164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1894 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1894  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  394  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4726  hypothetical protein  41.58 
 
 		 195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.048995 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4802  hypothetical protein  41.12 
 
 		 198 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394051  normal  0.300169 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3725  hypothetical protein  41.12 
 
 		 198 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5992  hypothetical protein  43.68 
 
 		 195 aa  125  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.361176 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0358  hypothetical protein  41.71 
 
 		 198 aa  125  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0201  hypothetical protein  44.02 
 
 		 202 aa  125  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2392  hypothetical protein  42.71 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2227  hypothetical protein  41.58 
 
 		 195 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05439  hypothetical protein  43.81 
 
 		 199 aa  119  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232404  normal  0.0351098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  39.8 
 
 		 199 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0211  hypothetical protein  43.55 
 
 		 346 aa  117  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0194719  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0890  uncharacterized MobA-related protein  43.46 
 
 		 194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.28742  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  43.39 
 
 		 192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1707  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  43.55 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1620  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  43.55 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3554  uncharacterized MobA-related protein  42.93 
 
 		 194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4195  MobA-like protein-like protein  42.41 
 
 		 194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4813  uncharacterized MobA-related protein  42.93 
 
 		 194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.913909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5470  uncharacterized MobA-related protein  42.93 
 
 		 194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0663776 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4718  uncharacterized MobA-related protein-like protein  42.41 
 
 		 194 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819957 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2617  hypothetical protein  41.18 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  40.11 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25820  hypothetical protein  40 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.708466  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3790  uncharacterized MobA-related protein  42.93 
 
 		 194 aa  108  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0141357 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  43.16 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2658  hypothetical protein  38.62 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421379  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1199  hypothetical protein  41 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570343  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0418  hypothetical protein  42.78 
 
 		 201 aa  104  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159486  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0123  MobA-like protein  44.51 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.14106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3796  hypothetical protein  36.76 
 
 		 185 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328726  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1634  MobA-like protein  39.25 
 
 		 188 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4230  hypothetical protein  38.71 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  39.01 
 
 		 197 aa  99  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0530  hypothetical protein  39.3 
 
 		 207 aa  98.2  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  38.86 
 
 		 201 aa  92.8  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4167  hypothetical protein  37.37 
 
 		 198 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0348908  normal  0.0855326 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3943  hypothetical protein  37.99 
 
 		 190 aa  89.4  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00148213  normal  0.123195 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4019  hypothetical protein  37.41 
 
 		 194 aa  87.8  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0410736 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  31.72 
 
 		 216 aa  86.7  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0793  hypothetical protein  35.87 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1779  hypothetical protein  35.16 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3712  hypothetical protein  33.51 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4015  hypothetical protein  35.26 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  33.88 
 
 		 575 aa  80.9  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.59 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.9 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3555  hypothetical protein  31.87 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.919996  normal  0.404 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2563  hypothetical protein  32.09 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.778302  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2928  hypothetical protein  32.82 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.796136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2921  hypothetical protein  32.99 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.627898 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  33.51 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.42 
 
 		 204 aa  72  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.05 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0867  hypothetical protein  39.82 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.69 
 
 		 533 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.72 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  29.65 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1881  hypothetical protein  36.61 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  34.04 
 
 		 546 aa  67.4  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2489  hypothetical protein  35.45 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.152259  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.05 
 
 		 534 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  30.37 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  25.54 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.37 
 
 		 539 aa  66.2  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1484  hypothetical protein  32.26 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205253  normal  0.364405 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  30.22 
 
 		 455 aa  65.5  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2698  hypothetical protein  31.87 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.57 
 
 		 533 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1224  MobA-like protein-like protein  21.35 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.607114  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.95 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.96 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1554  metal dependent phosphohydrolase  30.94 
 
 		 370 aa  62.8  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.307535  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  29.47 
 
 		 534 aa  62  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0921  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  30.81 
 
 		 200 aa  62  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.370175  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  26.84 
 
 		 534 aa  61.2  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2928  hypothetical protein  35.45 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1573  hypothetical protein  33.51 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0210508  normal  0.559729 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1381  MobA-like protein  29.34 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.223593  normal  0.271333 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  27.51 
 
 		 534 aa  60.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1816  metal dependent phosphohydrolase  27.89 
 
 		 372 aa  59.7  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2648  molybdenum cofactor biosynthesis protein  26.67 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  27.6 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2846  hypothetical protein  30 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449385  decreased coverage  0.00911048 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0836  hypothetical protein  31.69 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  33.14 
 
 		 538 aa  59.3  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.15 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  27.98 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1260  xanthine dehydrogenase accessory protein pucB  33.72 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0825  MobA-like protein-like protein  34.76 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207801  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3432  metal dependent phosphohydrolase  26.63 
 
 		 408 aa  58.2  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1079  molybdopterin biosynthesis enzyme  32.2 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  31.15 
 
 		 544 aa  58.2  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  31.02 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  32.42 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2410  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.35 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1519  hypothetical protein  25.93 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1816  hypothetical protein  28.34 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2799  hypothetical protein  34.39 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>