153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4195 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4195  MobA-like protein-like protein  100 
 
 		 194 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4718  uncharacterized MobA-related protein-like protein  99.48 
 
 		 194 aa  371  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819957 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3554  uncharacterized MobA-related protein  91.71 
 
 		 194 aa  319  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4813  uncharacterized MobA-related protein  91.71 
 
 		 194 aa  319  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.913909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5470  uncharacterized MobA-related protein  91.71 
 
 		 194 aa  319  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0663776 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0890  uncharacterized MobA-related protein  91.19 
 
 		 194 aa  318  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.28742  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3790  uncharacterized MobA-related protein  89.12 
 
 		 194 aa  297  7e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0141357 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0211  hypothetical protein  72.54 
 
 		 346 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0194719  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1707  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  72.54 
 
 		 199 aa  250  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1620  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  72.54 
 
 		 199 aa  250  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1199  hypothetical protein  73.58 
 
 		 199 aa  239  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570343  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5992  hypothetical protein  67.88 
 
 		 195 aa  236  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.361176 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4726  hypothetical protein  64.25 
 
 		 195 aa  236  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.048995 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2227  hypothetical protein  67.36 
 
 		 195 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4802  hypothetical protein  56.77 
 
 		 198 aa  184  6e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394051  normal  0.300169 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3725  hypothetical protein  56.77 
 
 		 198 aa  184  6e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05439  hypothetical protein  59.07 
 
 		 199 aa  180  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232404  normal  0.0351098 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0358  hypothetical protein  50.26 
 
 		 198 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0418  hypothetical protein  48.94 
 
 		 201 aa  149  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159486  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1894  hypothetical protein  42.41 
 
 		 199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  48.15 
 
 		 192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0201  hypothetical protein  45.26 
 
 		 202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  41.36 
 
 		 199 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2921  hypothetical protein  39.58 
 
 		 216 aa  104  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.627898 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  46.28 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2617  hypothetical protein  41.75 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  37.56 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2392  hypothetical protein  40 
 
 		 207 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4019  hypothetical protein  34.87 
 
 		 194 aa  97.4  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0410736 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4167  hypothetical protein  45.45 
 
 		 198 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0348908  normal  0.0855326 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25820  hypothetical protein  42.93 
 
 		 200 aa  95.1  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.708466  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1634  MobA-like protein  36.76 
 
 		 188 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2658  hypothetical protein  36.7 
 
 		 197 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421379  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  38.92 
 
 		 188 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3555  hypothetical protein  39.27 
 
 		 182 aa  90.9  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.919996  normal  0.404 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4230  hypothetical protein  35.68 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  39.36 
 
 		 197 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2928  hypothetical protein  35 
 
 		 210 aa  87  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.796136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  35.29 
 
 		 216 aa  85.5  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2698  hypothetical protein  37.1 
 
 		 174 aa  84  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3796  hypothetical protein  37.77 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328726  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0530  hypothetical protein  36.98 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.82 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.150492 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.96 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  35.26 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.23 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0123  MobA-like protein  37.16 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.14106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  35.64 
 
 		 534 aa  78.2  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  33.51 
 
 		 534 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.86 
 
 		 534 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3712  hypothetical protein  45.45 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  32.45 
 
 		 534 aa  74.7  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2205  hypothetical protein  27.47 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.86 
 
 		 533 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  34.22 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  36.14 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  34.04 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0867  hypothetical protein  35.23 
 
 		 185 aa  72  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  32.98 
 
 		 191 aa  72  0.000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.92 
 
 		 533 aa  71.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  35.29 
 
 		 538 aa  71.6  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  30.05 
 
 		 389 aa  70.5  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4015  hypothetical protein  34.57 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  32.52 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2563  hypothetical protein  35.64 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.778302  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  35.14 
 
 		 544 aa  70.1  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.8 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  31.72 
 
 		 455 aa  68.6  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  33.16 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.23 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  33.33 
 
 		 575 aa  67.4  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1779  hypothetical protein  31.89 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.11 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.45 
 
 		 539 aa  66.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3943  hypothetical protein  36.7 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00148213  normal  0.123195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4741  hypothetical protein  36.9 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  34.72 
 
 		 539 aa  64.3  0.0000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.38 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13070  uncharacterized MobA-like protein  36.14 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4656  hypothetical protein  36.46 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6027  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.05 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  31.05 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  31.18 
 
 		 591 aa  60.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3432  metal dependent phosphohydrolase  27.23 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  32.69 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  29.95 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0825  MobA-like protein-like protein  33.33 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207801  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.16 
 
 		 538 aa  59.7  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0793  hypothetical protein  30.98 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2512  hypothetical protein  28.93 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2846  hypothetical protein  37.6 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449385  decreased coverage  0.00911048 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1816  metal dependent phosphohydrolase  28.95 
 
 		 372 aa  58.9  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  34.92 
 
 		 546 aa  58.5  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.8 
 
 		 533 aa  58.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.13 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  25.6 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1746  hypothetical protein  27.67 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0203  hypothetical protein  34.27 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.761699  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1757  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.5 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1467  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  26.04 
 
 		 368 aa  56.2  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>