139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3203 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3203  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  386  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.950597  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2979  hypothetical protein  92.9 
 
 		 197 aa  309  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.220075 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5126  hypothetical protein  54.09 
 
 		 184 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0199  hypothetical protein  48.37 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182952  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4967  hypothetical protein  46.15 
 
 		 193 aa  122  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  42.31 
 
 		 210 aa  118  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  40.54 
 
 		 193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4741  hypothetical protein  44.51 
 
 		 213 aa  109  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13070  uncharacterized MobA-like protein  41.38 
 
 		 194 aa  108  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3415  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  40.93 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3976  hypothetical protein  39.56 
 
 		 185 aa  97.8  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326622  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2799  hypothetical protein  39.01 
 
 		 189 aa  97.1  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  35.64 
 
 		 212 aa  95.9  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  38.46 
 
 		 195 aa  94.4  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2846  hypothetical protein  41.49 
 
 		 193 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449385  decreased coverage  0.00911048 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0328  hypothetical protein  36.27 
 
 		 227 aa  93.2  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.16 
 
 		 533 aa  89.4  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2977  hypothetical protein  37.21 
 
 		 195 aa  88.6  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000274563  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3196  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  33.84 
 
 		 211 aa  88.2  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  28.22 
 
 		 204 aa  87.8  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  34.07 
 
 		 192 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4770  molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.08 
 
 		 174 aa  85.5  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  37.04 
 
 		 546 aa  85.5  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1881  hypothetical protein  37.3 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  34.39 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3029  molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.93 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.098074  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  31.38 
 
 		 534 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  29.81 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  30.98 
 
 		 455 aa  79.3  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.02 
 
 		 533 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  29.95 
 
 		 534 aa  75.5  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.69 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.88 
 
 		 534 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.81 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  30.41 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  33.52 
 
 		 191 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  32.53 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  31.89 
 
 		 544 aa  73.2  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  31.22 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  29.79 
 
 		 534 aa  72.4  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4310  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  34.43 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.707183  normal  0.580614 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1662  hypothetical protein  34.25 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.35 
 
 		 539 aa  70.1  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  25.67 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.49 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2037  hypothetical protein  32.88 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0186754  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.16 
 
 		 533 aa  68.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  30 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1827  hypothetical protein  35.91 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.563205  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2392  hypothetical protein  26.34 
 
 		 207 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1283  hypothetical protein  36.46 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260926  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1300  hypothetical protein  36.46 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0119759  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  30.39 
 
 		 591 aa  66.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  30.37 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2068  hypothetical protein  36.67 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1467  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  29.33 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700168  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2658  hypothetical protein  30.23 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421379  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  29.82 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.33 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  32.34 
 
 		 575 aa  65.1  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  29.9 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4787  hypothetical protein  35.36 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6199  hypothetical protein  32.09 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.326394  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  24.74 
 
 		 197 aa  62  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  22.7 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  27.71 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2512  hypothetical protein  25.43 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  32.46 
 
 		 538 aa  59.7  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.31 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2489  hypothetical protein  29.84 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.152259  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0225  hypothetical protein  36.55 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.633552  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  29.35 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0123  MobA-like protein  31.49 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.14106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3796  hypothetical protein  28.11 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328726  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0836  hypothetical protein  29.41 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  25.98 
 
 		 389 aa  58.2  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2964  hypothetical protein  30.65 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.92 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1816  metal dependent phosphohydrolase  31.97 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  32.17 
 
 		 367 aa  55.8  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.43 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  25.97 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1816  hypothetical protein  24.86 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1312  hypothetical protein  36.46 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.7 
 
 		 538 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3432  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 		 408 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0530  hypothetical protein  27.89 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2695  hypothetical protein  29.79 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0332984  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0203  hypothetical protein  33.09 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.761699  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1433  hypothetical protein  32.52 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.170444 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1381  MobA-like protein  30.29 
 
 		 293 aa  50.1  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.223593  normal  0.271333 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  30.43 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4204  MobA-like protein-like protein  22.78 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212178  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1006  metal dependent phosphohydrolase  28.11 
 
 		 373 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1689  hypothetical protein  44.09 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0654906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0903  hypothetical protein  24.88 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.631928  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2410  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.05 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1519  hypothetical protein  26.23 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1745  hypothetical protein  26.25 
 
 		 185 aa  48.1  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5193  hypothetical protein  32.16 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>