135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1381 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1381  MobA-like protein  100 
 
 
293 aa  573  1.0000000000000001e-162  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.223593  normal  0.271333 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  37.76 
 
 
455 aa  94  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  37.81 
 
 
575 aa  89.4  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  35.5 
 
 
216 aa  88.6  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.94 
 
 
534 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.67 
 
 
202 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  35.45 
 
 
538 aa  79  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.85 
 
 
197 aa  79  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  33.16 
 
 
534 aa  79  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.08 
 
 
533 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.47 
 
 
539 aa  75.1  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.5 
 
 
538 aa  72.8  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.72 
 
 
533 aa  72.8  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1079  molybdopterin biosynthesis enzyme  33.88 
 
 
218 aa  72.8  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.14 
 
 
194 aa  72.4  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4204  MobA-like protein-like protein  26.26 
 
 
204 aa  71.6  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212178  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  34.9 
 
 
544 aa  71.6  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.17 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.150492 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.58 
 
 
189 aa  70.9  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  32.75 
 
 
187 aa  70.5  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.79 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  32.46 
 
 
534 aa  69.7  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  27.14 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  31.41 
 
 
534 aa  68.2  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.98 
 
 
208 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  26.74 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6027  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.23 
 
 
207 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0306  hypothetical protein  32.64 
 
 
206 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.96 
 
 
210 aa  62  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0317  hypothetical protein  33.51 
 
 
207 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.449595  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0328  hypothetical protein  33.51 
 
 
207 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1894  hypothetical protein  29.41 
 
 
199 aa  60.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  31.11 
 
 
546 aa  61.2  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  26.02 
 
 
190 aa  60.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  21.54 
 
 
195 aa  60.8  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4656  hypothetical protein  34.2 
 
 
203 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720744  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  27.84 
 
 
205 aa  60.1  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2695  hypothetical protein  32.86 
 
 
202 aa  59.7  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0332984  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0921  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  36.75 
 
 
200 aa  58.9  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.370175  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  30.93 
 
 
210 aa  58.9  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05439  hypothetical protein  37.96 
 
 
199 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232404  normal  0.0351098 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2658  hypothetical protein  33.73 
 
 
197 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421379  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  27.66 
 
 
200 aa  57.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2928  hypothetical protein  30.51 
 
 
210 aa  57.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.796136  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3796  hypothetical protein  32.28 
 
 
185 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328726  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  32.8 
 
 
539 aa  57.4  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1746  hypothetical protein  28.66 
 
 
191 aa  57.4  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.14 
 
 
197 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.134734 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  31.58 
 
 
201 aa  57.4  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1433  hypothetical protein  34.25 
 
 
208 aa  57  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.170444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  28.57 
 
 
199 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2617  hypothetical protein  28.29 
 
 
196 aa  55.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3029  molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.09 
 
 
203 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.098074  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2037  hypothetical protein  30.77 
 
 
222 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0186754  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  26.6 
 
 
214 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  29.67 
 
 
211 aa  55.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0984  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.44 
 
 
197 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0360339  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1188  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.29 
 
 
197 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143953  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.51 
 
 
533 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.94 
 
 
203 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2205  hypothetical protein  29.75 
 
 
242 aa  54.3  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  29.61 
 
 
389 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10376  hypothetical protein  28.64 
 
 
197 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000126755  normal  0.572936 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  36.22 
 
 
195 aa  53.9  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.81 
 
 
208 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  30.81 
 
 
208 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5450  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.72 
 
 
201 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1224  MobA-like protein-like protein  23.23 
 
 
201 aa  52.8  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.607114  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2846  hypothetical protein  38.79 
 
 
193 aa  52.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449385  decreased coverage  0.00911048 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  24.75 
 
 
198 aa  52.4  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4230  hypothetical protein  30.89 
 
 
188 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13070  uncharacterized MobA-like protein  31.94 
 
 
194 aa  52  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3432  metal dependent phosphohydrolase  27.86 
 
 
408 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1816  hypothetical protein  26.87 
 
 
200 aa  52  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  29.63 
 
 
187 aa  52  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  32.93 
 
 
191 aa  52  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.61 
 
 
193 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2921  hypothetical protein  33.92 
 
 
216 aa  52  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.627898 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4167  hypothetical protein  32.18 
 
 
198 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0348908  normal  0.0855326 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0890  uncharacterized MobA-related protein  37.76 
 
 
194 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.28742  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1757  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.6 
 
 
199 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1006  metal dependent phosphohydrolase  32.81 
 
 
373 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2977  hypothetical protein  31.67 
 
 
195 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000274563  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2091  molybdopterin binding protein  27.86 
 
 
202 aa  50.4  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.865191  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5614  hypothetical protein  36.36 
 
 
185 aa  50.8  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1816  metal dependent phosphohydrolase  32.94 
 
 
372 aa  50.4  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0201  hypothetical protein  28.57 
 
 
202 aa  50.4  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1634  MobA-like protein  30.37 
 
 
188 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  30.73 
 
 
188 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1467  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  26.15 
 
 
368 aa  49.7  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700168  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3725  hypothetical protein  31.48 
 
 
198 aa  49.7  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4802  hypothetical protein  31.48 
 
 
198 aa  49.7  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394051  normal  0.300169 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1989  hypothetical protein  34.52 
 
 
208 aa  49.3  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1779  hypothetical protein  31.36 
 
 
186 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  28.43 
 
 
197 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3790  uncharacterized MobA-related protein  36.08 
 
 
194 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0141357 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3547  MobA-like protein-like  27.27 
 
 
384 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871069  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1545  metal dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 
393 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0825  MobA-like protein-like protein  29.65 
 
 
196 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207801  normal  0.0863561 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>