128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0418 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0418  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159486  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0358  hypothetical protein  83.94 
 
 		 198 aa  323  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4726  hypothetical protein  51.06 
 
 		 195 aa  191  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.048995 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2227  hypothetical protein  51.06 
 
 		 195 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5992  hypothetical protein  50 
 
 		 195 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.361176 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3554  uncharacterized MobA-related protein  51.32 
 
 		 194 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4813  uncharacterized MobA-related protein  51.32 
 
 		 194 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.913909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5470  uncharacterized MobA-related protein  51.32 
 
 		 194 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0663776 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0890  uncharacterized MobA-related protein  50.26 
 
 		 194 aa  159  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.28742  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4718  uncharacterized MobA-related protein-like protein  48.68 
 
 		 194 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819957 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4195  MobA-like protein-like protein  48.94 
 
 		 194 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3725  hypothetical protein  46.6 
 
 		 198 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4802  hypothetical protein  46.6 
 
 		 198 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394051  normal  0.300169 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1707  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  47.18 
 
 		 199 aa  148  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1620  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  47.18 
 
 		 199 aa  148  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0211  hypothetical protein  47.18 
 
 		 346 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0194719  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3790  uncharacterized MobA-related protein  49.21 
 
 		 194 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0141357 
 
 
-
 
NC_003296  RS05439  hypothetical protein  45.92 
 
 		 199 aa  142  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232404  normal  0.0351098 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1199  hypothetical protein  48.21 
 
 		 199 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570343  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1894  hypothetical protein  42.78 
 
 		 199 aa  128  7.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0201  hypothetical protein  43.16 
 
 		 202 aa  117  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2617  hypothetical protein  42.55 
 
 		 196 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4019  hypothetical protein  38.66 
 
 		 194 aa  99  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0410736 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4167  hypothetical protein  35.83 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0348908  normal  0.0855326 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2921  hypothetical protein  35.61 
 
 		 216 aa  97.1  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.627898 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  37.76 
 
 		 192 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2392  hypothetical protein  36.04 
 
 		 207 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25820  hypothetical protein  38.42 
 
 		 200 aa  93.2  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.708466  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  33.33 
 
 		 199 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  35.14 
 
 		 188 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  37.24 
 
 		 191 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2658  hypothetical protein  36.02 
 
 		 197 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421379  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3555  hypothetical protein  34.38 
 
 		 182 aa  85.5  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.919996  normal  0.404 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1634  MobA-like protein  35.48 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4230  hypothetical protein  34.95 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2928  hypothetical protein  31.94 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.796136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3796  hypothetical protein  34.59 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328726  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  35.71 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  38.31 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2698  hypothetical protein  31.38 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.16 
 
 		 534 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0867  hypothetical protein  31.12 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  32.62 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3712  hypothetical protein  32.46 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.38 
 
 		 533 aa  72  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0530  hypothetical protein  33.16 
 
 		 207 aa  72  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  31.22 
 
 		 534 aa  71.2  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  32.09 
 
 		 534 aa  70.5  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0921  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  35.08 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.370175  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  31.18 
 
 		 534 aa  69.3  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4741  hypothetical protein  34.16 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  32.98 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.58 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.86 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0123  MobA-like protein  36.81 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.14106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3943  hypothetical protein  34.03 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00148213  normal  0.123195 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.18 
 
 		 533 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.32 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  25 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2205  hypothetical protein  24.24 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1079  molybdopterin biosynthesis enzyme  32.2 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  32.61 
 
 		 538 aa  63.2  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  31.38 
 
 		 544 aa  60.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.55 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1224  MobA-like protein-like protein  24.23 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.607114  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  30.57 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  30.96 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  32.72 
 
 		 575 aa  59.3  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0360  hypothetical protein  26.11 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000717889  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2563  hypothetical protein  31.41 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.778302  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13070  uncharacterized MobA-like protein  32.04 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.37 
 
 		 539 aa  57.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.6 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  31.47 
 
 		 546 aa  57  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1779  hypothetical protein  32.61 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  26.78 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1554  metal dependent phosphohydrolase  27.72 
 
 		 370 aa  55.8  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.307535  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.22 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.134734 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2489  hypothetical protein  30.81 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.152259  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  27.13 
 
 		 367 aa  54.3  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  26.06 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0793  hypothetical protein  32.24 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2977  hypothetical protein  32.16 
 
 		 195 aa  52  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000274563  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1519  hypothetical protein  25.86 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1188  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.43 
 
 		 197 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4015  hypothetical protein  30.69 
 
 		 233 aa  51.2  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0836  hypothetical protein  34.01 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  25.27 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  25.27 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  34.74 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  24.12 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  41.54 
 
 		 533 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  31.18 
 
 		 187 aa  48.5  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.51 
 
 		 207 aa  48.1  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3432  metal dependent phosphohydrolase  27.37 
 
 		 408 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.41 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  32.83 
 
 		 539 aa  46.6  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2846  hypothetical protein  33.33 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449385  decreased coverage  0.00911048 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2410  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.96 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1757  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.02 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>