118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0328 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0328  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  428  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2846  hypothetical protein  48.06 
 
 		 193 aa  132  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449385  decreased coverage  0.00911048 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2977  hypothetical protein  44.66 
 
 		 195 aa  132  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000274563  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  41.95 
 
 		 193 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  41.75 
 
 		 210 aa  118  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  41.43 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13070  uncharacterized MobA-like protein  41.35 
 
 		 194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4741  hypothetical protein  42.36 
 
 		 213 aa  111  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  41.55 
 
 		 195 aa  104  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  48.82 
 
 		 207 aa  99.8  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2799  hypothetical protein  43.17 
 
 		 189 aa  95.1  8e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1881  hypothetical protein  40.8 
 
 		 200 aa  92  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0199  hypothetical protein  41.35 
 
 		 213 aa  88.2  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182952  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3203  hypothetical protein  36.32 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.950597  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5126  hypothetical protein  39.9 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4770  molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.56 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2979  hypothetical protein  35.82 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.220075 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  31.84 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  24.88 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  39.39 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3415  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  36.06 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.58 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4967  hypothetical protein  35.78 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  31.4 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4787  hypothetical protein  41.8 
 
 		 175 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3976  hypothetical protein  40.39 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326622  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  23.44 
 
 		 190 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.37 
 
 		 533 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.82 
 
 		 534 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.02 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0903  hypothetical protein  27.4 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.631928  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.54 
 
 		 539 aa  68.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  38.64 
 
 		 192 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.33 
 
 		 533 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  32.35 
 
 		 455 aa  65.9  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  28.42 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0530  hypothetical protein  32.88 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  31.88 
 
 		 534 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3796  hypothetical protein  35.34 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328726  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4310  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  46 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.707183  normal  0.580614 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3196  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  31.78 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  36.43 
 
 		 575 aa  62  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  30.73 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  31.41 
 
 		 187 aa  62  0.000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  33.83 
 
 		 544 aa  61.6  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.75 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1662  hypothetical protein  36 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  38.06 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6199  hypothetical protein  39.47 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.326394  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  38.98 
 
 		 546 aa  59.7  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.17 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2658  hypothetical protein  31.34 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421379  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  26.6 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  39.02 
 
 		 539 aa  56.6  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1433  hypothetical protein  35.51 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.170444 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.67 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3432  metal dependent phosphohydrolase  24.88 
 
 		 408 aa  55.5  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.59 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1827  hypothetical protein  35.09 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.563205  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  31.78 
 
 		 197 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2068  hypothetical protein  31.11 
 
 		 189 aa  53.1  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4230  hypothetical protein  34.11 
 
 		 188 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  29.61 
 
 		 534 aa  52.8  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2392  hypothetical protein  28.03 
 
 		 207 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  25 
 
 		 204 aa  52.4  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  25.71 
 
 		 367 aa  52.4  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1634  MobA-like protein  34.11 
 
 		 188 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2037  hypothetical protein  29.13 
 
 		 222 aa  52  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0186754  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  30.39 
 
 		 534 aa  50.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.4 
 
 		 533 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  27.72 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1779  hypothetical protein  28.14 
 
 		 186 aa  50.1  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1079  molybdopterin biosynthesis enzyme  34.09 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3547  MobA-like protein-like  30.24 
 
 		 384 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871069  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  32.12 
 
 		 538 aa  49.7  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  25.36 
 
 		 389 aa  49.7  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1283  hypothetical protein  32.67 
 
 		 181 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260926  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1300  hypothetical protein  32.67 
 
 		 181 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0119759  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  35.54 
 
 		 191 aa  49.3  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.73 
 
 		 194 aa  48.9  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  37.6 
 
 		 201 aa  48.5  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0203  hypothetical protein  29.03 
 
 		 203 aa  48.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.761699  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4726  hypothetical protein  34.75 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.048995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1757  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.38 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1894  hypothetical protein  29.78 
 
 		 199 aa  47.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  26.6 
 
 		 210 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3215  hypothetical protein  35.44 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2489  hypothetical protein  32.46 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.152259  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1381  MobA-like protein  36.27 
 
 		 293 aa  46.6  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.223593  normal  0.271333 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2410  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.06 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0984  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.43 
 
 		 197 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0360339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  25.85 
 
 		 214 aa  46.2  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1745  hypothetical protein  23.79 
 
 		 185 aa  45.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  25.98 
 
 		 591 aa  45.4  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1746  hypothetical protein  22.34 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3300  hypothetical protein  33.5 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20416  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4656  hypothetical protein  27.36 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720744  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0279  hypothetical protein  22.48 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0358  hypothetical protein  33.33 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>