More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1757 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1757  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  100 
 
 
199 aa  366  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5450  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  71.72 
 
 
201 aa  216  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  64.95 
 
 
203 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  58.2 
 
 
197 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.134734 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0984  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  60.53 
 
 
197 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0360339  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1188  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  58.73 
 
 
197 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143953  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  48.48 
 
 
202 aa  162  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  45.99 
 
 
539 aa  134  9e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  46.94 
 
 
534 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  45.13 
 
 
533 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  45.64 
 
 
534 aa  129  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  44.1 
 
 
533 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  47.24 
 
 
538 aa  127  9.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  45.6 
 
 
534 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  42.71 
 
 
534 aa  123  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  46.52 
 
 
455 aa  120  9e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  46.23 
 
 
538 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  42.57 
 
 
210 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  46.63 
 
 
546 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  41.71 
 
 
214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  42.33 
 
 
194 aa  116  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  41.62 
 
 
544 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4656  hypothetical protein  42.57 
 
 
203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720744  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  42.56 
 
 
533 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  41.05 
 
 
208 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  38.95 
 
 
575 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6027  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  42.08 
 
 
207 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  41.67 
 
 
539 aa  94.7  8e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  39.02 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  44.44 
 
 
191 aa  93.2  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  37.77 
 
 
200 aa  93.2  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  38.38 
 
 
202 aa  92.4  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  42.08 
 
 
187 aa  89.7  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  43.09 
 
 
207 aa  89.4  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  38.78 
 
 
211 aa  89.4  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.45 
 
 
197 aa  89  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2205  hypothetical protein  30.56 
 
 
242 aa  89.4  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  37.31 
 
 
216 aa  88.6  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1079  molybdopterin biosynthesis enzyme  37.68 
 
 
218 aa  88.2  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  41.03 
 
 
201 aa  87.8  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0825  MobA-like protein-like protein  42.71 
 
 
196 aa  84.7  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207801  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5614  hypothetical protein  37.7 
 
 
185 aa  84  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0123  MobA-like protein  46.03 
 
 
190 aa  82.8  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.14106  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0036  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  36.41 
 
 
225 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.79 
 
 
210 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4167  hypothetical protein  38.54 
 
 
198 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0348908  normal  0.0855326 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.63 
 
 
189 aa  79.3  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.85 
 
 
204 aa  79  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  30.27 
 
 
190 aa  77.8  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3796  hypothetical protein  38.14 
 
 
185 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328726  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  31.91 
 
 
199 aa  77.4  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1779  hypothetical protein  40 
 
 
186 aa  77.8  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  29.53 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  38 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2410  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.53 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  36.55 
 
 
197 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2489  hypothetical protein  36.84 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.152259  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  33.5 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.5 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1467  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  27.67 
 
 
368 aa  73.6  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700168  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4230  hypothetical protein  35.57 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05439  hypothetical protein  40.2 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232404  normal  0.0351098 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0793  hypothetical protein  38.07 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2695  hypothetical protein  33.87 
 
 
202 aa  72.8  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0332984  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1634  MobA-like protein  35.57 
 
 
188 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0306  hypothetical protein  43.79 
 
 
206 aa  72  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0328  hypothetical protein  43.53 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3725  hypothetical protein  38.42 
 
 
198 aa  71.2  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0317  hypothetical protein  43.53 
 
 
207 aa  71.2  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.449595  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4802  hypothetical protein  38.42 
 
 
198 aa  71.2  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394051  normal  0.300169 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  33.51 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  34.38 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.04 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  32.65 
 
 
389 aa  70.5  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0921  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  42.5 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.370175  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4741  hypothetical protein  39.66 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2091  molybdopterin binding protein  32.64 
 
 
202 aa  70.1  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.865191  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  35.23 
 
 
367 aa  69.7  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1881  hypothetical protein  36.84 
 
 
200 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  40.31 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1554  metal dependent phosphohydrolase  31.41 
 
 
370 aa  69.3  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.307535  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2977  hypothetical protein  36.07 
 
 
195 aa  69.3  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000274563  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0214  hypothetical protein  40.5 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5992  hypothetical protein  37.11 
 
 
195 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.361176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2846  hypothetical protein  37.57 
 
 
193 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449385  decreased coverage  0.00911048 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  33.16 
 
 
591 aa  67.8  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1662  hypothetical protein  36.46 
 
 
181 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  38.5 
 
 
195 aa  67  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  30.2 
 
 
187 aa  67  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4726  hypothetical protein  35.75 
 
 
195 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.048995 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3453  metal dependent phosphohydrolase  28.07 
 
 
216 aa  65.9  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  33.68 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0903  hypothetical protein  28.71 
 
 
216 aa  65.5  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.631928  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0530  hypothetical protein  33.33 
 
 
207 aa  64.7  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0199  hypothetical protein  41.4 
 
 
213 aa  64.7  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182952  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1006  metal dependent phosphohydrolase  32.47 
 
 
373 aa  64.3  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3555  hypothetical protein  32.47 
 
 
182 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.919996  normal  0.404 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2928  hypothetical protein  36 
 
 
210 aa  64.3  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.796136  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0890  uncharacterized MobA-related protein  37.89 
 
 
194 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.28742  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2227  hypothetical protein  37.63 
 
 
195 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>