195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0886 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  371  1e-102  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0793  hypothetical protein  57.39 
 
 
207 aa  198  3.9999999999999996e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1779  hypothetical protein  57.23 
 
 
186 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  60.34 
 
 
191 aa  187  1e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  43.96 
 
 
455 aa  117  9e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  44.2 
 
 
214 aa  108  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.71 
 
 
202 aa  99.4  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  42.71 
 
 
534 aa  98.6  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  35.87 
 
 
216 aa  96.3  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  41.3 
 
 
533 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  43.48 
 
 
534 aa  96.3  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  42.93 
 
 
534 aa  95.1  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.91 
 
 
202 aa  94.4  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  39.67 
 
 
533 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.84 
 
 
538 aa  90.5  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  39.67 
 
 
534 aa  88.6  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  41.44 
 
 
207 aa  89  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  40.76 
 
 
533 aa  85.5  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.64 
 
 
189 aa  85.1  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.62 
 
 
208 aa  84.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.3 
 
 
193 aa  84.3  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  35.33 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5450  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  40.33 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.62 
 
 
194 aa  81.3  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  38.38 
 
 
575 aa  80.5  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  37.91 
 
 
538 aa  80.1  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  35.6 
 
 
546 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0123  MobA-like protein  37.23 
 
 
190 aa  78.2  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.14106  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2392  hypothetical protein  33.87 
 
 
207 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  30.65 
 
 
204 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  32.42 
 
 
187 aa  77.4  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  38.46 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  36.17 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.24 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.81 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.134734 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4726  hypothetical protein  37.5 
 
 
195 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.048995 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  28.57 
 
 
195 aa  75.5  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1554  metal dependent phosphohydrolase  31.84 
 
 
370 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.307535  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  35.11 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1707  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  36.36 
 
 
199 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1620  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  36.36 
 
 
199 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  38.46 
 
 
191 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  34.95 
 
 
211 aa  74.7  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1188  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.81 
 
 
197 aa  74.3  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143953  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1757  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  39.34 
 
 
199 aa  74.3  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0211  hypothetical protein  37.23 
 
 
346 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0194719  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3554  uncharacterized MobA-related protein  35.79 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4813  uncharacterized MobA-related protein  35.79 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.913909 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3790  uncharacterized MobA-related protein  40.52 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0141357 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5470  uncharacterized MobA-related protein  35.79 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0663776 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.97 
 
 
539 aa  73.6  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  38.02 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2205  hypothetical protein  28.74 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.59 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1199  hypothetical protein  36.76 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570343  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2846  hypothetical protein  33.89 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449385  decreased coverage  0.00911048 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3203  hypothetical protein  27.43 
 
 
192 aa  71.2  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3796  hypothetical protein  36.61 
 
 
185 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328726  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4167  hypothetical protein  28 
 
 
192 aa  71.2  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02710  hypothetical protein  26.29 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0815  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  26.29 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  33.7 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  33.7 
 
 
367 aa  70.9  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  35.94 
 
 
200 aa  70.5  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02672  hypothetical protein  26.29 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6027  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.04 
 
 
207 aa  70.5  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3037  hypothetical protein  26.29 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3010  hypothetical protein  26.29 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1881  hypothetical protein  37.85 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2658  hypothetical protein  34.21 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421379  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  32.45 
 
 
389 aa  68.6  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5992  hypothetical protein  33.69 
 
 
195 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.361176 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0890  uncharacterized MobA-related protein  34.21 
 
 
194 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.28742  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.4 
 
 
210 aa  68.2  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.55 
 
 
197 aa  68.2  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0530  hypothetical protein  33.16 
 
 
207 aa  68.2  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0984  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.26 
 
 
197 aa  67.8  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0360339  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2617  hypothetical protein  32.99 
 
 
196 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  32.78 
 
 
195 aa  67.4  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4230  hypothetical protein  36.32 
 
 
188 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2921  hypothetical protein  40 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.627898 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1634  MobA-like protein  36.32 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3029  molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.64 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.098074  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4656  hypothetical protein  34.92 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720744  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2712  MobA-like protein-like  26.2 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  32.61 
 
 
197 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  32.78 
 
 
198 aa  65.5  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4967  hypothetical protein  32.26 
 
 
193 aa  64.7  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4718  uncharacterized MobA-related protein-like protein  33.33 
 
 
194 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.819957 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4195  MobA-like protein-like protein  33.33 
 
 
194 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05439  hypothetical protein  38.68 
 
 
199 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232404  normal  0.0351098 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  29.61 
 
 
190 aa  63.2  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4167  hypothetical protein  37.38 
 
 
198 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0348908  normal  0.0855326 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2227  hypothetical protein  33.69 
 
 
195 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2928  hypothetical protein  40.95 
 
 
210 aa  62.4  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.796136  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1816  metal dependent phosphohydrolase  31.18 
 
 
372 aa  62  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21940  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase /glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase  35.48 
 
 
470 aa  61.6  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00311649 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2512  hypothetical protein  27.03 
 
 
221 aa  60.8  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  30.3 
 
 
212 aa  60.8  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2410  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.1 
 
 
194 aa  59.7  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>