152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1484 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1484  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  385  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205253  normal  0.364405 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0921  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  48.45 
 
 		 200 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.370175  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2928  hypothetical protein  52.33 
 
 		 199 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1573  hypothetical protein  52.85 
 
 		 199 aa  138  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0210508  normal  0.559729 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1433  hypothetical protein  39.78 
 
 		 208 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.170444 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2489  hypothetical protein  39.59 
 
 		 192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.152259  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  37.1 
 
 		 544 aa  98.2  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.75 
 
 		 539 aa  89.4  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.95 
 
 		 533 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  34.57 
 
 		 534 aa  88.6  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.41 
 
 		 533 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  36.32 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  33.33 
 
 		 534 aa  82.8  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.02 
 
 		 538 aa  82.8  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  35.52 
 
 		 575 aa  82.4  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  32.81 
 
 		 534 aa  82.4  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.16 
 
 		 534 aa  81.3  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.2 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  32.81 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1894  hypothetical protein  32.26 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  35.45 
 
 		 546 aa  77  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.89 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  36.55 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  33.51 
 
 		 538 aa  76.3  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4656  hypothetical protein  33.68 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.51 
 
 		 533 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  31.63 
 
 		 197 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0036  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  30.69 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  28.57 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  34.38 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0836  hypothetical protein  30.16 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  31.09 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.56 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  31.96 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0123  MobA-like protein  40.43 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.14106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.16 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  29.26 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0530  hypothetical protein  31.77 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.19 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0328  hypothetical protein  37.17 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0317  hypothetical protein  37.17 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.449595  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  34.59 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  24.48 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  30.1 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.19 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.08 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  34.02 
 
 		 539 aa  63.9  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  30 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0306  hypothetical protein  36.13 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1188  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.74 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0825  MobA-like protein-like protein  33.68 
 
 		 196 aa  62  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207801  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2695  hypothetical protein  31.55 
 
 		 202 aa  62  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0332984  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  34.59 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1079  molybdopterin biosynthesis enzyme  33.16 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0243  MobA-like protein  28.57 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00192406  normal  0.367058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4741  hypothetical protein  37.31 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1413  hypothetical protein  25.13 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0598562  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3029  molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.09 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.098074  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.26 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.134734 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2928  hypothetical protein  32.52 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.796136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0984  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.39 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0360339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  21.32 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0201  hypothetical protein  30.41 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1757  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.86 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  29.1 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  28.5 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3554  uncharacterized MobA-related protein  32.14 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4813  uncharacterized MobA-related protein  32.14 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.913909 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  25.39 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5470  uncharacterized MobA-related protein  32.14 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0663776 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3796  hypothetical protein  29.03 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328726  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2617  hypothetical protein  32.31 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.72 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0225  hypothetical protein  31.58 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.633552  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5450  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  40.78 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0890  uncharacterized MobA-related protein  29.79 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.28742  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2512  hypothetical protein  24.88 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0358  hypothetical protein  30.37 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1707  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  31.87 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1620  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  31.87 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2037  hypothetical protein  28.11 
 
 		 222 aa  52.4  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0186754  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1634  MobA-like protein  31.71 
 
 		 188 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2977  hypothetical protein  31.58 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000274563  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6027  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.73 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2951  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  27.23 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5614  hypothetical protein  31.76 
 
 		 185 aa  51.2  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0279  hypothetical protein  24.75 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4726  hypothetical protein  29.79 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.048995 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2846  hypothetical protein  30.53 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449385  decreased coverage  0.00911048 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4204  MobA-like protein-like protein  22.22 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212178  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10376  hypothetical protein  28.79 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000126755  normal  0.572936 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2068  hypothetical protein  37.21 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2921  hypothetical protein  35 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.627898 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4718  uncharacterized MobA-related protein-like protein  31.94 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819957 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4230  hypothetical protein  30.49 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0211  hypothetical protein  31.87 
 
 		 346 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0194719  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4167  hypothetical protein  31.66 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0348908  normal  0.0855326 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3976  hypothetical protein  35.33 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326622  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6199  hypothetical protein  42.57 
 
 		 251 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.326394  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  30.11 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>