222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0236 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  100 
 
 
189 aa  378  1e-104  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  55.49 
 
 
187 aa  214  8e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  35.71 
 
 
191 aa  107  8.000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  35.64 
 
 
538 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.05 
 
 
533 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  31.77 
 
 
575 aa  104  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.47 
 
 
533 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  35.11 
 
 
455 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  29.47 
 
 
208 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.05 
 
 
202 aa  100  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  33.16 
 
 
216 aa  100  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.12 
 
 
194 aa  100  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.47 
 
 
208 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2205  hypothetical protein  32.6 
 
 
242 aa  98.2  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0793  hypothetical protein  37.5 
 
 
207 aa  97.4  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  35.23 
 
 
214 aa  97.1  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1779  hypothetical protein  36.26 
 
 
186 aa  97.1  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.58 
 
 
202 aa  96.7  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  31.96 
 
 
534 aa  92.8  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.47 
 
 
539 aa  92.8  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  31.58 
 
 
204 aa  92.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.32 
 
 
534 aa  92  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  31.09 
 
 
534 aa  91.3  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  30.37 
 
 
201 aa  90.5  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  31.44 
 
 
534 aa  90.5  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  30.96 
 
 
200 aa  89.4  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.16 
 
 
207 aa  89  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  26.74 
 
 
211 aa  88.2  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.96 
 
 
533 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  31.64 
 
 
187 aa  85.1  5e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0984  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.68 
 
 
197 aa  85.1  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0360339  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.35 
 
 
210 aa  84.7  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  30.05 
 
 
197 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  29.03 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.41 
 
 
197 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.134734 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6027  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.14 
 
 
207 aa  81.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.61 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  27.75 
 
 
190 aa  81.6  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0890  uncharacterized MobA-related protein  29.03 
 
 
194 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.28742  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2846  hypothetical protein  31.15 
 
 
193 aa  81.6  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449385  decreased coverage  0.00911048 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.43 
 
 
208 aa  81.3  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5470  uncharacterized MobA-related protein  30.65 
 
 
194 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0663776 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  31.94 
 
 
546 aa  81.3  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3554  uncharacterized MobA-related protein  30.65 
 
 
194 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4813  uncharacterized MobA-related protein  30.65 
 
 
194 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.913909 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13070  uncharacterized MobA-like protein  32.96 
 
 
194 aa  80.9  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  29.47 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1519  hypothetical protein  35.32 
 
 
203 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  29.35 
 
 
191 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1188  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.89 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143953  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  30.35 
 
 
205 aa  80.1  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  32.31 
 
 
539 aa  80.1  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  28.95 
 
 
367 aa  79.3  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1224  MobA-like protein-like protein  33.33 
 
 
201 aa  79  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.607114  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  29.35 
 
 
544 aa  79  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2617  hypothetical protein  28.21 
 
 
196 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.57 
 
 
538 aa  78.2  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2977  hypothetical protein  31.61 
 
 
195 aa  77.8  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000274563  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3432  metal dependent phosphohydrolase  29.69 
 
 
408 aa  77.8  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5450  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.94 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4656  hypothetical protein  27.98 
 
 
203 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720744  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1438  hypothetical protein  26.51 
 
 
228 aa  77  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  28.06 
 
 
212 aa  77.4  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2921  hypothetical protein  28.5 
 
 
216 aa  77  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.627898 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1707  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  31.18 
 
 
199 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1620  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  31.18 
 
 
199 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1881  hypothetical protein  28.42 
 
 
200 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0211  hypothetical protein  31.18 
 
 
346 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0194719  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  25.14 
 
 
199 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.17 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  29.67 
 
 
195 aa  75.9  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.85 
 
 
204 aa  75.5  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1495  hypothetical protein  25.45 
 
 
234 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3790  uncharacterized MobA-related protein  29.57 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0141357 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4167  hypothetical protein  29.95 
 
 
198 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0348908  normal  0.0855326 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1413  hypothetical protein  28.06 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0598562  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.16 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4718  uncharacterized MobA-related protein-like protein  27.96 
 
 
194 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.819957 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3050  hypothetical protein  25.58 
 
 
229 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1467  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  29.02 
 
 
368 aa  73.2  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700168  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  31.41 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1757  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.53 
 
 
199 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4195  MobA-like protein-like protein  27.96 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1199  hypothetical protein  30.65 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570343  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0825  MobA-like protein-like protein  35.43 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207801  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  27.23 
 
 
389 aa  72.4  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0201  hypothetical protein  28.26 
 
 
202 aa  72  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2928  hypothetical protein  27.23 
 
 
210 aa  71.6  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.796136  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4726  hypothetical protein  28.11 
 
 
195 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.048995 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0199  hypothetical protein  30.38 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182952  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  26.63 
 
 
198 aa  71.2  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4204  MobA-like protein-like protein  29.29 
 
 
204 aa  71.2  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212178  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1381  MobA-like protein  31.58 
 
 
293 aa  70.5  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.223593  normal  0.271333 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0279  hypothetical protein  29.33 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1079  molybdopterin biosynthesis enzyme  26.53 
 
 
218 aa  69.7  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0836  hypothetical protein  28.27 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2641  MobA-related protein  31.68 
 
 
394 aa  69.3  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5126  hypothetical protein  30.25 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2748  hypothetical protein  26.07 
 
 
245 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.668199  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2824  hypothetical protein  26.07 
 
 
245 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0559762 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>