191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4967 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4967  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  369  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0199  hypothetical protein  56.68 
 
 
213 aa  141  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182952  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4741  hypothetical protein  51.5 
 
 
213 aa  139  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  51.09 
 
 
210 aa  138  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5126  hypothetical protein  52.72 
 
 
184 aa  137  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  46.52 
 
 
193 aa  122  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13070  uncharacterized MobA-like protein  47.4 
 
 
194 aa  122  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2977  hypothetical protein  48.28 
 
 
195 aa  122  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000274563  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3203  hypothetical protein  44.97 
 
 
197 aa  112  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.950597  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3976  hypothetical protein  46.49 
 
 
185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2846  hypothetical protein  44.32 
 
 
193 aa  111  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449385  decreased coverage  0.00911048 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  43.01 
 
 
195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1881  hypothetical protein  47.57 
 
 
200 aa  107  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2979  hypothetical protein  43.2 
 
 
197 aa  105  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.220075 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3415  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  43.62 
 
 
191 aa  101  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  40.22 
 
 
211 aa  100  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4770  molybdenum cofactor biosynthesis protein  45.71 
 
 
174 aa  100  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  40.82 
 
 
212 aa  97.4  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3196  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  43.65 
 
 
211 aa  93.6  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2799  hypothetical protein  42.47 
 
 
189 aa  89  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  38.8 
 
 
214 aa  87.4  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3029  molybdenum cofactor biosynthesis protein  41.21 
 
 
203 aa  84  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.098074  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.51 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  33.51 
 
 
208 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0328  hypothetical protein  37.25 
 
 
227 aa  82.4  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  39.25 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  31.75 
 
 
204 aa  81.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  29.81 
 
 
190 aa  80.9  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1662  hypothetical protein  38.67 
 
 
181 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  33.88 
 
 
367 aa  79.3  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4204  MobA-like protein-like protein  29.11 
 
 
204 aa  79  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212178  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.22 
 
 
202 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1827  hypothetical protein  40.22 
 
 
195 aa  77.8  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.563205  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  37.77 
 
 
455 aa  77.8  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4310  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  35.35 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.707183  normal  0.580614 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1283  hypothetical protein  37.1 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260926  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  40.32 
 
 
538 aa  76.3  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1300  hypothetical protein  37.1 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0119759  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  38.71 
 
 
191 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  35.2 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.23 
 
 
207 aa  74.7  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  35.45 
 
 
544 aa  74.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.55 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  29.38 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2037  hypothetical protein  33.33 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0186754  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  32.8 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1689  hypothetical protein  41.62 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0654906  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  35.42 
 
 
199 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  34.34 
 
 
216 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2964  hypothetical protein  36.9 
 
 
196 aa  70.5  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  34.21 
 
 
534 aa  70.1  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  37.17 
 
 
534 aa  69.7  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4787  hypothetical protein  34.25 
 
 
175 aa  68.2  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171606  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  34.74 
 
 
534 aa  67.8  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  37.06 
 
 
201 aa  67.4  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.26 
 
 
204 aa  67.8  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.7 
 
 
534 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.78 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.9 
 
 
538 aa  66.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2658  hypothetical protein  34.3 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421379  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.56 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  38.04 
 
 
546 aa  64.7  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2392  hypothetical protein  31.45 
 
 
207 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
591 aa  63.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1312  hypothetical protein  36.02 
 
 
181 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.74 
 
 
533 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0358  hypothetical protein  32.8 
 
 
198 aa  62.8  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2648  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.77 
 
 
213 aa  62.8  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.3 
 
 
197 aa  63.2  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2068  hypothetical protein  35.45 
 
 
189 aa  62.8  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6199  hypothetical protein  35.51 
 
 
251 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.326394  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  33.85 
 
 
205 aa  62.4  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0903  hypothetical protein  31.48 
 
 
216 aa  62.4  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.631928  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2512  hypothetical protein  28.89 
 
 
221 aa  62  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.86 
 
 
539 aa  62  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.87 
 
 
533 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1989  hypothetical protein  39.26 
 
 
208 aa  61.6  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0724  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  30.08 
 
 
195 aa  61.6  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3796  hypothetical protein  36.02 
 
 
185 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328726  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  32.97 
 
 
191 aa  61.6  0.000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  22.1 
 
 
195 aa  60.5  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0984  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  39.47 
 
 
197 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0360339  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.27 
 
 
197 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.134734 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1563  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein  30 
 
 
192 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  39.66 
 
 
203 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  37.8 
 
 
188 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1554  metal dependent phosphohydrolase  32.37 
 
 
370 aa  58.5  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.307535  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2410  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.97 
 
 
194 aa  58.5  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1634  MobA-like protein  39.63 
 
 
188 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  34.55 
 
 
575 aa  58.5  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2617  hypothetical protein  33.52 
 
 
196 aa  58.2  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0203  hypothetical protein  33.33 
 
 
203 aa  57  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.761699  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0836  hypothetical protein  33.8 
 
 
196 aa  57.8  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2695  hypothetical protein  32.98 
 
 
202 aa  57.4  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0332984  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4656  hypothetical protein  35.03 
 
 
203 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720744  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0815  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  22.22 
 
 
192 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4230  hypothetical protein  39.02 
 
 
188 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0123  MobA-like protein  33.51 
 
 
190 aa  56.6  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.14106  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1745  hypothetical protein  40.86 
 
 
185 aa  56.6  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1188  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.86 
 
 
197 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143953  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>