141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2698 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2698  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  344  4e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3555  hypothetical protein  68.97 
 
 
182 aa  231  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.919996  normal  0.404 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0867  hypothetical protein  65.19 
 
 
185 aa  229  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3712  hypothetical protein  66.27 
 
 
188 aa  199  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2563  hypothetical protein  64.94 
 
 
200 aa  192  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.778302  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3943  hypothetical protein  60.45 
 
 
190 aa  177  5.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00148213  normal  0.123195 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2921  hypothetical protein  39.9 
 
 
216 aa  115  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.627898 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2928  hypothetical protein  40.21 
 
 
210 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.796136  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4019  hypothetical protein  33.16 
 
 
194 aa  94.4  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0410736 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4726  hypothetical protein  36.56 
 
 
195 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.048995 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0890  uncharacterized MobA-related protein  39.57 
 
 
194 aa  92  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.28742  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3554  uncharacterized MobA-related protein  39.57 
 
 
194 aa  91.7  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4813  uncharacterized MobA-related protein  39.57 
 
 
194 aa  91.7  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.913909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5470  uncharacterized MobA-related protein  39.57 
 
 
194 aa  91.7  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0663776 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5992  hypothetical protein  34.95 
 
 
195 aa  89.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.361176 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1707  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  39.36 
 
 
199 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1620  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  39.36 
 
 
199 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2227  hypothetical protein  34.41 
 
 
195 aa  85.5  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0211  hypothetical protein  39.36 
 
 
346 aa  85.1  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0194719  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3790  uncharacterized MobA-related protein  37.97 
 
 
194 aa  85.5  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0141357 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4718  uncharacterized MobA-related protein-like protein  37.43 
 
 
194 aa  85.5  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.819957 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25820  hypothetical protein  37.91 
 
 
200 aa  84.3  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.708466  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4195  MobA-like protein-like protein  37.1 
 
 
194 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0201  hypothetical protein  42.07 
 
 
202 aa  81.6  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1199  hypothetical protein  38.71 
 
 
199 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570343  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05439  hypothetical protein  33.51 
 
 
199 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232404  normal  0.0351098 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4167  hypothetical protein  33.69 
 
 
198 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0348908  normal  0.0855326 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2617  hypothetical protein  35.08 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3725  hypothetical protein  31.96 
 
 
198 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4802  hypothetical protein  31.96 
 
 
198 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394051  normal  0.300169 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0358  hypothetical protein  30.32 
 
 
198 aa  71.6  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  37.85 
 
 
192 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.12 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  31.89 
 
 
199 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0418  hypothetical protein  29.79 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159486  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  35.25 
 
 
367 aa  64.3  0.0000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1894  hypothetical protein  31.87 
 
 
199 aa  64.7  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  36.67 
 
 
191 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  28.65 
 
 
191 aa  63.2  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2658  hypothetical protein  31.87 
 
 
197 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421379  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2410  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.16 
 
 
194 aa  62  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0228  uncharacterized MobA-related protein  34.23 
 
 
363 aa  61.2  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2392  hypothetical protein  31.32 
 
 
207 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1634  MobA-like protein  33.85 
 
 
188 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4230  hypothetical protein  33.33 
 
 
188 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0530  hypothetical protein  30.77 
 
 
207 aa  57.8  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1554  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
370 aa  57.4  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.307535  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  32.43 
 
 
188 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1757  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.63 
 
 
199 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  29.32 
 
 
214 aa  55.1  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3796  hypothetical protein  33.87 
 
 
185 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328726  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  30.97 
 
 
389 aa  54.3  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1700  hypothetical protein  33.15 
 
 
186 aa  53.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.361045  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0360  hypothetical protein  25.41 
 
 
190 aa  52.8  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000717889  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  34.51 
 
 
197 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0091  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  28.89 
 
 
453 aa  53.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  30.89 
 
 
455 aa  52.4  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  32.8 
 
 
591 aa  52.8  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1582  metal dependent phosphohydrolase  35.21 
 
 
459 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.53 
 
 
204 aa  52  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2205  hypothetical protein  23.5 
 
 
242 aa  52  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  27.87 
 
 
187 aa  51.6  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0243  MobA-like protein  23.92 
 
 
216 aa  51.6  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00192406  normal  0.367058 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1816  hypothetical protein  26.55 
 
 
200 aa  50.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.67 
 
 
539 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0279  hypothetical protein  26.24 
 
 
218 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6027  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.08 
 
 
207 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0123  MobA-like protein  30 
 
 
190 aa  49.7  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.14106  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  28.11 
 
 
544 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  32.16 
 
 
201 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0836  hypothetical protein  28.29 
 
 
196 aa  48.9  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3547  MobA-like protein-like  31.08 
 
 
384 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  29.1 
 
 
216 aa  48.9  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  25.81 
 
 
189 aa  48.9  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.95 
 
 
197 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.134734 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  30.27 
 
 
534 aa  48.5  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1006  metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 
373 aa  48.5  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1079  molybdopterin biosynthesis enzyme  31.96 
 
 
218 aa  48.1  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.65 
 
 
533 aa  48.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.98 
 
 
202 aa  47.8  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.65 
 
 
533 aa  47.8  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  31.77 
 
 
187 aa  47.8  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3432  metal dependent phosphohydrolase  30.09 
 
 
408 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1816  metal dependent phosphohydrolase  29.91 
 
 
372 aa  47.4  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4656  hypothetical protein  27.23 
 
 
203 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720744  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2742  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase / glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase  26.83 
 
 
476 aa  45.8  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.19388 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  28.35 
 
 
575 aa  45.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2079  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  27.66 
 
 
462 aa  45.4  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  28.12 
 
 
534 aa  45.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4039  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase / glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase  31.67 
 
 
474 aa  45.1  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.723724 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0984  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.05 
 
 
197 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0360339  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.19 
 
 
534 aa  44.7  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0793  hypothetical protein  26.56 
 
 
207 aa  44.3  0.0008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0521  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  24.11 
 
 
450 aa  43.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000119793  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0534  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  24.11 
 
 
450 aa  43.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000311964  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4167  hypothetical protein  27.27 
 
 
192 aa  43.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  23.29 
 
 
195 aa  43.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3303  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase / diamine N-acetyltransferase  31.09 
 
 
459 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3203  hypothetical protein  26.36 
 
 
192 aa  43.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.52 
 
 
194 aa  43.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.905629 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>