131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_25820 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_25820  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  390  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.708466  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4167  hypothetical protein  52.31 
 
 
198 aa  205  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0348908  normal  0.0855326 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4019  hypothetical protein  39.25 
 
 
194 aa  117  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0410736 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1894  hypothetical protein  40 
 
 
199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4726  hypothetical protein  42.71 
 
 
195 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.048995 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2227  hypothetical protein  44.21 
 
 
195 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5992  hypothetical protein  43.68 
 
 
195 aa  102  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.361176 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1707  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  43.68 
 
 
199 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1620  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  43.68 
 
 
199 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05439  hypothetical protein  48.33 
 
 
199 aa  98.2  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232404  normal  0.0351098 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0211  hypothetical protein  43.55 
 
 
346 aa  97.8  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0194719  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3554  uncharacterized MobA-related protein  42.63 
 
 
194 aa  95.5  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4813  uncharacterized MobA-related protein  42.63 
 
 
194 aa  95.5  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.913909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5470  uncharacterized MobA-related protein  42.63 
 
 
194 aa  95.5  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0663776 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0890  uncharacterized MobA-related protein  43.98 
 
 
194 aa  94  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.28742  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3725  hypothetical protein  38.46 
 
 
198 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  41.03 
 
 
192 aa  94  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4802  hypothetical protein  38.46 
 
 
198 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394051  normal  0.300169 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0123  MobA-like protein  40.74 
 
 
190 aa  92  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.14106  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1199  hypothetical protein  42.63 
 
 
199 aa  90.9  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570343  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3790  uncharacterized MobA-related protein  50.91 
 
 
194 aa  90.5  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0141357 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4195  MobA-like protein-like protein  44.68 
 
 
194 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4718  uncharacterized MobA-related protein-like protein  44.68 
 
 
194 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.819957 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  41.54 
 
 
191 aa  89  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2921  hypothetical protein  35.94 
 
 
216 aa  89  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.627898 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2392  hypothetical protein  35.71 
 
 
207 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0358  hypothetical protein  35.9 
 
 
198 aa  85.5  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2928  hypothetical protein  35.6 
 
 
210 aa  85.9  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.796136  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0201  hypothetical protein  39.8 
 
 
202 aa  85.1  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  35.07 
 
 
214 aa  84.7  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3712  hypothetical protein  38.95 
 
 
188 aa  84.7  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2698  hypothetical protein  37.91 
 
 
174 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3555  hypothetical protein  34.72 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.919996  normal  0.404 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.65 
 
 
204 aa  81.6  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  35.71 
 
 
188 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0867  hypothetical protein  35.26 
 
 
185 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3796  hypothetical protein  37.31 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328726  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0418  hypothetical protein  36.32 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159486  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0530  hypothetical protein  36.95 
 
 
207 aa  76.6  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4230  hypothetical protein  37.76 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3943  hypothetical protein  36.6 
 
 
190 aa  75.1  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00148213  normal  0.123195 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35 
 
 
533 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1634  MobA-like protein  37.24 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  34.9 
 
 
191 aa  73.6  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.21 
 
 
202 aa  71.6  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2563  hypothetical protein  36.02 
 
 
200 aa  70.9  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.778302  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.68 
 
 
533 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1779  hypothetical protein  36.98 
 
 
186 aa  70.5  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  36.87 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  30.77 
 
 
216 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0793  hypothetical protein  36.84 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  33.16 
 
 
199 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  34.33 
 
 
534 aa  67.8  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2658  hypothetical protein  39.64 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421379  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.33 
 
 
534 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2617  hypothetical protein  34.36 
 
 
196 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.73 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  34.33 
 
 
575 aa  65.1  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  24.74 
 
 
195 aa  64.7  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  31 
 
 
534 aa  64.7  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  25.91 
 
 
189 aa  63.9  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.72 
 
 
197 aa  64.3  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  32.82 
 
 
197 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  31.16 
 
 
455 aa  63.2  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  39.2 
 
 
207 aa  62.8  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.66 
 
 
539 aa  63.2  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1079  molybdopterin biosynthesis enzyme  33.33 
 
 
218 aa  62.4  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  30.89 
 
 
187 aa  62  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1881  hypothetical protein  37.56 
 
 
200 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2410  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.29 
 
 
194 aa  60.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  30 
 
 
534 aa  60.5  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  38.18 
 
 
539 aa  60.1  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  31.82 
 
 
544 aa  60.1  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.85 
 
 
208 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2205  hypothetical protein  24.56 
 
 
242 aa  60.5  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  37.74 
 
 
187 aa  59.7  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  29.7 
 
 
208 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  35.34 
 
 
546 aa  58.5  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.71 
 
 
208 aa  58.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0360  hypothetical protein  23.98 
 
 
190 aa  57.8  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000717889  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  30.35 
 
 
210 aa  57  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  34.58 
 
 
367 aa  56.6  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30 
 
 
533 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  32.43 
 
 
389 aa  53.9  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0825  MobA-like protein-like protein  33.62 
 
 
196 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207801  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0279  hypothetical protein  26.87 
 
 
218 aa  53.9  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  29.07 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1554  metal dependent phosphohydrolase  33.65 
 
 
370 aa  51.6  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.307535  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0203  hypothetical protein  26.89 
 
 
203 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.761699  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1816  metal dependent phosphohydrolase  23.76 
 
 
372 aa  51.2  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5193  hypothetical protein  47.14 
 
 
211 aa  50.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  34.86 
 
 
591 aa  50.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1006  metal dependent phosphohydrolase  27.09 
 
 
373 aa  50.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.5 
 
 
197 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.134734 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1224  MobA-like protein-like protein  21.08 
 
 
201 aa  48.9  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.607114  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4015  hypothetical protein  35.16 
 
 
233 aa  48.9  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.17 
 
 
203 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1188  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.12 
 
 
197 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143953  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0921  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  32.12 
 
 
200 aa  48.1  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.370175  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2712  MobA-like protein-like  26.8 
 
 
208 aa  48.1  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>