235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4656 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_4656  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  394  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720744  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  61.62 
 
 
538 aa  226  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6027  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  61.11 
 
 
207 aa  211  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5614  hypothetical protein  58.79 
 
 
185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  50.25 
 
 
538 aa  165  5e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  47.89 
 
 
533 aa  151  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  47.69 
 
 
534 aa  149  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  45.79 
 
 
533 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  44.74 
 
 
534 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  45.26 
 
 
534 aa  135  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  47.57 
 
 
544 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  40.82 
 
 
534 aa  128  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  45.26 
 
 
533 aa  128  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  42.78 
 
 
202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  42.78 
 
 
575 aa  124  9e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  39.69 
 
 
539 aa  122  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  40.74 
 
 
455 aa  120  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  38.54 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  40 
 
 
546 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  43.22 
 
 
203 aa  105  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  41.71 
 
 
197 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.134734 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  35.94 
 
 
205 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1757  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  42.57 
 
 
199 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1188  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  41.71 
 
 
197 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143953  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.23 
 
 
197 aa  95.5  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  34.22 
 
 
200 aa  95.1  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  35.11 
 
 
214 aa  92  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.65 
 
 
194 aa  90.9  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5450  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.58 
 
 
201 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0984  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  41.18 
 
 
197 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0360339  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0921  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  38.1 
 
 
200 aa  90.1  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.370175  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0036  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  34.76 
 
 
225 aa  89.7  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  35.33 
 
 
216 aa  89  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1079  molybdopterin biosynthesis enzyme  33.67 
 
 
218 aa  87.4  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  36.36 
 
 
211 aa  85.5  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1554  metal dependent phosphohydrolase  32.63 
 
 
370 aa  84.7  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.307535  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.5 
 
 
189 aa  82.8  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.02 
 
 
208 aa  81.3  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.17 
 
 
204 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1816  hypothetical protein  32.45 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2091  molybdopterin binding protein  35.11 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.865191  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2712  MobA-like protein-like  31.41 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  39.79 
 
 
539 aa  79  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.31 
 
 
202 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  33.85 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.33 
 
 
208 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  28.95 
 
 
199 aa  75.5  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2205  hypothetical protein  26.72 
 
 
242 aa  75.5  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  33.33 
 
 
187 aa  75.5  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4726  hypothetical protein  35.94 
 
 
195 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.048995 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1467  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  28.5 
 
 
368 aa  73.6  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700168  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0825  MobA-like protein-like protein  39.78 
 
 
196 aa  73.2  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207801  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  31.58 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  35.64 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  30.93 
 
 
389 aa  72.8  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  28.49 
 
 
190 aa  72.8  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1634  MobA-like protein  34.36 
 
 
188 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4204  MobA-like protein-like protein  25.64 
 
 
204 aa  71.6  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212178  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  31.91 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4230  hypothetical protein  33.33 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3196  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  34.8 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  34.92 
 
 
187 aa  68.9  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1545  metal dependent phosphohydrolase  28.72 
 
 
393 aa  68.2  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2928  hypothetical protein  36.51 
 
 
199 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1745  hypothetical protein  33.11 
 
 
185 aa  67.4  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5992  hypothetical protein  35.42 
 
 
195 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.361176 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2928  hypothetical protein  33.5 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.796136  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1006  metal dependent phosphohydrolase  31.44 
 
 
373 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  34.55 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1573  hypothetical protein  34.39 
 
 
199 aa  66.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0210508  normal  0.559729 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  30 
 
 
198 aa  65.1  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  28.12 
 
 
204 aa  64.7  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1433  hypothetical protein  34.05 
 
 
208 aa  64.7  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.170444 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2921  hypothetical protein  33.33 
 
 
216 aa  64.7  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.627898 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0306  hypothetical protein  34.9 
 
 
206 aa  64.7  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2489  hypothetical protein  32.11 
 
 
192 aa  64.7  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.152259  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  24.87 
 
 
195 aa  64.3  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0328  hypothetical protein  34.38 
 
 
207 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0317  hypothetical protein  34.38 
 
 
207 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.449595  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  29.63 
 
 
367 aa  63.2  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0530  hypothetical protein  31.94 
 
 
207 aa  62.8  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.33 
 
 
193 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2695  hypothetical protein  26.84 
 
 
202 aa  62.8  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0332984  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2227  hypothetical protein  31.6 
 
 
195 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.81 
 
 
207 aa  62.4  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2410  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.22 
 
 
194 aa  62.4  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3453  metal dependent phosphohydrolase  25.5 
 
 
216 aa  62.4  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1484  hypothetical protein  35.38 
 
 
201 aa  62.4  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205253  normal  0.364405 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1707  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  37.06 
 
 
199 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1620  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  37.06 
 
 
199 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.05 
 
 
210 aa  61.6  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4019  hypothetical protein  30.2 
 
 
194 aa  61.6  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0410736 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1381  MobA-like protein  34.2 
 
 
293 aa  61.6  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.223593  normal  0.271333 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4718  uncharacterized MobA-related protein-like protein  35.98 
 
 
194 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.819957 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  31.25 
 
 
188 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  31.53 
 
 
591 aa  61.2  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0815  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  27.27 
 
 
192 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3203  hypothetical protein  27.27 
 
 
192 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0211  hypothetical protein  37.06 
 
 
346 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0194719  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4167  hypothetical protein  27.78 
 
 
192 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>