89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4770 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4770  molybdenum cofactor biosynthesis protein  100 
 
 
174 aa  337  4e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13070  uncharacterized MobA-like protein  48.85 
 
 
194 aa  122  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2799  hypothetical protein  46.86 
 
 
189 aa  117  7e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3976  hypothetical protein  47.73 
 
 
185 aa  97.1  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326622  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5126  hypothetical protein  44.81 
 
 
184 aa  92  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4967  hypothetical protein  45.71 
 
 
193 aa  91.7  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0199  hypothetical protein  45.45 
 
 
213 aa  91.7  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182952  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1283  hypothetical protein  40.11 
 
 
181 aa  91.3  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260926  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1300  hypothetical protein  40.11 
 
 
181 aa  91.3  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0119759  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1662  hypothetical protein  40.68 
 
 
181 aa  87  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4787  hypothetical protein  38.98 
 
 
175 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171606  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1827  hypothetical protein  38.86 
 
 
195 aa  82  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.563205  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2068  hypothetical protein  39.2 
 
 
189 aa  82  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1312  hypothetical protein  50 
 
 
181 aa  81.3  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2977  hypothetical protein  40 
 
 
195 aa  80.5  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000274563  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0328  hypothetical protein  36.56 
 
 
227 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.86 
 
 
210 aa  79.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.43 
 
 
193 aa  72.4  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2979  hypothetical protein  35.39 
 
 
197 aa  72  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.220075 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3203  hypothetical protein  37.08 
 
 
197 aa  71.2  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.950597  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  33.52 
 
 
214 aa  70.9  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4741  hypothetical protein  40.24 
 
 
213 aa  67  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  36.47 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  37.7 
 
 
199 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2964  hypothetical protein  36.81 
 
 
196 aa  62  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2846  hypothetical protein  38.46 
 
 
193 aa  61.6  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449385  decreased coverage  0.00911048 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1881  hypothetical protein  40 
 
 
200 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  39.2 
 
 
197 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  33.88 
 
 
212 aa  56.6  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  26.28 
 
 
199 aa  56.6  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1689  hypothetical protein  36.54 
 
 
225 aa  56.6  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0654906  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  36.92 
 
 
195 aa  55.1  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0903  hypothetical protein  30.12 
 
 
216 aa  55.1  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.631928  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.31 
 
 
194 aa  54.3  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2205  hypothetical protein  21.6 
 
 
242 aa  54.3  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0530  hypothetical protein  34.16 
 
 
207 aa  54.3  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2658  hypothetical protein  32.59 
 
 
197 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421379  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  32.9 
 
 
538 aa  52  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0123  MobA-like protein  37.1 
 
 
190 aa  51.2  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.14106  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  28.22 
 
 
187 aa  50.1  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  29.23 
 
 
190 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2392  hypothetical protein  31.54 
 
 
207 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10350  hypothetical protein  37.74 
 
 
136 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  33.9 
 
 
188 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2512  hypothetical protein  27.5 
 
 
221 aa  50.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  29.8 
 
 
204 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  27.66 
 
 
389 aa  48.1  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  33.08 
 
 
192 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  33.71 
 
 
455 aa  48.1  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  31.18 
 
 
205 aa  48.1  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3196  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  34.78 
 
 
211 aa  47.8  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1224  MobA-like protein-like protein  21.55 
 
 
201 aa  47.8  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.607114  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3415  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  33.69 
 
 
191 aa  47.4  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  36.56 
 
 
191 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.83 
 
 
207 aa  47  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.92 
 
 
533 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  25 
 
 
195 aa  46.6  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.3 
 
 
202 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4310  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  42.55 
 
 
228 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.707183  normal  0.580614 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.19 
 
 
538 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4230  hypothetical protein  36.84 
 
 
188 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  35.26 
 
 
367 aa  45.8  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1079  molybdopterin biosynthesis enzyme  32.12 
 
 
218 aa  45.8  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  31.45 
 
 
191 aa  45.8  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  33.54 
 
 
575 aa  46.2  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4656  hypothetical protein  33.03 
 
 
203 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720744  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.52 
 
 
534 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3796  hypothetical protein  30.6 
 
 
185 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328726  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1634  MobA-like protein  36.84 
 
 
188 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  33.55 
 
 
544 aa  45.1  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.37 
 
 
202 aa  45.1  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  32.9 
 
 
534 aa  44.7  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  32.41 
 
 
210 aa  44.7  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.33 
 
 
533 aa  44.3  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  32.85 
 
 
208 aa  44.3  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.12 
 
 
208 aa  44.3  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0921  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  38 
 
 
200 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.370175  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5992  hypothetical protein  33.33 
 
 
195 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.361176 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4726  hypothetical protein  29.91 
 
 
195 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.048995 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.75 
 
 
197 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  38.02 
 
 
591 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1467  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  27.59 
 
 
368 aa  42.7  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700168  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05439  hypothetical protein  32.03 
 
 
199 aa  42.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232404  normal  0.0351098 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1816  metal dependent phosphohydrolase  33.07 
 
 
372 aa  42  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3453  metal dependent phosphohydrolase  27.66 
 
 
216 aa  42  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0984  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.36 
 
 
197 aa  41.6  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0360339  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1746  hypothetical protein  20.57 
 
 
191 aa  40.8  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2227  hypothetical protein  29.91 
 
 
195 aa  40.8  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1545  metal dependent phosphohydrolase  30.37 
 
 
393 aa  40.8  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>