61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2964 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2964  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  376  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4787  hypothetical protein  53.37 
 
 		 175 aa  128  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1662  hypothetical protein  52.51 
 
 		 181 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1300  hypothetical protein  53.07 
 
 		 181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0119759  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1283  hypothetical protein  53.07 
 
 		 181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260926  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1312  hypothetical protein  51.96 
 
 		 181 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1827  hypothetical protein  43.92 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.563205  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10350  hypothetical protein  52.99 
 
 		 136 aa  98.6  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3976  hypothetical protein  44.62 
 
 		 185 aa  88.2  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326622  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5126  hypothetical protein  42 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  41.44 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2799  hypothetical protein  41.36 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2977  hypothetical protein  41.28 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000274563  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.46 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1881  hypothetical protein  40.74 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4741  hypothetical protein  43.36 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13070  uncharacterized MobA-like protein  40.22 
 
 		 194 aa  67.8  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4967  hypothetical protein  36.36 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  39.33 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4770  molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.81 
 
 		 174 aa  62  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2846  hypothetical protein  41.01 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449385  decreased coverage  0.00911048 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3432  metal dependent phosphohydrolase  29.35 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3415  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  35.83 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2068  hypothetical protein  42.25 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  36.9 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1545  metal dependent phosphohydrolase  28.39 
 
 		 393 aa  55.1  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  27.33 
 
 		 389 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0199  hypothetical protein  36.17 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182952  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.31 
 
 		 207 aa  51.6  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  29.41 
 
 		 190 aa  51.2  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3196  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  31.82 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  40.44 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  31.79 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1689  hypothetical protein  42.7 
 
 		 225 aa  49.3  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0654906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.5 
 
 		 204 aa  49.3  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0228  uncharacterized MobA-related protein  27.01 
 
 		 363 aa  47  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.1 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  27.69 
 
 		 199 aa  45.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  30.52 
 
 		 211 aa  45.1  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  34.78 
 
 		 367 aa  45.1  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2227  hypothetical protein  35.14 
 
 		 195 aa  44.7  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1620  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  36.6 
 
 		 199 aa  45.1  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1707  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  36.6 
 
 		 199 aa  45.1  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  29.23 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  29.93 
 
 		 591 aa  43.9  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0211  hypothetical protein  36.6 
 
 		 346 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0194719  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2037  hypothetical protein  31.39 
 
 		 222 aa  43.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0186754  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1816  metal dependent phosphohydrolase  30.41 
 
 		 372 aa  43.5  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4310  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  32.73 
 
 		 228 aa  42.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.707183  normal  0.580614 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.74 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.61 
 
 		 208 aa  42.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  28.34 
 
 		 216 aa  42.4  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0358  hypothetical protein  31.05 
 
 		 198 aa  42.4  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5992  hypothetical protein  36.91 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.361176 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.1 
 
 		 194 aa  42  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1199  hypothetical protein  37.25 
 
 		 199 aa  42.4  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570343  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.27 
 
 		 538 aa  42  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  30.77 
 
 		 200 aa  42  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1467  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  23.08 
 
 		 368 aa  42  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700168  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1006  metal dependent phosphohydrolase  28.03 
 
 		 373 aa  41.6  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1413  hypothetical protein  30.43 
 
 		 202 aa  41.2  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0598562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>