255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2020 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  376  1e-103  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1779  hypothetical protein  64.48 
 
 
186 aa  238  4e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0793  hypothetical protein  63.83 
 
 
207 aa  237  6.999999999999999e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  60.34 
 
 
187 aa  187  1e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.71 
 
 
189 aa  107  8.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  39.9 
 
 
455 aa  105  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1554  metal dependent phosphohydrolase  35.57 
 
 
370 aa  104  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.307535  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.77 
 
 
533 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.11 
 
 
533 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  41.27 
 
 
214 aa  99.4  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  39.06 
 
 
202 aa  99  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0123  MobA-like protein  42.29 
 
 
190 aa  97.1  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.14106  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.68 
 
 
208 aa  95.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.73 
 
 
539 aa  94.7  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  37.43 
 
 
575 aa  94.4  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  37.97 
 
 
534 aa  94.7  8e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  35.68 
 
 
208 aa  94.4  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  35.14 
 
 
534 aa  93.6  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  40.61 
 
 
207 aa  93.6  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2205  hypothetical protein  28.11 
 
 
242 aa  92.4  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.7 
 
 
534 aa  91.3  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  36.51 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  32.12 
 
 
187 aa  88.2  7e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.17 
 
 
533 aa  88.2  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  28.27 
 
 
195 aa  87.8  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  36.7 
 
 
534 aa  87.8  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.91 
 
 
208 aa  87.8  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.41 
 
 
210 aa  87.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  37.43 
 
 
546 aa  86.7  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.69 
 
 
202 aa  85.5  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  36.22 
 
 
538 aa  85.9  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  37.02 
 
 
212 aa  85.5  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  35.64 
 
 
188 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2921  hypothetical protein  35.75 
 
 
216 aa  83.2  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.627898 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.79 
 
 
194 aa  83.2  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4726  hypothetical protein  35.11 
 
 
195 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.048995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1757  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  44.44 
 
 
199 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0530  hypothetical protein  34.16 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2392  hypothetical protein  32.97 
 
 
207 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.45 
 
 
193 aa  80.9  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5470  uncharacterized MobA-related protein  40.34 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0663776 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3554  uncharacterized MobA-related protein  40.34 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  29.84 
 
 
216 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4813  uncharacterized MobA-related protein  40.34 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.913909 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2227  hypothetical protein  34.01 
 
 
195 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5450  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  41.53 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1634  MobA-like protein  37.7 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4230  hypothetical protein  37.17 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3796  hypothetical protein  35.68 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328726  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  33.52 
 
 
389 aa  78.2  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5992  hypothetical protein  34.39 
 
 
195 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.361176 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  33.15 
 
 
367 aa  77.8  0.00000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  36.26 
 
 
195 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0890  uncharacterized MobA-related protein  39.5 
 
 
194 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.28742  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2846  hypothetical protein  37.57 
 
 
193 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449385  decreased coverage  0.00911048 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  37.02 
 
 
192 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2977  hypothetical protein  39.18 
 
 
195 aa  76.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000274563  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1881  hypothetical protein  37.97 
 
 
200 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.51 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0825  MobA-like protein-like protein  37.43 
 
 
196 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207801  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2617  hypothetical protein  29.44 
 
 
196 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05439  hypothetical protein  33.84 
 
 
199 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232404  normal  0.0351098 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25820  hypothetical protein  34.9 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.708466  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2928  hypothetical protein  32.98 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.796136  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  27.64 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  32.79 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0358  hypothetical protein  34.18 
 
 
198 aa  72.4  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  32.09 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  32.79 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3790  uncharacterized MobA-related protein  38.66 
 
 
194 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0141357 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  32.24 
 
 
544 aa  72  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4167  hypothetical protein  33.33 
 
 
198 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0348908  normal  0.0855326 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2563  hypothetical protein  32.63 
 
 
200 aa  71.6  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.778302  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.44 
 
 
538 aa  71.6  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1894  hypothetical protein  33.33 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3555  hypothetical protein  30.21 
 
 
182 aa  70.9  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.919996  normal  0.404 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  32.98 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  37.02 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4656  hypothetical protein  31.58 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720744  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2410  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.27 
 
 
194 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4718  uncharacterized MobA-related protein-like protein  35.29 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.819957 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  32.49 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1707  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  36.36 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1620  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  36.36 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0211  hypothetical protein  36.36 
 
 
346 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0194719  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1433  hypothetical protein  34.86 
 
 
208 aa  68.6  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.170444 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2037  hypothetical protein  32.81 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0186754  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.26 
 
 
197 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.134734 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.56 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2658  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421379  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2695  hypothetical protein  33.86 
 
 
202 aa  66.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0332984  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1816  hypothetical protein  30.65 
 
 
200 aa  67  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4195  MobA-like protein-like protein  34.75 
 
 
194 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0243  MobA-like protein  28.08 
 
 
216 aa  67  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00192406  normal  0.367058 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4802  hypothetical protein  30.73 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394051  normal  0.300169 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1079  molybdopterin biosynthesis enzyme  31.47 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3725  hypothetical protein  30.73 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0418  hypothetical protein  37.1 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159486  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1199  hypothetical protein  35.98 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570343  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.16 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>