144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2979 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2979  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  387  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.220075 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3203  hypothetical protein  92.9 
 
 		 197 aa  308  2.9999999999999997e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.950597  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5126  hypothetical protein  50.94 
 
 		 184 aa  139  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0199  hypothetical protein  47.83 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182952  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4967  hypothetical protein  44.51 
 
 		 193 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  39.46 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  39.56 
 
 		 210 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4741  hypothetical protein  43.43 
 
 		 213 aa  108  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13070  uncharacterized MobA-like protein  40.8 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3415  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  39.9 
 
 		 191 aa  105  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2799  hypothetical protein  39.01 
 
 		 189 aa  96.3  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  35.64 
 
 		 212 aa  95.5  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2846  hypothetical protein  40.96 
 
 		 193 aa  94.7  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449385  decreased coverage  0.00911048 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  39.34 
 
 		 195 aa  94.4  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3976  hypothetical protein  39.89 
 
 		 185 aa  93.6  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326622  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0328  hypothetical protein  35.78 
 
 		 227 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  37.57 
 
 		 546 aa  90.1  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3196  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  33.84 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  28.22 
 
 		 204 aa  88.6  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.62 
 
 		 533 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4770  molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.64 
 
 		 174 aa  87.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  31.02 
 
 		 534 aa  84  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2977  hypothetical protein  37.57 
 
 		 195 aa  84.3  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000274563  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  32.97 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3029  molybdenum cofactor biosynthesis protein  38.62 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.098074  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.02 
 
 		 533 aa  81.3  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  30.85 
 
 		 534 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.95 
 
 		 534 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.33 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.89 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  31.85 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1881  hypothetical protein  36.22 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  29.19 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  30.43 
 
 		 455 aa  77.4  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  33.13 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  30.32 
 
 		 534 aa  75.9  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.43 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  31.89 
 
 		 544 aa  72.4  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1662  hypothetical protein  35.52 
 
 		 181 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4310  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  33.96 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.707183  normal  0.580614 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  32.42 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  29.38 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  30.16 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  30 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.82 
 
 		 539 aa  69.3  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  30.93 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  32.34 
 
 		 575 aa  68.9  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2037  hypothetical protein  34.25 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0186754  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.2 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  29.9 
 
 		 591 aa  68.2  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1283  hypothetical protein  35.36 
 
 		 181 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260926  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1300  hypothetical protein  35.36 
 
 		 181 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0119759  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.16 
 
 		 533 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  24.32 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  28.31 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1827  hypothetical protein  36.61 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.563205  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  29.35 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2392  hypothetical protein  26.34 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  29.82 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2068  hypothetical protein  34.67 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.04 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2658  hypothetical protein  29.65 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421379  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  31.94 
 
 		 538 aa  63.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4787  hypothetical protein  35.36 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1467  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  27.89 
 
 		 368 aa  61.6  0.000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700168  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.43 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0225  hypothetical protein  37.93 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.633552  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0123  MobA-like protein  30.94 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.14106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6199  hypothetical protein  31.16 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.326394  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2512  hypothetical protein  24.43 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.61 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.75 
 
 		 203 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1816  hypothetical protein  26.16 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  32.14 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0836  hypothetical protein  26.51 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  23.68 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0203  hypothetical protein  33.82 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.761699  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.43 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  26.47 
 
 		 389 aa  55.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  32.17 
 
 		 367 aa  55.8  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  25.97 
 
 		 187 aa  54.3  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3796  hypothetical protein  27.87 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328726  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1816  metal dependent phosphohydrolase  30.61 
 
 		 372 aa  54.3  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1757  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.99 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4167  hypothetical protein  29.47 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0348908  normal  0.0855326 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1433  hypothetical protein  32.52 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.170444 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2410  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.58 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1312  hypothetical protein  35.36 
 
 		 181 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.45 
 
 		 538 aa  52  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2695  hypothetical protein  28.37 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0332984  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2964  hypothetical protein  29.57 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1745  hypothetical protein  26.38 
 
 		 185 aa  51.2  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0825  MobA-like protein-like protein  29.95 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207801  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2489  hypothetical protein  27.23 
 
 		 192 aa  49.7  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.152259  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  30.43 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4204  MobA-like protein-like protein  22.64 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212178  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1006  metal dependent phosphohydrolase  28.11 
 
 		 373 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1224  MobA-like protein-like protein  21.89 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.607114  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1545  metal dependent phosphohydrolase  30.37 
 
 		 393 aa  49.7  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1381  MobA-like protein  28.89 
 
 		 293 aa  49.7  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.223593  normal  0.271333 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>