223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5429 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  419  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1745  hypothetical protein  43.72 
 
 
185 aa  159  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  41.45 
 
 
190 aa  152  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  39.68 
 
 
199 aa  139  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4204  MobA-like protein-like protein  38.54 
 
 
204 aa  138  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212178  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  41.75 
 
 
211 aa  138  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  42.19 
 
 
204 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  44.62 
 
 
198 aa  132  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.11 
 
 
533 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  37.95 
 
 
534 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.11 
 
 
533 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  38.66 
 
 
455 aa  112  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.04 
 
 
534 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.89 
 
 
202 aa  105  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.36 
 
 
533 aa  101  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  35.94 
 
 
534 aa  100  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.1 
 
 
538 aa  99.8  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  34.18 
 
 
200 aa  99.8  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  36.36 
 
 
544 aa  98.6  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.5 
 
 
203 aa  98.2  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  35.71 
 
 
216 aa  97.4  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.26 
 
 
202 aa  97.4  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  31.73 
 
 
210 aa  97.1  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.85 
 
 
194 aa  95.9  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4656  hypothetical protein  35.94 
 
 
203 aa  95.9  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720744  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.52 
 
 
539 aa  95.5  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0306  hypothetical protein  37.31 
 
 
206 aa  95.5  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1628  hypothetical protein  31.82 
 
 
245 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00936248 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2731  hypothetical protein  31.82 
 
 
245 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  34.04 
 
 
534 aa  93.6  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  37.77 
 
 
538 aa  93.2  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.41 
 
 
197 aa  93.6  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0328  hypothetical protein  37.31 
 
 
207 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.65 
 
 
208 aa  92.8  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0317  hypothetical protein  37.31 
 
 
207 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.449595  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  31.79 
 
 
575 aa  92  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2748  hypothetical protein  31.36 
 
 
245 aa  91.7  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.668199  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2824  hypothetical protein  31.36 
 
 
245 aa  91.7  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0559762 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0984  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  41.18 
 
 
197 aa  91.7  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0360339  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2695  hypothetical protein  31.66 
 
 
202 aa  89.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0332984  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6027  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.51 
 
 
207 aa  89.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.54 
 
 
197 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.134734 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.36 
 
 
210 aa  89.7  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  33.5 
 
 
546 aa  89  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  32.14 
 
 
214 aa  87.4  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1989  hypothetical protein  35.11 
 
 
208 aa  85.1  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2512  hypothetical protein  32.5 
 
 
221 aa  84.7  9e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0825  MobA-like protein-like protein  41.1 
 
 
196 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207801  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2426  hypothetical protein  30.84 
 
 
221 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3415  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  36.16 
 
 
191 aa  81.3  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1467  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  27.18 
 
 
368 aa  81.3  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700168  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3029  molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.63 
 
 
203 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.098074  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.9 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  29.9 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.35 
 
 
189 aa  80.1  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1188  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.57 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143953  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1757  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  39.02 
 
 
199 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1438  hypothetical protein  27.73 
 
 
228 aa  79  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2977  hypothetical protein  35.68 
 
 
195 aa  75.9  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000274563  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1495  hypothetical protein  27.23 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0036  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  29.63 
 
 
225 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5614  hypothetical protein  32.76 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  32.71 
 
 
212 aa  74.7  0.0000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0279  hypothetical protein  30.36 
 
 
218 aa  73.9  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2037  hypothetical protein  31.09 
 
 
222 aa  74.3  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0186754  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5450  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  40.57 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0214  hypothetical protein  32.83 
 
 
220 aa  73.6  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.84 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13070  uncharacterized MobA-like protein  35.53 
 
 
194 aa  72.4  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2410  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.54 
 
 
194 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3050  hypothetical protein  27.85 
 
 
229 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2712  MobA-like protein-like  29.63 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1413  hypothetical protein  31.84 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0598562  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3547  MobA-like protein-like  30.41 
 
 
384 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871069  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1484  hypothetical protein  32.81 
 
 
201 aa  70.1  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205253  normal  0.364405 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  31.61 
 
 
188 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  29.02 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3196  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  33.83 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0903  hypothetical protein  32.12 
 
 
216 aa  69.3  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.631928  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2489  hypothetical protein  28.27 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.152259  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  26.73 
 
 
195 aa  67.4  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02165  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  28.63 
 
 
289 aa  67  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.892695  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1433  hypothetical protein  32.11 
 
 
208 aa  67  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.170444 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0921  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  32.64 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.370175  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1816  metal dependent phosphohydrolase  29.79 
 
 
372 aa  66.6  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2846  hypothetical protein  36.73 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449385  decreased coverage  0.00911048 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4230  hypothetical protein  32.47 
 
 
188 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0199  hypothetical protein  40 
 
 
213 aa  65.1  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182952  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  32.47 
 
 
195 aa  64.7  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1816  hypothetical protein  31.05 
 
 
200 aa  64.3  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.02 
 
 
193 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1554  metal dependent phosphohydrolase  29.88 
 
 
370 aa  63.9  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.307535  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1634  MobA-like protein  31.96 
 
 
188 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4741  hypothetical protein  30.86 
 
 
213 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3215  hypothetical protein  33.84 
 
 
201 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1381  MobA-like protein  27.84 
 
 
293 aa  60.8  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.223593  normal  0.271333 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3105  hypothetical protein  35.9 
 
 
201 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.247192  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  28.5 
 
 
389 aa  60.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  29.74 
 
 
192 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  34.2 
 
 
539 aa  60.8  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>