294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0710 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  418  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  41.49 
 
 
199 aa  159  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  40.11 
 
 
190 aa  151  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  40.54 
 
 
204 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  41.75 
 
 
205 aa  138  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  42.47 
 
 
202 aa  136  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0306  hypothetical protein  45.45 
 
 
206 aa  134  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0328  hypothetical protein  45.45 
 
 
207 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4204  MobA-like protein-like protein  33.33 
 
 
204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212178  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0317  hypothetical protein  45.45 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.449595  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  39.89 
 
 
198 aa  131  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  40.38 
 
 
455 aa  129  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  39.29 
 
 
539 aa  122  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  42.79 
 
 
534 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1745  hypothetical protein  38.37 
 
 
185 aa  118  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  42.71 
 
 
533 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  41.62 
 
 
210 aa  112  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  42.19 
 
 
534 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  42.7 
 
 
533 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.34 
 
 
194 aa  108  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.28 
 
 
208 aa  107  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  41.27 
 
 
544 aa  106  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  38.17 
 
 
216 aa  105  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13070  uncharacterized MobA-like protein  38.42 
 
 
194 aa  100  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  38.42 
 
 
534 aa  99.8  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.17 
 
 
202 aa  99.8  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.17 
 
 
204 aa  99.8  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  39.36 
 
 
538 aa  99.4  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2695  hypothetical protein  33.86 
 
 
202 aa  99  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0332984  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  39.04 
 
 
538 aa  98.6  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0825  MobA-like protein-like protein  40.32 
 
 
196 aa  96.3  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207801  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4967  hypothetical protein  40.22 
 
 
193 aa  95.1  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3029  molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.72 
 
 
203 aa  95.1  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.098074  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.5 
 
 
210 aa  94.7  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.48 
 
 
197 aa  94  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0203  hypothetical protein  37.43 
 
 
203 aa  92.8  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.761699  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.42 
 
 
207 aa  93.2  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2846  hypothetical protein  40.74 
 
 
193 aa  92.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449385  decreased coverage  0.00911048 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  36.19 
 
 
546 aa  92.4  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  41.62 
 
 
533 aa  91.7  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4741  hypothetical protein  38.98 
 
 
213 aa  91.7  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2977  hypothetical protein  38.67 
 
 
195 aa  91.3  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000274563  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  38.38 
 
 
534 aa  91.3  9e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  26.8 
 
 
195 aa  90.9  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  40.21 
 
 
197 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.134734 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1079  molybdopterin biosynthesis enzyme  35 
 
 
218 aa  90.1  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  36.82 
 
 
212 aa  90.5  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2824  hypothetical protein  31.05 
 
 
245 aa  89.4  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0559762 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2748  hypothetical protein  31.05 
 
 
245 aa  89.4  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.668199  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2731  hypothetical protein  31.36 
 
 
245 aa  89  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1628  hypothetical protein  31.05 
 
 
245 aa  89  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00936248 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  34.34 
 
 
200 aa  88.6  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.74 
 
 
189 aa  88.2  8e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
389 aa  87.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  37.63 
 
 
201 aa  86.3  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1188  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  42.33 
 
 
197 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143953  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.14 
 
 
203 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0199  hypothetical protein  34.74 
 
 
213 aa  85.5  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182952  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  34.95 
 
 
575 aa  84.7  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6027  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.14 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3215  hypothetical protein  40.62 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1413  hypothetical protein  31.96 
 
 
202 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0598562  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3415  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  36.32 
 
 
191 aa  82  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2205  hypothetical protein  28.25 
 
 
242 aa  82  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0836  hypothetical protein  32.46 
 
 
196 aa  82  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2799  hypothetical protein  39.67 
 
 
189 aa  82  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2037  hypothetical protein  31.37 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0186754  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2426  hypothetical protein  30.52 
 
 
221 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.17 
 
 
193 aa  81.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  31.55 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2712  MobA-like protein-like  29.74 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0036  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  34.54 
 
 
225 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2512  hypothetical protein  28.43 
 
 
221 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1881  hypothetical protein  37.5 
 
 
200 aa  79.7  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0214  hypothetical protein  37.44 
 
 
220 aa  79.7  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  30.85 
 
 
187 aa  79.3  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3050  hypothetical protein  31.82 
 
 
229 aa  79  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4656  hypothetical protein  35.94 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720744  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.46 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  30.81 
 
 
367 aa  78.2  0.00000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  40.74 
 
 
539 aa  78.2  0.00000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5450  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  45.28 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1989  hypothetical protein  33.16 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  32.46 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0225  hypothetical protein  33.16 
 
 
197 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.633552  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3976  hypothetical protein  37.84 
 
 
185 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326622  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0328  hypothetical protein  31.84 
 
 
227 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1438  hypothetical protein  31.67 
 
 
228 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5614  hypothetical protein  36.42 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  34.15 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0123  MobA-like protein  36.22 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.14106  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  36.79 
 
 
195 aa  76.3  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3300  hypothetical protein  38.54 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20416  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1805  MobA-like protein-like  31.44 
 
 
243 aa  75.5  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.16103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1495  hypothetical protein  29.65 
 
 
234 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  34.95 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0984  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.69 
 
 
197 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0360339  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1757  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  39.18 
 
 
199 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4310  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  31.16 
 
 
228 aa  73.2  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.707183  normal  0.580614 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0279  hypothetical protein  26.24 
 
 
218 aa  72.4  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>