30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10350 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10350  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  263  5e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2964  hypothetical protein  52.99 
 
 
196 aa  98.6  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1662  hypothetical protein  51.77 
 
 
181 aa  92  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4787  hypothetical protein  55.56 
 
 
175 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171606  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1283  hypothetical protein  52.94 
 
 
181 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260926  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1300  hypothetical protein  52.94 
 
 
181 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0119759  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1827  hypothetical protein  49.07 
 
 
195 aa  79.7  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.563205  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5126  hypothetical protein  44.85 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  42.48 
 
 
193 aa  72  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2799  hypothetical protein  40.17 
 
 
189 aa  70.9  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1312  hypothetical protein  49.26 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13070  uncharacterized MobA-like protein  37.69 
 
 
194 aa  68.2  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3976  hypothetical protein  49.56 
 
 
185 aa  63.9  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326622  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1689  hypothetical protein  41.94 
 
 
225 aa  62  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0654906  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.61 
 
 
210 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3415  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  38.39 
 
 
191 aa  57  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0199  hypothetical protein  40 
 
 
213 aa  53.9  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182952  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1881  hypothetical protein  36.7 
 
 
200 aa  53.9  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2977  hypothetical protein  37.89 
 
 
195 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000274563  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4770  molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.74 
 
 
174 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2846  hypothetical protein  36.45 
 
 
193 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449385  decreased coverage  0.00911048 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3196  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  35.71 
 
 
211 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  31.65 
 
 
211 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4967  hypothetical protein  43.02 
 
 
193 aa  46.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  37.5 
 
 
195 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  33.33 
 
 
212 aa  46.2  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2068  hypothetical protein  33.08 
 
 
189 aa  45.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4741  hypothetical protein  38.37 
 
 
213 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0634  metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 
514 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0970853 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.33 
 
 
207 aa  40.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>