223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2534 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  100 
 
 
193 aa  381  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2846  hypothetical protein  53.4 
 
 
193 aa  167  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449385  decreased coverage  0.00911048 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  51.06 
 
 
210 aa  161  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  52.38 
 
 
195 aa  158  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2977  hypothetical protein  52.3 
 
 
195 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000274563  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  45 
 
 
212 aa  143  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3415  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  47.92 
 
 
191 aa  141  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  43.01 
 
 
207 aa  131  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13070  uncharacterized MobA-like protein  47.25 
 
 
194 aa  125  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0328  hypothetical protein  42.93 
 
 
227 aa  124  8.000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  41.8 
 
 
455 aa  121  7e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4741  hypothetical protein  47.13 
 
 
213 aa  118  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1881  hypothetical protein  44.68 
 
 
200 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4967  hypothetical protein  45.99 
 
 
193 aa  117  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5126  hypothetical protein  45.56 
 
 
184 aa  115  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0199  hypothetical protein  43.92 
 
 
213 aa  115  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182952  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3196  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  40.59 
 
 
211 aa  112  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2799  hypothetical protein  43.41 
 
 
189 aa  100  9e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  33.5 
 
 
208 aa  96.3  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.5 
 
 
208 aa  95.9  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.98 
 
 
202 aa  95.5  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  32.12 
 
 
190 aa  95.1  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  36.13 
 
 
216 aa  94.4  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  40.11 
 
 
546 aa  94  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3203  hypothetical protein  38.37 
 
 
197 aa  92.4  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.950597  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  36.41 
 
 
534 aa  92  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  33.85 
 
 
534 aa  90.9  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.87 
 
 
533 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  37.3 
 
 
187 aa  88.2  7e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.71 
 
 
534 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.87 
 
 
533 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  35.98 
 
 
199 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3029  molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.97 
 
 
203 aa  86.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.098074  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  37.23 
 
 
211 aa  86.7  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1662  hypothetical protein  41.99 
 
 
181 aa  87  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0903  hypothetical protein  31.03 
 
 
216 aa  86.7  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.631928  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  31.25 
 
 
204 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3976  hypothetical protein  43.17 
 
 
185 aa  86.3  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326622  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2979  hypothetical protein  37.21 
 
 
197 aa  86.3  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.220075 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  41.5 
 
 
367 aa  85.5  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  35.45 
 
 
191 aa  85.5  5e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4787  hypothetical protein  39.34 
 
 
175 aa  84.7  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171606  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2037  hypothetical protein  34.39 
 
 
222 aa  84  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0186754  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0203  hypothetical protein  35.79 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.761699  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  39.13 
 
 
192 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  35.38 
 
 
534 aa  83.6  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1283  hypothetical protein  39.34 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260926  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.55 
 
 
204 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1300  hypothetical protein  39.34 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0119759  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4310  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  34.84 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.707183  normal  0.580614 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  34.17 
 
 
591 aa  78.6  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  35.86 
 
 
210 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  34.95 
 
 
544 aa  78.2  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  33.33 
 
 
188 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.77 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4770  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.43 
 
 
174 aa  77.4  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.53 
 
 
189 aa  77  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1779  hypothetical protein  33.51 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.95 
 
 
194 aa  75.5  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.94 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  33.33 
 
 
538 aa  75.5  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0225  hypothetical protein  36.32 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.633552  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10350  hypothetical protein  42.48 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  38.83 
 
 
191 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  32.63 
 
 
214 aa  74.7  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2964  hypothetical protein  39.56 
 
 
196 aa  73.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5450  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.51 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6199  hypothetical protein  37.33 
 
 
251 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.326394  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  35.18 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10376  hypothetical protein  33.16 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000126755  normal  0.572936 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1312  hypothetical protein  39.01 
 
 
181 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3432  metal dependent phosphohydrolase  28.35 
 
 
408 aa  72.8  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0793  hypothetical protein  34.78 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.69 
 
 
203 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  32.12 
 
 
575 aa  71.6  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  30.93 
 
 
200 aa  71.2  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  29.38 
 
 
389 aa  70.9  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.38 
 
 
533 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  32.58 
 
 
205 aa  70.1  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1757  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.04 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0825  MobA-like protein-like protein  32.12 
 
 
196 aa  70.1  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207801  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  34.36 
 
 
201 aa  70.1  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4204  MobA-like protein-like protein  25.26 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212178  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1188  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.6 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143953  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0984  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.04 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0360339  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2392  hypothetical protein  30.93 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1554  metal dependent phosphohydrolase  31.22 
 
 
370 aa  68.6  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.307535  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2512  hypothetical protein  31.34 
 
 
221 aa  68.9  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2068  hypothetical protein  34.66 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.32 
 
 
202 aa  67.8  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  28.04 
 
 
199 aa  68.2  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4230  hypothetical protein  30.81 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1634  MobA-like protein  31.31 
 
 
188 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2648  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.33 
 
 
213 aa  67  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2658  hypothetical protein  34.02 
 
 
197 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421379  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.41 
 
 
539 aa  66.2  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  30.24 
 
 
187 aa  66.2  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1894  hypothetical protein  30.96 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  24.48 
 
 
195 aa  65.5  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4656  hypothetical protein  33.33 
 
 
203 aa  65.1  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720744  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>