249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6027 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012852  Rleg_6027  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  100 
 
 
207 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4656  hypothetical protein  61.11 
 
 
203 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720744  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  54.08 
 
 
538 aa  194  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5614  hypothetical protein  49.72 
 
 
185 aa  160  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  46 
 
 
538 aa  148  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  45.13 
 
 
533 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  43.75 
 
 
533 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  44.1 
 
 
534 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  43.75 
 
 
534 aa  128  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  40.96 
 
 
455 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  42.19 
 
 
534 aa  123  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  41.88 
 
 
575 aa  118  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  38.66 
 
 
534 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  39.2 
 
 
202 aa  116  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.98 
 
 
539 aa  113  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  43.23 
 
 
533 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  37.62 
 
 
210 aa  111  9e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  39.13 
 
 
546 aa  107  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  39.13 
 
 
544 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  39.09 
 
 
197 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.134734 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  40 
 
 
203 aa  102  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  40.99 
 
 
214 aa  102  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  33.68 
 
 
205 aa  98.6  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  35.08 
 
 
200 aa  98.6  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  38.78 
 
 
202 aa  97.8  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  36.51 
 
 
216 aa  95.1  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1757  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  43.07 
 
 
199 aa  94  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1188  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  39.09 
 
 
197 aa  94  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143953  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  38.17 
 
 
211 aa  93.6  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.74 
 
 
194 aa  91.7  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0984  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.78 
 
 
197 aa  91.3  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0360339  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0036  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  36.13 
 
 
225 aa  91.7  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.251562 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.65 
 
 
189 aa  91.3  9e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  31.89 
 
 
190 aa  89  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5450  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  40.2 
 
 
201 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.69 
 
 
197 aa  87  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1467  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  30.3 
 
 
368 aa  86.3  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700168  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.98 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  31.05 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.21 
 
 
208 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  34.21 
 
 
208 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 
389 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1079  molybdopterin biosynthesis enzyme  32.64 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1545  metal dependent phosphohydrolase  30.37 
 
 
393 aa  82.4  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  36.08 
 
 
539 aa  81.6  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  29.63 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2205  hypothetical protein  25.98 
 
 
242 aa  79  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  30.81 
 
 
187 aa  79  0.00000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4726  hypothetical protein  36.13 
 
 
195 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.048995 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  34.57 
 
 
199 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1381  MobA-like protein  37.31 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.223593  normal  0.271333 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  35.6 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2712  MobA-like protein-like  28.95 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  34.57 
 
 
187 aa  75.1  0.0000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.64 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1433  hypothetical protein  34.07 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.170444 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0921  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  34.22 
 
 
200 aa  72  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.370175  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  35.15 
 
 
192 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1634  MobA-like protein  34.16 
 
 
188 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0825  MobA-like protein-like protein  35.6 
 
 
196 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207801  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2091  molybdopterin binding protein  32.67 
 
 
202 aa  69.7  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.865191  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  31.36 
 
 
198 aa  70.1  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1413  hypothetical protein  30.65 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0598562  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4230  hypothetical protein  33.17 
 
 
188 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0890  uncharacterized MobA-related protein  35.14 
 
 
194 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.28742  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1881  hypothetical protein  37.56 
 
 
200 aa  68.6  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1554  metal dependent phosphohydrolase  29.32 
 
 
370 aa  68.2  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.307535  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2227  hypothetical protein  34.57 
 
 
195 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.81 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  32.82 
 
 
201 aa  67.8  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  33.87 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2392  hypothetical protein  34.73 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3796  hypothetical protein  35.08 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328726  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2658  hypothetical protein  36.36 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421379  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1006  metal dependent phosphohydrolase  32.64 
 
 
373 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0306  hypothetical protein  33.13 
 
 
206 aa  65.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  33.84 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0328  hypothetical protein  33.13 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.05 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0317  hypothetical protein  33.13 
 
 
207 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.449595  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4195  MobA-like protein-like protein  34.59 
 
 
194 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1495  hypothetical protein  28.43 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4718  uncharacterized MobA-related protein-like protein  34.59 
 
 
194 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.819957 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3432  metal dependent phosphohydrolase  26.98 
 
 
408 aa  64.7  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0360  hypothetical protein  28.21 
 
 
190 aa  64.7  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000717889  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5992  hypothetical protein  33.51 
 
 
195 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.361176 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1816  hypothetical protein  30.65 
 
 
200 aa  63.5  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1745  hypothetical protein  30.23 
 
 
185 aa  63.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5470  uncharacterized MobA-related protein  33.51 
 
 
194 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0663776 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  35.15 
 
 
191 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3554  uncharacterized MobA-related protein  33.51 
 
 
194 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4813  uncharacterized MobA-related protein  33.51 
 
 
194 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.913909 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3050  hypothetical protein  31.03 
 
 
229 aa  62  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1438  hypothetical protein  27.84 
 
 
228 aa  62  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2037  hypothetical protein  30.37 
 
 
222 aa  61.6  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0186754  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3790  uncharacterized MobA-related protein  39.5 
 
 
194 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0141357 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  31.31 
 
 
212 aa  60.1  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3453  metal dependent phosphohydrolase  24.63 
 
 
216 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.37 
 
 
193 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2410  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.65 
 
 
194 aa  59.7  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>