169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1224 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1224  MobA-like protein-like protein  100 
 
 
201 aa  394  1e-109  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.607114  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  30.73 
 
 
216 aa  90.5  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  29.44 
 
 
534 aa  89.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2658  hypothetical protein  28.8 
 
 
197 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421379  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.92 
 
 
539 aa  88.2  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.32 
 
 
533 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29 
 
 
202 aa  86.3  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.8 
 
 
533 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  25 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  25.52 
 
 
575 aa  84  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  29.69 
 
 
455 aa  83.2  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  33.33 
 
 
187 aa  83.6  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2392  hypothetical protein  25.52 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2617  hypothetical protein  26.04 
 
 
196 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  25.39 
 
 
534 aa  82  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  25.51 
 
 
199 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.46 
 
 
202 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.33 
 
 
189 aa  79  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  24.35 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  24.74 
 
 
201 aa  78.2  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  24.74 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  27.4 
 
 
534 aa  77  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  30.86 
 
 
195 aa  77  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  22.11 
 
 
192 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  26.55 
 
 
538 aa  75.5  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  27.05 
 
 
534 aa  75.1  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0530  hypothetical protein  24.87 
 
 
207 aa  74.7  0.0000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3029  molybdenum cofactor biosynthesis protein  25.13 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.098074  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.11 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  21.83 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.84 
 
 
533 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  23.62 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  22.39 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1519  hypothetical protein  29.9 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  22.11 
 
 
191 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2641  MobA-related protein  28.5 
 
 
394 aa  66.2  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  23.86 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3432  metal dependent phosphohydrolase  28.27 
 
 
408 aa  65.5  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0825  MobA-like protein-like protein  26.6 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207801  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2846  hypothetical protein  22.34 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449385  decreased coverage  0.00911048 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2205  hypothetical protein  26.47 
 
 
242 aa  64.7  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1894  hypothetical protein  21.35 
 
 
199 aa  64.3  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  24.86 
 
 
546 aa  63.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1554  metal dependent phosphohydrolase  24.14 
 
 
370 aa  62.8  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.307535  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2037  hypothetical protein  23.62 
 
 
222 aa  62.4  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0186754  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2695  hypothetical protein  29.52 
 
 
202 aa  62.4  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0332984  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  27.75 
 
 
204 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1816  metal dependent phosphohydrolase  23.81 
 
 
372 aa  62.4  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13070  uncharacterized MobA-like protein  21.23 
 
 
194 aa  62.4  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02165  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  24.45 
 
 
289 aa  62  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.892695  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0123  MobA-like protein  22.63 
 
 
190 aa  61.6  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.14106  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1746  hypothetical protein  29.25 
 
 
191 aa  61.6  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1745  hypothetical protein  26.9 
 
 
185 aa  60.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0225  hypothetical protein  22.16 
 
 
197 aa  60.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.633552  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  24.6 
 
 
191 aa  61.2  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  22.84 
 
 
190 aa  60.1  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0358  hypothetical protein  23.04 
 
 
198 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.64 
 
 
204 aa  60.5  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  23.71 
 
 
544 aa  60.5  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4204  MobA-like protein-like protein  27.42 
 
 
204 aa  59.7  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212178  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1079  molybdopterin biosynthesis enzyme  22.73 
 
 
218 aa  58.9  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.72 
 
 
197 aa  58.5  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1413  hypothetical protein  27.33 
 
 
202 aa  58.5  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0598562  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  25.13 
 
 
208 aa  58.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  21.54 
 
 
195 aa  58.2  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3796  hypothetical protein  22.34 
 
 
185 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328726  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0199  hypothetical protein  22.58 
 
 
213 aa  58.2  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182952  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4802  hypothetical protein  27.42 
 
 
198 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394051  normal  0.300169 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  27.22 
 
 
205 aa  57.4  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3725  hypothetical protein  27.42 
 
 
198 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1438  hypothetical protein  20.36 
 
 
228 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  25.26 
 
 
208 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4310  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  19.18 
 
 
228 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.707183  normal  0.580614 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1779  hypothetical protein  24.6 
 
 
186 aa  57  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4230  hypothetical protein  19.89 
 
 
188 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  22.51 
 
 
194 aa  56.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2512  hypothetical protein  24.37 
 
 
221 aa  56.6  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3415  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  20.21 
 
 
191 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  24.39 
 
 
211 aa  55.8  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2712  MobA-like protein-like  25.87 
 
 
208 aa  55.8  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  21.35 
 
 
200 aa  55.8  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2731  hypothetical protein  21.33 
 
 
245 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  22.4 
 
 
193 aa  55.1  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4019  hypothetical protein  22.22 
 
 
194 aa  55.1  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0410736 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0279  hypothetical protein  25 
 
 
218 aa  54.7  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3196  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  21.26 
 
 
211 aa  54.7  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1816  hypothetical protein  24.47 
 
 
200 aa  54.7  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1634  MobA-like protein  19.35 
 
 
188 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0921  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  22.4 
 
 
200 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.370175  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4726  hypothetical protein  24.61 
 
 
195 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.048995 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10376  hypothetical protein  22.09 
 
 
197 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000126755  normal  0.572936 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0903  hypothetical protein  25.6 
 
 
216 aa  53.1  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.631928  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1495  hypothetical protein  20.52 
 
 
234 aa  52.8  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1381  MobA-like protein  22.73 
 
 
293 aa  52.8  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.223593  normal  0.271333 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1757  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  22.39 
 
 
199 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2748  hypothetical protein  21.08 
 
 
245 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.668199  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2824  hypothetical protein  21.08 
 
 
245 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0559762 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1628  hypothetical protein  21.33 
 
 
245 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00936248 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2921  hypothetical protein  19.15 
 
 
216 aa  51.2  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.627898 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0793  hypothetical protein  22.05 
 
 
207 aa  50.8  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>