78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1827 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1827  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  372  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.563205  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1662  hypothetical protein  58.62 
 
 		 181 aa  163  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4787  hypothetical protein  56.18 
 
 		 175 aa  160  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1300  hypothetical protein  57.3 
 
 		 181 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0119759  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1283  hypothetical protein  57.3 
 
 		 181 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260926  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1312  hypothetical protein  55.62 
 
 		 181 aa  147  7e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3976  hypothetical protein  48.9 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326622  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2799  hypothetical protein  44.86 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2964  hypothetical protein  43.92 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5126  hypothetical protein  43.83 
 
 		 184 aa  95.9  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1881  hypothetical protein  42.54 
 
 		 200 aa  94.7  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4770  molybdenum cofactor biosynthesis protein  41.71 
 
 		 174 aa  93.2  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10350  hypothetical protein  48.65 
 
 		 136 aa  91.3  8e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13070  uncharacterized MobA-like protein  38.01 
 
 		 194 aa  90.5  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0199  hypothetical protein  39.06 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182952  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4967  hypothetical protein  36.96 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.7 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2846  hypothetical protein  39.33 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449385  decreased coverage  0.00911048 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3196  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  35.18 
 
 		 211 aa  71.2  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4741  hypothetical protein  37.58 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1689  hypothetical protein  38.92 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0654906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.33 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  31.07 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  35.29 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3203  hypothetical protein  33.93 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.950597  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  32.16 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.48 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  29.19 
 
 		 190 aa  62  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.95 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  30.12 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.8 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3415  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  36.56 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2977  hypothetical protein  32.75 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000274563  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2979  hypothetical protein  34.71 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.220075 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2068  hypothetical protein  40.15 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  33.68 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  34.57 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0328  hypothetical protein  31.66 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.24 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  25.15 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  36.36 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3029  molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.31 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.098074  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.82 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1188  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  40 
 
 		 197 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  40.57 
 
 		 197 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.134734 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1079  molybdopterin biosynthesis enzyme  32.61 
 
 		 218 aa  51.2  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4310  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  33.8 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.707183  normal  0.580614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  31.69 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  31.09 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25820  hypothetical protein  33.9 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.708466  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  31.68 
 
 		 198 aa  49.3  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  33.53 
 
 		 191 aa  48.9  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1381  MobA-like protein  33.86 
 
 		 293 aa  48.5  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.223593  normal  0.271333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0123  MobA-like protein  35.22 
 
 		 190 aa  48.5  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.14106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0921  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  39.39 
 
 		 200 aa  48.1  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.370175  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  31.64 
 
 		 534 aa  47.8  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  24.85 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2712  MobA-like protein-like  25 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  33.69 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  36.17 
 
 		 367 aa  47  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  31.52 
 
 		 544 aa  46.2  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0836  hypothetical protein  31.91 
 
 		 196 aa  45.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.76 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  32.31 
 
 		 538 aa  45.4  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0279  hypothetical protein  21.16 
 
 		 218 aa  45.4  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  31.07 
 
 		 455 aa  45.1  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  28.81 
 
 		 197 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  39.29 
 
 		 201 aa  44.7  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  30.43 
 
 		 534 aa  44.7  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2037  hypothetical protein  30.72 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0186754  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0984  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.99 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0360339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1757  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.36 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.73 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1484  hypothetical protein  32.94 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205253  normal  0.364405 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2489  hypothetical protein  33.33 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.152259  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  30.63 
 
 		 210 aa  42.4  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2617  hypothetical protein  31.75 
 
 		 196 aa  42  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05439  hypothetical protein  30 
 
 		 199 aa  41.6  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232404  normal  0.0351098 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>