211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3796 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3796  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328726  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  76.76 
 
 		 188 aa  283  8e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4230  hypothetical protein  78.26 
 
 		 188 aa  268  4e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1634  MobA-like protein  78.26 
 
 		 188 aa  267  5e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  56.28 
 
 		 192 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  57.38 
 
 		 191 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2658  hypothetical protein  50.27 
 
 		 197 aa  174  8e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421379  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2392  hypothetical protein  48.63 
 
 		 207 aa  174  8e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  49.18 
 
 		 199 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0530  hypothetical protein  48.95 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  48.11 
 
 		 197 aa  152  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4802  hypothetical protein  39.8 
 
 		 198 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394051  normal  0.300169 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3725  hypothetical protein  39.8 
 
 		 198 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1894  hypothetical protein  37.3 
 
 		 199 aa  107  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  37.37 
 
 		 575 aa  102  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05439  hypothetical protein  46.97 
 
 		 199 aa  100  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232404  normal  0.0351098 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0123  MobA-like protein  40.98 
 
 		 190 aa  95.1  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.14106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1707  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  39.68 
 
 		 199 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1620  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  39.68 
 
 		 199 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0211  hypothetical protein  39.15 
 
 		 346 aa  89.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0194719  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4726  hypothetical protein  38.3 
 
 		 195 aa  89.4  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.048995 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  31.67 
 
 		 214 aa  88.6  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4167  hypothetical protein  38.34 
 
 		 198 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0348908  normal  0.0855326 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  35.68 
 
 		 191 aa  87  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1079  molybdopterin biosynthesis enzyme  34.69 
 
 		 218 aa  85.9  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  38.22 
 
 		 546 aa  85.1  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3554  uncharacterized MobA-related protein  42.76 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4813  uncharacterized MobA-related protein  42.76 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.913909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5470  uncharacterized MobA-related protein  42.76 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0663776 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.17 
 
 		 538 aa  84.3  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25820  hypothetical protein  37.31 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.708466  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  35 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0890  uncharacterized MobA-related protein  37.77 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.28742  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  34.2 
 
 		 534 aa  83.6  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4195  MobA-like protein-like protein  37.77 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4718  uncharacterized MobA-related protein-like protein  37.77 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819957 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3790  uncharacterized MobA-related protein  43.65 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0141357 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.51 
 
 		 534 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2617  hypothetical protein  34.74 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5992  hypothetical protein  40.94 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.361176 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0358  hypothetical protein  35.08 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  37.16 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1757  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.63 
 
 		 199 aa  77.8  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.86 
 
 		 194 aa  77.8  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.65 
 
 		 204 aa  77.8  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  27.03 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  33.52 
 
 		 455 aa  77.4  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2921  hypothetical protein  33.51 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.627898 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.22 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1199  hypothetical protein  38.62 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570343  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  32.62 
 
 		 544 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2227  hypothetical protein  41.6 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2928  hypothetical protein  34.47 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.796136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0793  hypothetical protein  33.15 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  34.69 
 
 		 539 aa  74.7  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.58 
 
 		 539 aa  74.3  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  36.27 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.75 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.31 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  35.45 
 
 		 538 aa  73.6  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  31.05 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.04 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4015  hypothetical protein  35.11 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30 
 
 		 533 aa  71.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.41 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.89 
 
 		 533 aa  71.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2799  hypothetical protein  33.87 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0328  hypothetical protein  35.34 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1779  hypothetical protein  31.32 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  31.94 
 
 		 534 aa  69.3  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.2 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0201  hypothetical protein  34.41 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  30 
 
 		 534 aa  68.2  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  31.38 
 
 		 389 aa  68.2  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0418  hypothetical protein  36.56 
 
 		 201 aa  67.8  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159486  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3453  metal dependent phosphohydrolase  30.53 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1381  MobA-like protein  34.39 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.223593  normal  0.271333 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  27.46 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2037  hypothetical protein  34.22 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0186754  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0203  hypothetical protein  34.95 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.761699  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3555  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.919996  normal  0.404 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2205  hypothetical protein  27.22 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2489  hypothetical protein  29.73 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.152259  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4019  hypothetical protein  31.09 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0410736 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.95 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  33.87 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  34.9 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1224  MobA-like protein-like protein  22.34 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.607114  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13070  uncharacterized MobA-like protein  34.46 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2698  hypothetical protein  33.87 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0279  hypothetical protein  25.63 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  30.11 
 
 		 367 aa  62.8  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3196  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  34.16 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  37.7 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4741  hypothetical protein  33.53 
 
 		 213 aa  62  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6027  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.6 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2846  hypothetical protein  33.88 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449385  decreased coverage  0.00911048 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5126  hypothetical protein  34.76 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1006  metal dependent phosphohydrolase  33.68 
 
 		 373 aa  61.6  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4967  hypothetical protein  36.02 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>