More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2140 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  100 
 
 
202 aa  403  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  58.64 
 
 
216 aa  218  3.9999999999999997e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  43.92 
 
 
208 aa  153  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  42.93 
 
 
194 aa  152  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  43.52 
 
 
455 aa  148  6e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  42.71 
 
 
534 aa  139  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  40.4 
 
 
204 aa  139  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  41.88 
 
 
533 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  42.47 
 
 
211 aa  136  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  42.78 
 
 
533 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2205  hypothetical protein  33.33 
 
 
242 aa  135  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  43.32 
 
 
534 aa  134  8e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  40.93 
 
 
534 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0825  MobA-like protein-like protein  45.55 
 
 
196 aa  132  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207801  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  39.09 
 
 
202 aa  132  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  42.25 
 
 
534 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  40.93 
 
 
539 aa  129  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  42.93 
 
 
210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3029  molybdenum cofactor biosynthesis protein  39.09 
 
 
203 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.098074  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  41.88 
 
 
207 aa  123  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  36.08 
 
 
389 aa  121  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  38.92 
 
 
204 aa  121  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  42.47 
 
 
533 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2037  hypothetical protein  35.71 
 
 
222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0186754  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  39.67 
 
 
575 aa  119  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.42 
 
 
197 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  34.74 
 
 
190 aa  117  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  43.85 
 
 
538 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  36.9 
 
 
214 aa  113  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  42.71 
 
 
539 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1006  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 
373 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  40.76 
 
 
544 aa  111  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  40.5 
 
 
546 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  33.33 
 
 
199 aa  108  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1816  hypothetical protein  36.13 
 
 
200 aa  106  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  34.9 
 
 
198 aa  105  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  37.89 
 
 
205 aa  105  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1188  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  41.15 
 
 
197 aa  105  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143953  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0036  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  35.75 
 
 
225 aa  104  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  40.62 
 
 
197 aa  104  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.134734 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1467  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  31.58 
 
 
368 aa  104  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700168  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  30.73 
 
 
195 aa  103  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1545  metal dependent phosphohydrolase  36.51 
 
 
393 aa  104  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4204  MobA-like protein-like protein  32.11 
 
 
204 aa  103  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212178  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3547  MobA-like protein-like  37.63 
 
 
384 aa  101  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871069  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  36.92 
 
 
367 aa  101  7e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.05 
 
 
189 aa  100  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2695  hypothetical protein  34.16 
 
 
202 aa  100  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0332984  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.1 
 
 
538 aa  98.6  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0203  hypothetical protein  36.6 
 
 
203 aa  96.7  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.761699  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3432  metal dependent phosphohydrolase  33.68 
 
 
408 aa  96.7  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  35.05 
 
 
197 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0984  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  40.62 
 
 
197 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0360339  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.32 
 
 
210 aa  94.4  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  35.91 
 
 
187 aa  94.4  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  35.98 
 
 
187 aa  93.2  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  35.08 
 
 
200 aa  93.6  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  40.43 
 
 
203 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2648  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.8 
 
 
213 aa  92.4  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.98 
 
 
193 aa  92  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3453  metal dependent phosphohydrolase  32.18 
 
 
216 aa  92  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  32.65 
 
 
208 aa  92  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  33.16 
 
 
201 aa  92  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1881  hypothetical protein  37.44 
 
 
200 aa  91.7  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5450  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  40.31 
 
 
201 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2410  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.66 
 
 
194 aa  91.3  9e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1079  molybdopterin biosynthesis enzyme  33.33 
 
 
218 aa  90.5  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.65 
 
 
208 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0836  hypothetical protein  31.58 
 
 
196 aa  90.5  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0225  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  89.4  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.633552  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1746  hypothetical protein  34.19 
 
 
191 aa  89.7  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  31.75 
 
 
591 aa  89.7  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  33.85 
 
 
212 aa  88.6  5e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0530  hypothetical protein  34.01 
 
 
207 aa  86.7  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10376  hypothetical protein  32.14 
 
 
197 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000126755  normal  0.572936 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1816  metal dependent phosphohydrolase  33.16 
 
 
372 aa  86.3  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4741  hypothetical protein  38.29 
 
 
213 aa  85.9  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  33.69 
 
 
191 aa  85.5  4e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6027  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.76 
 
 
207 aa  85.5  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1554  metal dependent phosphohydrolase  32.29 
 
 
370 aa  85.1  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.307535  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2512  hypothetical protein  28.57 
 
 
221 aa  85.1  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1757  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.38 
 
 
199 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0903  hypothetical protein  33.99 
 
 
216 aa  83.6  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.631928  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  34.2 
 
 
195 aa  82.8  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1745  hypothetical protein  32.18 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0328  hypothetical protein  38.1 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0317  hypothetical protein  38.1 
 
 
207 aa  82  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.449595  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2617  hypothetical protein  31.79 
 
 
196 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0243  MobA-like protein  30.3 
 
 
216 aa  82  0.000000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00192406  normal  0.367058 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0228  uncharacterized MobA-related protein  31.11 
 
 
363 aa  81.6  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1224  MobA-like protein-like protein  27.46 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.607114  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1381  MobA-like protein  32.67 
 
 
293 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.223593  normal  0.271333 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0306  hypothetical protein  37.57 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0793  hypothetical protein  34.24 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1779  hypothetical protein  34.44 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0199  hypothetical protein  35.26 
 
 
213 aa  79  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182952  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  35.26 
 
 
192 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  34.03 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1582  metal dependent phosphohydrolase  30.98 
 
 
459 aa  77.8  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2091  molybdopterin binding protein  37.57 
 
 
202 aa  77  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.865191  normal  0.570459 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>