154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2928 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2928  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  413  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.796136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2921  hypothetical protein  63.08 
 
 		 216 aa  230  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.627898 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3555  hypothetical protein  42.13 
 
 		 182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.919996  normal  0.404 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2698  hypothetical protein  40.21 
 
 		 174 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2563  hypothetical protein  43.08 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.778302  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4167  hypothetical protein  39.8 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0348908  normal  0.0855326 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0867  hypothetical protein  36.36 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4019  hypothetical protein  36.27 
 
 		 194 aa  104  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0410736 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3725  hypothetical protein  37.56 
 
 		 198 aa  101  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4802  hypothetical protein  37.56 
 
 		 198 aa  101  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394051  normal  0.300169 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3943  hypothetical protein  40 
 
 		 190 aa  98.6  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00148213  normal  0.123195 
 
 
-
 
NC_003296  RS05439  hypothetical protein  39.5 
 
 		 199 aa  98.2  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232404  normal  0.0351098 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3712  hypothetical protein  38.02 
 
 		 188 aa  97.8  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1707  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  40.31 
 
 		 199 aa  92  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1620  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  40.31 
 
 		 199 aa  92  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0211  hypothetical protein  40.31 
 
 		 346 aa  91.3  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0194719  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3554  uncharacterized MobA-related protein  48.62 
 
 		 194 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4813  uncharacterized MobA-related protein  48.62 
 
 		 194 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.913909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5470  uncharacterized MobA-related protein  48.62 
 
 		 194 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0663776 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0890  uncharacterized MobA-related protein  47.71 
 
 		 194 aa  89.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.28742  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3790  uncharacterized MobA-related protein  49.54 
 
 		 194 aa  89.4  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0141357 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1199  hypothetical protein  39.9 
 
 		 199 aa  89.4  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570343  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0201  hypothetical protein  42.13 
 
 		 202 aa  88.6  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4726  hypothetical protein  36.27 
 
 		 195 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.048995 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25820  hypothetical protein  35.6 
 
 		 200 aa  85.9  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.708466  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4718  uncharacterized MobA-related protein-like protein  45.87 
 
 		 194 aa  85.9  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819957 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4195  MobA-like protein-like protein  45.87 
 
 		 194 aa  85.1  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  36.36 
 
 		 188 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0358  hypothetical protein  34.03 
 
 		 198 aa  84.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2205  hypothetical protein  28.93 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  36.36 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  38.1 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2658  hypothetical protein  33.85 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421379  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5992  hypothetical protein  42.34 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.361176 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.03 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.28 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  40 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0530  hypothetical protein  31.66 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.17 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.16 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.2 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  31.98 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2227  hypothetical protein  41.44 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4230  hypothetical protein  40 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  32.66 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1634  MobA-like protein  39.47 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1894  hypothetical protein  32.82 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3029  molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.78 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.098074  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2617  hypothetical protein  33.67 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  29.59 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  32.98 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  35.35 
 
 		 575 aa  73.2  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.65 
 
 		 533 aa  71.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.23 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  36.17 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.03 
 
 		 539 aa  70.5  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3796  hypothetical protein  34.47 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328726  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  32.14 
 
 		 534 aa  68.6  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2392  hypothetical protein  30.65 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  38.94 
 
 		 539 aa  68.6  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.16 
 
 		 534 aa  68.2  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.61 
 
 		 533 aa  68.2  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5193  hypothetical protein  35.27 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1816  metal dependent phosphohydrolase  34.54 
 
 		 372 aa  67.8  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  32.12 
 
 		 544 aa  68.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  33.68 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0418  hypothetical protein  42.11 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159486  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.73 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  29.23 
 
 		 389 aa  66.6  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  29.57 
 
 		 367 aa  66.6  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  23.24 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0123  MobA-like protein  40.54 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.14106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10376  hypothetical protein  34.03 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000126755  normal  0.572936 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  28.19 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4656  hypothetical protein  29.5 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1554  metal dependent phosphohydrolase  35.45 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.307535  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4204  MobA-like protein-like protein  25.25 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212178  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6199  hypothetical protein  41.41 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.326394  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  40.95 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.38 
 
 		 207 aa  62  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3432  metal dependent phosphohydrolase  28.4 
 
 		 408 aa  61.6  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2410  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.21 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  32.32 
 
 		 534 aa  61.2  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1816  hypothetical protein  25.62 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  32.99 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  30.24 
 
 		 591 aa  60.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4741  hypothetical protein  36.67 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0921  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  33.33 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.370175  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  30.41 
 
 		 538 aa  59.3  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  31.77 
 
 		 534 aa  58.9  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1779  hypothetical protein  35.14 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1881  hypothetical protein  34.34 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  29.44 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.63 
 
 		 533 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1381  MobA-like protein  30.51 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.223593  normal  0.271333 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  36.52 
 
 		 546 aa  57  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2489  hypothetical protein  30.16 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.152259  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.19 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  34.75 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0793  hypothetical protein  30.06 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>