211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_61110 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  96.86 
 
 
191 aa  339  1e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  55.14 
 
 
188 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  53.85 
 
 
199 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2392  hypothetical protein  50.81 
 
 
207 aa  180  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2658  hypothetical protein  52.75 
 
 
197 aa  176  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421379  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3796  hypothetical protein  56.28 
 
 
185 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328726  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1634  MobA-like protein  54.05 
 
 
188 aa  167  9e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4230  hypothetical protein  52.97 
 
 
188 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0530  hypothetical protein  50.79 
 
 
207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  49.18 
 
 
197 aa  145  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1894  hypothetical protein  43.39 
 
 
199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3554  uncharacterized MobA-related protein  50.26 
 
 
194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4813  uncharacterized MobA-related protein  50.26 
 
 
194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.913909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5470  uncharacterized MobA-related protein  50.26 
 
 
194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0663776 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4195  MobA-like protein-like protein  48.15 
 
 
194 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4718  uncharacterized MobA-related protein-like protein  48.15 
 
 
194 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.819957 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2227  hypothetical protein  44.92 
 
 
195 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3790  uncharacterized MobA-related protein  49.47 
 
 
194 aa  105  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0141357 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4726  hypothetical protein  43.85 
 
 
195 aa  105  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.048995 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0890  uncharacterized MobA-related protein  47.34 
 
 
194 aa  105  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.28742  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4802  hypothetical protein  41.03 
 
 
198 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394051  normal  0.300169 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3725  hypothetical protein  41.03 
 
 
198 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1707  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  45.69 
 
 
199 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1620  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  45.69 
 
 
199 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0211  hypothetical protein  45.6 
 
 
346 aa  101  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0194719  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  39.58 
 
 
534 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5992  hypothetical protein  44.39 
 
 
195 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.361176 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  38.34 
 
 
214 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1199  hypothetical protein  45.69 
 
 
199 aa  99  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570343  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0358  hypothetical protein  40.1 
 
 
198 aa  99.4  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  36.98 
 
 
534 aa  97.1  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  37.84 
 
 
544 aa  95.9  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.02 
 
 
533 aa  95.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2921  hypothetical protein  38.22 
 
 
216 aa  95.5  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.627898 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0123  MobA-like protein  42.86 
 
 
190 aa  94.7  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.14106  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.98 
 
 
533 aa  93.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25820  hypothetical protein  41.03 
 
 
200 aa  94  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.708466  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4167  hypothetical protein  38.42 
 
 
198 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0348908  normal  0.0855326 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2617  hypothetical protein  39.36 
 
 
196 aa  93.6  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  38.42 
 
 
575 aa  92  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.13 
 
 
202 aa  91.3  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_003296  RS05439  hypothetical protein  40.41 
 
 
199 aa  89.7  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232404  normal  0.0351098 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  34.9 
 
 
534 aa  87.8  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  41.03 
 
 
539 aa  87  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  35.94 
 
 
534 aa  86.3  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.48 
 
 
204 aa  85.1  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  26.92 
 
 
195 aa  84.7  8e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0199  hypothetical protein  39.29 
 
 
213 aa  84  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182952  normal  0.0242772 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.03 
 
 
189 aa  82.8  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0201  hypothetical protein  39.68 
 
 
202 aa  83.2  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  39.13 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4015  hypothetical protein  39.2 
 
 
233 aa  81.3  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  34.97 
 
 
389 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.46 
 
 
533 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  36.22 
 
 
216 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2928  hypothetical protein  38.1 
 
 
210 aa  80.5  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.796136  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  39.46 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2205  hypothetical protein  33.6 
 
 
242 aa  79.7  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  31.87 
 
 
187 aa  80.5  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  34.55 
 
 
455 aa  79.3  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13070  uncharacterized MobA-like protein  36.36 
 
 
194 aa  79.3  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0418  hypothetical protein  35.71 
 
 
201 aa  78.6  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159486  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.26 
 
 
202 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.7 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.16 
 
 
539 aa  78.2  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  38.17 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  38.14 
 
 
212 aa  77  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  38.46 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  37.02 
 
 
191 aa  77  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1224  MobA-like protein-like protein  22.11 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.607114  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  31.06 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5126  hypothetical protein  37.29 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1881  hypothetical protein  41.4 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.43 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.38 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.134734 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0279  hypothetical protein  27.78 
 
 
218 aa  72.4  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2799  hypothetical protein  38.07 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2698  hypothetical protein  37.85 
 
 
174 aa  71.6  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  36.63 
 
 
538 aa  71.2  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.08 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  37.5 
 
 
546 aa  70.1  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1079  molybdopterin biosynthesis enzyme  33.94 
 
 
218 aa  69.7  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2979  hypothetical protein  39.09 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.220075 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0793  hypothetical protein  32.78 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4741  hypothetical protein  42.98 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1779  hypothetical protein  33.15 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3203  hypothetical protein  40 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.950597  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  32 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  33.33 
 
 
208 aa  68.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.33 
 
 
208 aa  68.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4967  hypothetical protein  39.34 
 
 
193 aa  68.2  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2648  molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.02 
 
 
213 aa  67.8  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4019  hypothetical protein  32.46 
 
 
194 aa  67.8  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0410736 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0328  hypothetical protein  38.64 
 
 
227 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3432  metal dependent phosphohydrolase  28.65 
 
 
408 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  37.31 
 
 
195 aa  67  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3555  hypothetical protein  33.87 
 
 
182 aa  64.7  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.919996  normal  0.404 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1260  xanthine dehydrogenase accessory protein pucB  34.59 
 
 
212 aa  64.7  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10376  hypothetical protein  31.72 
 
 
197 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000126755  normal  0.572936 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>