157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0199 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0199  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182952  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  51.87 
 
 		 210 aa  141  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4967  hypothetical protein  56.68 
 
 		 193 aa  134  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13070  uncharacterized MobA-like protein  49.15 
 
 		 194 aa  127  9.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5126  hypothetical protein  54.59 
 
 		 184 aa  125  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2846  hypothetical protein  49.72 
 
 		 193 aa  124  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449385  decreased coverage  0.00911048 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  45.5 
 
 		 193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3203  hypothetical protein  47.37 
 
 		 197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.950597  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2979  hypothetical protein  46.78 
 
 		 197 aa  117  9e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.220075 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3976  hypothetical protein  51.89 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326622  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2977  hypothetical protein  45.56 
 
 		 195 aa  111  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000274563  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  46.52 
 
 		 195 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  39.58 
 
 		 212 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3415  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  42.86 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1881  hypothetical protein  44.92 
 
 		 200 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2799  hypothetical protein  45.21 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4770  molybdenum cofactor biosynthesis protein  45.45 
 
 		 174 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  42.11 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0328  hypothetical protein  41.35 
 
 		 227 aa  99.8  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4741  hypothetical protein  44.19 
 
 		 213 aa  99  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3196  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  38.5 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  39.29 
 
 		 192 aa  92  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  35.26 
 
 		 211 aa  91.7  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  33.15 
 
 		 204 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.26 
 
 		 202 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1283  hypothetical protein  43.09 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260926  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1300  hypothetical protein  43.09 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0119759  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.22 
 
 		 539 aa  82.8  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  31.06 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  33.85 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  35.38 
 
 		 216 aa  81.3  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  38.78 
 
 		 191 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0984  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  40.31 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0360339  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.38 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.9 
 
 		 533 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  34.2 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.85 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.38 
 
 		 533 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  34.25 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  34.76 
 
 		 455 aa  75.9  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1827  hypothetical protein  42.11 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.563205  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.57 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  35.29 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  35.38 
 
 		 534 aa  75.1  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  40 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.5 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  34.69 
 
 		 534 aa  73.2  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  27.68 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  39.15 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4310  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  34.74 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.707183  normal  0.580614 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  36.84 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1312  hypothetical protein  40.88 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5450  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  39.56 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2392  hypothetical protein  32.43 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1188  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.02 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  36.6 
 
 		 538 aa  69.3  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2068  hypothetical protein  37.71 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0836  hypothetical protein  34.41 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.54 
 
 		 534 aa  68.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  35.45 
 
 		 575 aa  68.6  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.43 
 
 		 538 aa  67.8  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  34.69 
 
 		 534 aa  66.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1745  hypothetical protein  31.58 
 
 		 185 aa  67  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  34.02 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1689  hypothetical protein  37.56 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0654906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  40.29 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.02 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.134734 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6199  hypothetical protein  34.23 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.326394  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1224  MobA-like protein-like protein  22.58 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.607114  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2512  hypothetical protein  28.42 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2658  hypothetical protein  34.09 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421379  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  32.34 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  34.33 
 
 		 544 aa  62.4  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  35.81 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  29.31 
 
 		 187 aa  62  0.000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2964  hypothetical protein  36.7 
 
 		 196 aa  62  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1662  hypothetical protein  39.33 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.14 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.82 
 
 		 533 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4787  hypothetical protein  35.91 
 
 		 175 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.72 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3547  MobA-like protein-like  33.33 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871069  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.9 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0123  MobA-like protein  38.92 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.14106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  31.38 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  41.96 
 
 		 546 aa  59.3  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1779  hypothetical protein  38.24 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1757  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.51 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2648  molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.74 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2037  hypothetical protein  35.67 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0186754  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3432  metal dependent phosphohydrolase  28.86 
 
 		 408 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0903  hypothetical protein  31.07 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.631928  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10350  hypothetical protein  40 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0317  hypothetical protein  42.86 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.449595  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0530  hypothetical protein  30 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  21.16 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0328  hypothetical protein  42.86 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3796  hypothetical protein  32.8 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328726  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0793  hypothetical protein  36.43 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6027  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.52 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>