More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2771 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  100 
 
 
210 aa  418  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  48.21 
 
 
533 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  47.09 
 
 
539 aa  168  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  46.39 
 
 
534 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  46.15 
 
 
533 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  46.35 
 
 
534 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  44.04 
 
 
534 aa  150  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  46.67 
 
 
533 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  42.05 
 
 
534 aa  148  5e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0036  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  42.35 
 
 
225 aa  148  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  39.41 
 
 
202 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  44.06 
 
 
546 aa  144  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  44.28 
 
 
455 aa  144  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  42.78 
 
 
575 aa  144  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  41.33 
 
 
200 aa  134  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  43.65 
 
 
208 aa  132  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2091  molybdopterin binding protein  43.08 
 
 
202 aa  132  5e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.865191  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  42.05 
 
 
544 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  42.93 
 
 
202 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.27 
 
 
194 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  40.91 
 
 
538 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  43.72 
 
 
539 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2695  hypothetical protein  42.19 
 
 
202 aa  120  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0332984  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  41.62 
 
 
211 aa  112  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0825  MobA-like protein-like protein  43.98 
 
 
196 aa  111  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207801  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  35.32 
 
 
214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1188  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  41.84 
 
 
197 aa  108  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143953  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1757  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  43.07 
 
 
199 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.08 
 
 
197 aa  106  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.33 
 
 
204 aa  105  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  35.86 
 
 
216 aa  104  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1816  hypothetical protein  34.18 
 
 
200 aa  104  9e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4656  hypothetical protein  38.54 
 
 
203 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720744  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  40.31 
 
 
203 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  34.54 
 
 
389 aa  102  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  40.82 
 
 
197 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.134734 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.12 
 
 
207 aa  102  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0984  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  41.5 
 
 
197 aa  102  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0360339  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5450  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  41.38 
 
 
201 aa  102  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3453  metal dependent phosphohydrolase  31.47 
 
 
216 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1545  metal dependent phosphohydrolase  33.51 
 
 
393 aa  101  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3432  metal dependent phosphohydrolase  33.67 
 
 
408 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1006  metal dependent phosphohydrolase  34.01 
 
 
373 aa  99.8  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1467  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  29.65 
 
 
368 aa  98.6  6e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700168  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  31.73 
 
 
205 aa  97.1  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1079  molybdopterin biosynthesis enzyme  38.25 
 
 
218 aa  95.9  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0921  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  38.78 
 
 
200 aa  95.5  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.370175  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.92 
 
 
538 aa  95.1  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6027  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.15 
 
 
207 aa  95.1  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1554  metal dependent phosphohydrolase  32.83 
 
 
370 aa  92.8  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.307535  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0903  hypothetical protein  32.51 
 
 
216 aa  92  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.631928  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0228  uncharacterized MobA-related protein  31.32 
 
 
363 aa  92  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2205  hypothetical protein  28.18 
 
 
242 aa  92  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  33.5 
 
 
367 aa  91.7  8e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2410  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.5 
 
 
194 aa  90.5  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0836  hypothetical protein  32.66 
 
 
196 aa  89.7  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0203  hypothetical protein  37.17 
 
 
203 aa  89  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.761699  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  29.21 
 
 
204 aa  88.6  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  33.83 
 
 
198 aa  88.2  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1816  metal dependent phosphohydrolase  30.57 
 
 
372 aa  86.7  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3547  MobA-like protein-like  33.33 
 
 
384 aa  85.9  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871069  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0360  hypothetical protein  30.77 
 
 
190 aa  85.1  7e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000717889  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  28.79 
 
 
199 aa  85.1  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5614  hypothetical protein  36.26 
 
 
185 aa  84.7  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2489  hypothetical protein  35.6 
 
 
192 aa  84.7  9e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.152259  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  35.03 
 
 
201 aa  84.3  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  32.5 
 
 
591 aa  82.4  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0214  hypothetical protein  37.75 
 
 
220 aa  82  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33 
 
 
210 aa  79.3  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1582  metal dependent phosphohydrolase  30.48 
 
 
459 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.93 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  30.93 
 
 
208 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4718  uncharacterized MobA-related protein-like protein  34.17 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.819957 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5470  uncharacterized MobA-related protein  34.67 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0663776 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0890  uncharacterized MobA-related protein  35.15 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.28742  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3554  uncharacterized MobA-related protein  34.67 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4195  MobA-like protein-like protein  34.17 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4813  uncharacterized MobA-related protein  34.67 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.913909 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  26.56 
 
 
190 aa  75.9  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3790  uncharacterized MobA-related protein  37.5 
 
 
194 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0141357 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3029  molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.84 
 
 
203 aa  73.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.098074  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0201  hypothetical protein  34.33 
 
 
202 aa  73.6  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0123  MobA-like protein  35.23 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.14106  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2846  hypothetical protein  35.35 
 
 
193 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449385  decreased coverage  0.00911048 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1484  hypothetical protein  36.32 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205253  normal  0.364405 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3415  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  35.68 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4741  hypothetical protein  36.92 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  38.02 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2641  MobA-related protein  23.92 
 
 
394 aa  72  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05439  hypothetical protein  32.99 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232404  normal  0.0351098 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  32.98 
 
 
191 aa  70.9  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0199  hypothetical protein  34.2 
 
 
213 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182952  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  30.81 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2928  hypothetical protein  37.76 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.85 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  31.25 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1224  MobA-like protein-like protein  23.62 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.607114  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  25.49 
 
 
195 aa  69.3  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  32 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1745  hypothetical protein  29.94 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>