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4813  uncharacterized MobA-related protein  35.17 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.913909 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2977  hypothetical protein  32 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000274563  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3790  uncharacterized MobA-related protein  37.04 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0141357 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1079  molybdopterin biosynthesis enzyme  32.12 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  35.68 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.89 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  32.98 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4718  uncharacterized MobA-related protein-like protein  34.48 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819957 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13070  uncharacterized MobA-like protein  37.21 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  29.84 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0921  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  36.84 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.370175  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  25.39 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1634  MobA-like protein  33.51 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  31.25 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4195  MobA-like protein-like protein  34.27 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0793  hypothetical protein  31.03 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0890  uncharacterized MobA-related protein  33.79 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.28742  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2227  hypothetical protein  37.14 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4015  hypothetical protein  34.39 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2512  hypothetical protein  26.97 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4230  hypothetical protein  32.46 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5992  hypothetical protein  35.71 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.361176 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>