98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6199 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6199  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  459  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.326394  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4741  hypothetical protein  38.73 
 
 
213 aa  91.3  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.49 
 
 
193 aa  89.7  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2846  hypothetical protein  37.74 
 
 
193 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449385  decreased coverage  0.00911048 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  35.87 
 
 
195 aa  86.3  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.02 
 
 
210 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  35.65 
 
 
212 aa  84.7  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1881  hypothetical protein  36.24 
 
 
200 aa  81.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0328  hypothetical protein  35.83 
 
 
227 aa  80.1  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  33.62 
 
 
455 aa  79.3  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2977  hypothetical protein  35.12 
 
 
195 aa  75.5  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000274563  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4967  hypothetical protein  38.32 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.48 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3415  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  36 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.96 
 
 
204 aa  71.2  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2037  hypothetical protein  33.19 
 
 
222 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0186754  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0903  hypothetical protein  24.89 
 
 
216 aa  67.8  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.631928  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3029  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.33 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.098074  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  28.83 
 
 
197 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0530  hypothetical protein  31.6 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0199  hypothetical protein  34.23 
 
 
213 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182952  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13070  uncharacterized MobA-like protein  33.65 
 
 
194 aa  65.1  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5126  hypothetical protein  33.33 
 
 
184 aa  63.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2928  hypothetical protein  41.41 
 
 
210 aa  62.8  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.796136  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3196  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  31.33 
 
 
211 aa  62.8  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.75 
 
 
202 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.39 
 
 
208 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  27.39 
 
 
208 aa  58.9  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  42.22 
 
 
191 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  42.22 
 
 
192 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  33.94 
 
 
544 aa  56.6  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2617  hypothetical protein  39.8 
 
 
196 aa  56.2  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  34.63 
 
 
546 aa  56.2  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.25 
 
 
533 aa  55.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  38.54 
 
 
534 aa  55.5  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  21.82 
 
 
190 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  29.63 
 
 
211 aa  55.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2658  hypothetical protein  35.71 
 
 
197 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421379  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1554  metal dependent phosphohydrolase  30.83 
 
 
370 aa  54.3  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.307535  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.15 
 
 
539 aa  53.5  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2921  hypothetical protein  33.88 
 
 
216 aa  53.1  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.627898 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.24 
 
 
533 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  27.63 
 
 
205 aa  53.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  36.36 
 
 
199 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3203  hypothetical protein  39.02 
 
 
197 aa  52.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.950597  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4787  hypothetical protein  43.75 
 
 
175 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171606  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  20 
 
 
195 aa  51.6  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2068  hypothetical protein  32.37 
 
 
189 aa  50.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2979  hypothetical protein  37.8 
 
 
197 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.220075 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2392  hypothetical protein  31.37 
 
 
207 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2648  molybdenum cofactor biosynthesis protein  29 
 
 
213 aa  50.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  27.83 
 
 
210 aa  50.1  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  26.56 
 
 
389 aa  50.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  30.13 
 
 
367 aa  49.7  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1224  MobA-like protein-like protein  21.53 
 
 
201 aa  49.7  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.607114  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  26.87 
 
 
216 aa  49.7  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0225  hypothetical protein  32.44 
 
 
197 aa  49.3  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.633552  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  30.13 
 
 
534 aa  49.7  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.97 
 
 
534 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  29.82 
 
 
591 aa  48.5  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4310  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  43 
 
 
228 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.707183  normal  0.580614 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  24.22 
 
 
198 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.23 
 
 
533 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  29.6 
 
 
188 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2712  MobA-like protein-like  20.74 
 
 
208 aa  48.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0203  hypothetical protein  29.83 
 
 
203 aa  47.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.761699  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.73 
 
 
208 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1816  hypothetical protein  25 
 
 
200 aa  47.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0825  MobA-like protein-like protein  30.57 
 
 
196 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207801  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1484  hypothetical protein  38.28 
 
 
201 aa  47  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205253  normal  0.364405 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2489  hypothetical protein  34.82 
 
 
192 aa  47  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.152259  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1662  hypothetical protein  36.02 
 
 
181 aa  47  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2205  hypothetical protein  25.96 
 
 
242 aa  46.6  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2410  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.25 
 
 
194 aa  46.2  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  38.46 
 
 
539 aa  46.2  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1584  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein MobA  27.23 
 
 
219 aa  45.8  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.105133  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0317  hypothetical protein  34.25 
 
 
207 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.449595  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0328  hypothetical protein  34.25 
 
 
207 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  38.46 
 
 
534 aa  45.8  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0201  hypothetical protein  50 
 
 
202 aa  45.8  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1312  hypothetical protein  43.48 
 
 
181 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0306  hypothetical protein  32.88 
 
 
206 aa  45.4  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  23.11 
 
 
199 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1300  hypothetical protein  41.46 
 
 
181 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0119759  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0984  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.91 
 
 
197 aa  45.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0360339  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.56 
 
 
194 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5193  hypothetical protein  31.82 
 
 
211 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1283  hypothetical protein  41.46 
 
 
181 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260926  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4770  molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.73 
 
 
174 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3547  MobA-like protein-like  30.04 
 
 
384 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871069  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2512  hypothetical protein  33.33 
 
 
221 aa  43.9  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.34 
 
 
197 aa  43.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.134734 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  32.29 
 
 
200 aa  43.1  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2799  hypothetical protein  31.46 
 
 
189 aa  42.7  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  25.96 
 
 
202 aa  42.7  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  29.52 
 
 
538 aa  42.4  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2695  hypothetical protein  26.61 
 
 
202 aa  42.4  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0332984  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0838  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  31.62 
 
 
266 aa  42  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.250726  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>