126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_0815 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0815  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  100 
 
 		 192 aa  402  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02710  hypothetical protein  98.44 
 
 		 192 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3037  hypothetical protein  98.44 
 
 		 192 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02672  hypothetical protein  98.44 
 
 		 192 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3203  hypothetical protein  97.4 
 
 		 192 aa  393  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3010  hypothetical protein  96.35 
 
 		 192 aa  391  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4167  hypothetical protein  95.83 
 
 		 192 aa  390  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0831  hypothetical protein  99.42 
 
 		 171 aa  356  9.999999999999999e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1554  metal dependent phosphohydrolase  32.49 
 
 		 370 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.307535  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  29.38 
 
 		 389 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  25.27 
 
 		 367 aa  74.7  0.0000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2205  hypothetical protein  26.52 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1467  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  25.65 
 
 		 368 aa  72  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700168  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1816  metal dependent phosphohydrolase  27.55 
 
 		 372 aa  71.2  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  26.29 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  26.49 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.95 
 
 		 534 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  27.42 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  27.18 
 
 		 534 aa  67.8  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.67 
 
 		 533 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1816  hypothetical protein  27.81 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  29.79 
 
 		 534 aa  67  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.08 
 
 		 533 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  26.18 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  28.11 
 
 		 544 aa  65.1  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  25.13 
 
 		 455 aa  65.1  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  25.4 
 
 		 591 aa  65.1  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1006  metal dependent phosphohydrolase  28.42 
 
 		 373 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2695  hypothetical protein  27.23 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0332984  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1545  metal dependent phosphohydrolase  27.69 
 
 		 393 aa  64.7  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.8 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  25.4 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  26.6 
 
 		 534 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.45 
 
 		 539 aa  62.4  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3432  metal dependent phosphohydrolase  29.59 
 
 		 408 aa  61.6  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  27.37 
 
 		 538 aa  60.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1079  molybdopterin biosynthesis enzyme  28.5 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0036  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  26.87 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0903  hypothetical protein  30.26 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.631928  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1188  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.27 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3547  MobA-like protein-like  25 
 
 		 384 aa  58.2  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871069  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  24.87 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.29 
 
 		 533 aa  57.8  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  25 
 
 		 210 aa  57.8  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4204  MobA-like protein-like protein  24.73 
 
 		 204 aa  57.8  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212178  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.15 
 
 		 197 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.134734 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.21 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1746  hypothetical protein  27.89 
 
 		 191 aa  57  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4656  hypothetical protein  27.27 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  25.52 
 
 		 546 aa  57  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2037  hypothetical protein  28.47 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0186754  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0225  hypothetical protein  30 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.633552  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.7 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3796  hypothetical protein  28.11 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328726  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  25.98 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0228  uncharacterized MobA-related protein  27.57 
 
 		 363 aa  55.1  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0530  hypothetical protein  25.91 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  23.16 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  24.86 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0203  hypothetical protein  25.4 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.761699  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0825  MobA-like protein-like protein  26.56 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207801  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  24.35 
 
 		 538 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0838  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  26.83 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.044436  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.04 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2642  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  25 
 
 		 235 aa  53.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0395986 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0984  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.6 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0360339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  24.23 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  24.23 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.84 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3453  metal dependent phosphohydrolase  26.04 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0793  hypothetical protein  23.3 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.6 
 
 		 189 aa  51.6  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1779  hypothetical protein  22.6 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  22.92 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0780  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  24.51 
 
 		 478 aa  50.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.162723  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1816  metal dependent phosphohydrolase  24.5 
 
 		 423 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.445922  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1757  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.91 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2091  molybdopterin binding protein  33.64 
 
 		 202 aa  49.3  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.865191  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3385  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  22.86 
 
 		 483 aa  49.3  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  22.95 
 
 		 190 aa  48.5  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  22.87 
 
 		 575 aa  48.5  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4967  hypothetical protein  22.22 
 
 		 193 aa  48.5  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5450  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  25.95 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1062  formate dehydrogenase, subunit FdhD  25.13 
 
 		 479 aa  48.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0656292 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3370  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  25.27 
 
 		 487 aa  48.1  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3029  molybdenum cofactor biosynthesis protein  26.81 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.098074  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4726  hypothetical protein  22.16 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.048995 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  25.26 
 
 		 198 aa  46.2  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  24.47 
 
 		 188 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1571  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  23.23 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.915913  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2392  hypothetical protein  24.52 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0890  uncharacterized MobA-related protein  22.28 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.28742  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4019  hypothetical protein  29.36 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0410736 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0634  metal dependent phosphohydrolase  25.84 
 
 		 514 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0970853 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  23.76 
 
 		 191 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  25.34 
 
 		 199 aa  45.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2410  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  22.63 
 
 		 194 aa  45.1  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  26.88 
 
 		 200 aa  45.1  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1196  Nucleotidyl transferase  32.08 
 
 		 251 aa  45.1  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0836  hypothetical protein  23.23 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>