243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0865 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  100 
 
 
210 aa  412  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2977  hypothetical protein  65.7 
 
 
195 aa  211  3.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000274563  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  62.63 
 
 
195 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2846  hypothetical protein  63.74 
 
 
193 aa  198  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449385  decreased coverage  0.00911048 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  50 
 
 
193 aa  158  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1881  hypothetical protein  51.08 
 
 
200 aa  145  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  44.1 
 
 
212 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0199  hypothetical protein  49.48 
 
 
213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182952  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4741  hypothetical protein  48.85 
 
 
213 aa  128  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4967  hypothetical protein  50 
 
 
193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  44.5 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.42 
 
 
208 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  38.42 
 
 
208 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13070  uncharacterized MobA-like protein  46.59 
 
 
194 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0328  hypothetical protein  41.75 
 
 
227 aa  117  9e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3415  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  44.44 
 
 
191 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5126  hypothetical protein  46.51 
 
 
184 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3196  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  41.12 
 
 
211 aa  103  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  38.95 
 
 
455 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3976  hypothetical protein  44.75 
 
 
185 aa  99.4  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326622  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  32.81 
 
 
190 aa  97.8  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  38.5 
 
 
211 aa  94.7  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.32 
 
 
202 aa  94.4  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.08 
 
 
539 aa  94.4  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2799  hypothetical protein  41.53 
 
 
189 aa  93.2  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  34.74 
 
 
216 aa  93.6  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3203  hypothetical protein  39.64 
 
 
197 aa  93.6  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.950597  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4310  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  35.84 
 
 
228 aa  93.6  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.707183  normal  0.580614 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  36.18 
 
 
534 aa  92  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.26 
 
 
533 aa  91.3  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  34.9 
 
 
575 aa  90.9  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  34.36 
 
 
205 aa  89.4  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.84 
 
 
534 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  38.54 
 
 
538 aa  88.2  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  31.63 
 
 
204 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2068  hypothetical protein  40.91 
 
 
189 aa  87  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  34.39 
 
 
534 aa  87  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1662  hypothetical protein  41.81 
 
 
181 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  36.36 
 
 
191 aa  87  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.85 
 
 
194 aa  86.3  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2964  hypothetical protein  40.72 
 
 
196 aa  86.3  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.35 
 
 
189 aa  84.7  9e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4787  hypothetical protein  42.7 
 
 
175 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171606  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  34.15 
 
 
214 aa  83.2  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  34.85 
 
 
367 aa  83.2  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.68 
 
 
533 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2979  hypothetical protein  36.69 
 
 
197 aa  82.8  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.220075 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.5 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2695  hypothetical protein  32.35 
 
 
202 aa  82  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0332984  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  37.19 
 
 
200 aa  82  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.66 
 
 
202 aa  81.6  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  35.14 
 
 
544 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  33 
 
 
210 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1283  hypothetical protein  40.22 
 
 
181 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260926  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1300  hypothetical protein  40.22 
 
 
181 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0119759  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4770  molybdenum cofactor biosynthesis protein  38.86 
 
 
174 aa  78.6  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.55 
 
 
538 aa  78.2  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  29.41 
 
 
187 aa  77.8  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1467  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  27.86 
 
 
368 aa  77  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700168  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1554  metal dependent phosphohydrolase  36.88 
 
 
370 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.307535  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  28.72 
 
 
199 aa  76.3  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  33.33 
 
 
534 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4204  MobA-like protein-like protein  27.27 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212178  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.02 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0203  hypothetical protein  39.29 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.761699  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.14 
 
 
208 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2037  hypothetical protein  35.1 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0186754  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.59 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  33 
 
 
591 aa  71.6  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0903  hypothetical protein  27.78 
 
 
216 aa  71.2  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.631928  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  30.81 
 
 
197 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  35.64 
 
 
546 aa  70.1  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1757  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.79 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0984  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.08 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0360339  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2512  hypothetical protein  29.61 
 
 
221 aa  68.9  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1413  hypothetical protein  29.74 
 
 
202 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0598562  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1827  hypothetical protein  38.3 
 
 
195 aa  68.6  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.563205  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  32.4 
 
 
187 aa  68.6  0.00000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3029  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.21 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.098074  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5450  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.9 
 
 
201 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1312  hypothetical protein  36.87 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.74 
 
 
533 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  26.96 
 
 
389 aa  67.4  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1779  hypothetical protein  35.11 
 
 
186 aa  67.8  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0793  hypothetical protein  36.36 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  31.05 
 
 
199 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  29.44 
 
 
198 aa  67  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1006  metal dependent phosphohydrolase  33.57 
 
 
373 aa  67  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1188  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.51 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143953  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1816  hypothetical protein  28.5 
 
 
200 aa  67  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6199  hypothetical protein  35.02 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.326394  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.98 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.134734 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2410  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.41 
 
 
194 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1816  metal dependent phosphohydrolase  33.1 
 
 
372 aa  64.7  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3547  MobA-like protein-like  32.65 
 
 
384 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871069  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0825  MobA-like protein-like protein  34.72 
 
 
196 aa  62.8  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207801  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4726  hypothetical protein  34.68 
 
 
195 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.048995 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1545  metal dependent phosphohydrolase  28.67 
 
 
393 aa  62.4  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  35.54 
 
 
201 aa  62.4  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0225  hypothetical protein  32.26 
 
 
197 aa  62  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.633552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>