170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2512 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2512  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  454  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0279  hypothetical protein  40.2 
 
 		 218 aa  131  9e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2951  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  34.2 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  31.47 
 
 		 216 aa  95.5  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2712  MobA-like protein-like  30.53 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1413  hypothetical protein  34.5 
 
 		 202 aa  94  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0598562  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  32.86 
 
 		 197 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.57 
 
 		 202 aa  85.1  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  31.16 
 
 		 534 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  32.5 
 
 		 205 aa  84.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  30.53 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  32 
 
 		 534 aa  83.2  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  28.43 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  27.96 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  28.27 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.48 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4204  MobA-like protein-like protein  25.62 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212178  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  26.94 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.76 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  31.09 
 
 		 538 aa  74.3  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1438  hypothetical protein  32.24 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1833  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  28.16 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.36996 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3432  metal dependent phosphohydrolase  27 
 
 		 408 aa  72.8  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1989  hypothetical protein  30.89 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2799  hypothetical protein  31.05 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  26.02 
 
 		 455 aa  71.2  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.32 
 
 		 533 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.92 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2489  hypothetical protein  31.44 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.152259  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2748  hypothetical protein  30.37 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.668199  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2824  hypothetical protein  30.37 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0559762 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.1 
 
 		 534 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1495  hypothetical protein  30.45 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13070  uncharacterized MobA-like protein  28.42 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.61 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1628  hypothetical protein  31.19 
 
 		 245 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00936248 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2658  hypothetical protein  29.84 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421379  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.4 
 
 		 189 aa  68.2  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0036  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  27.75 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  28.21 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2731  hypothetical protein  31.22 
 
 		 245 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.64 
 
 		 533 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3050  hypothetical protein  32.27 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2426  hypothetical protein  28.91 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  32.98 
 
 		 544 aa  66.6  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4310  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  28.51 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.707183  normal  0.580614 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.29 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.57 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  25.74 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  28.8 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2617  hypothetical protein  33.16 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  29.02 
 
 		 534 aa  65.1  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0123  MobA-like protein  29 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.14106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0836  hypothetical protein  26.26 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02165  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  23.05 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.892695  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  24.21 
 
 		 389 aa  63.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2641  MobA-related protein  28.57 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  28.12 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.29 
 
 		 538 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  25.4 
 
 		 575 aa  62.8  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  31.28 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  24.76 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.55 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2225  hypothetical protein  28.51 
 
 		 235 aa  62  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0360  hypothetical protein  25.26 
 
 		 190 aa  62  0.000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000717889  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  26.9 
 
 		 546 aa  61.6  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  27.03 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  24.12 
 
 		 191 aa  61.2  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1433  hypothetical protein  29.53 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.170444 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2695  hypothetical protein  26.42 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0332984  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3437  hypothetical protein  28.57 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.631868 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4718  uncharacterized MobA-related protein-like protein  33.33 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819957 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1700  hypothetical protein  30.37 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.361045  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4787  hypothetical protein  27.66 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0199  hypothetical protein  28.42 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182952  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3196  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  30.32 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  28.95 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1881  hypothetical protein  30.58 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2977  hypothetical protein  27.47 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000274563  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0921  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  31.31 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.370175  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2392  hypothetical protein  28.16 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3415  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  30.37 
 
 		 191 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3029  molybdenum cofactor biosynthesis protein  26.7 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.098074  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.11 
 
 		 539 aa  57.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5470  uncharacterized MobA-related protein  36.84 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0663776 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0890  uncharacterized MobA-related protein  33.33 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.28742  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3554  uncharacterized MobA-related protein  36.84 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4195  MobA-like protein-like protein  32.43 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4813  uncharacterized MobA-related protein  36.84 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.913909 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  25.6 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0203  hypothetical protein  26.97 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.761699  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1224  MobA-like protein-like protein  24.37 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.607114  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2921  hypothetical protein  28.8 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.627898 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0530  hypothetical protein  28.57 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2267  hypothetical protein  26.11 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.311902 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4656  hypothetical protein  26.29 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2846  hypothetical protein  25.13 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449385  decreased coverage  0.00911048 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.75 
 
 		 533 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1662  hypothetical protein  29.57 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1745  hypothetical protein  24.34 
 
 		 185 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>