179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2928 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2928  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  368  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1573  hypothetical protein  95.48 
 
 		 199 aa  320  8e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0210508  normal  0.559729 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0921  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  71.21 
 
 		 200 aa  245  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.370175  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1484  hypothetical protein  53.37 
 
 		 201 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205253  normal  0.364405 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2489  hypothetical protein  46.88 
 
 		 192 aa  138  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.152259  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1433  hypothetical protein  46.32 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.170444 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.97 
 
 		 533 aa  98.2  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  38.78 
 
 		 210 aa  97.8  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  36.56 
 
 		 534 aa  95.9  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.23 
 
 		 533 aa  95.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  39.13 
 
 		 538 aa  94  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  34.95 
 
 		 534 aa  92  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.56 
 
 		 534 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  36.9 
 
 		 544 aa  87  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4656  hypothetical protein  36.51 
 
 		 203 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  34.02 
 
 		 534 aa  85.9  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  35.98 
 
 		 455 aa  85.5  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.49 
 
 		 197 aa  84.7  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  34.38 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.83 
 
 		 538 aa  82.8  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1894  hypothetical protein  35.45 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.95 
 
 		 533 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.73 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.39 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.87 
 
 		 539 aa  79.3  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0036  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  31.47 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  31.02 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0328  hypothetical protein  40.43 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0317  hypothetical protein  40.43 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.449595  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0306  hypothetical protein  40.21 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  31.87 
 
 		 575 aa  72.4  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.35 
 
 		 204 aa  71.2  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1188  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.84 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.3 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.134734 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0530  hypothetical protein  33.33 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.27 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2617  hypothetical protein  34.76 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.42 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  35.23 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1079  molybdopterin biosynthesis enzyme  34.38 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  30.11 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  33.68 
 
 		 546 aa  67  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1381  MobA-like protein  34.06 
 
 		 293 aa  67  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.223593  normal  0.271333 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  30.6 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.08 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02165  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  26.95 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.892695  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  32.11 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4019  hypothetical protein  35.95 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0410736 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  37.97 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.6 
 
 		 189 aa  64.7  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  29.38 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6027  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.94 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  29.23 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  28.42 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1413  hypothetical protein  28.57 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0598562  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4802  hypothetical protein  33.67 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394051  normal  0.300169 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3725  hypothetical protein  33.67 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0836  hypothetical protein  34.21 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1519  hypothetical protein  25.94 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0358  hypothetical protein  32.62 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1816  metal dependent phosphohydrolase  31 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0360  hypothetical protein  27.13 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000717889  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  32.99 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  32.82 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0825  MobA-like protein-like protein  36.13 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207801  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  23.32 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2695  hypothetical protein  33.51 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0332984  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0123  MobA-like protein  36.13 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.14106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  30 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  36.52 
 
 		 539 aa  59.3  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0203  hypothetical protein  33.51 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.761699  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  28.49 
 
 		 389 aa  58.5  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13070  uncharacterized MobA-like protein  34.83 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  35.11 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2928  hypothetical protein  31.47 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.796136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2205  hypothetical protein  26.61 
 
 		 242 aa  57.8  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05439  hypothetical protein  38.69 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232404  normal  0.0351098 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5614  hypothetical protein  34.08 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3050  hypothetical protein  31.7 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1467  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  25 
 
 		 368 aa  56.2  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700168  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1224  MobA-like protein-like protein  22.16 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.607114  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2091  molybdopterin binding protein  30.27 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.865191  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2712  MobA-like protein-like  29.57 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0201  hypothetical protein  31.4 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0984  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.83 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0360339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0890  uncharacterized MobA-related protein  37.07 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.28742  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2641  MobA-related protein  19.7 
 
 		 394 aa  54.3  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0243  MobA-like protein  27.92 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00192406  normal  0.367058 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.9 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2921  hypothetical protein  30.95 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.627898 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2037  hypothetical protein  31.02 
 
 		 222 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0186754  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1495  hypothetical protein  28.89 
 
 		 234 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1827  hypothetical protein  40.4 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.563205  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0328  hypothetical protein  36.21 
 
 		 227 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3555  hypothetical protein  32.95 
 
 		 182 aa  53.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.919996  normal  0.404 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3415  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  32.98 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1833  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  28.57 
 
 		 243 aa  52.8  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.36996 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  37.43 
 
 		 191 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4195  MobA-like protein-like protein  36.07 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4741  hypothetical protein  34.94 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>