125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2563 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2563  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  389  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.778302  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3555  hypothetical protein  62.57 
 
 
182 aa  220  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.919996  normal  0.404 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2698  hypothetical protein  64.94 
 
 
174 aa  205  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3943  hypothetical protein  64.61 
 
 
190 aa  200  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00148213  normal  0.123195 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3712  hypothetical protein  64.67 
 
 
188 aa  188  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0867  hypothetical protein  53.55 
 
 
185 aa  177  9e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2921  hypothetical protein  42.08 
 
 
216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.627898 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2928  hypothetical protein  43.08 
 
 
210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.796136  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0890  uncharacterized MobA-related protein  38.3 
 
 
194 aa  90.5  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.28742  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4167  hypothetical protein  36.36 
 
 
198 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0348908  normal  0.0855326 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3790  uncharacterized MobA-related protein  46.9 
 
 
194 aa  89  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0141357 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2617  hypothetical protein  36.7 
 
 
196 aa  88.2  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4019  hypothetical protein  34.05 
 
 
194 aa  86.7  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0410736 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3554  uncharacterized MobA-related protein  37.23 
 
 
194 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4813  uncharacterized MobA-related protein  37.23 
 
 
194 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.913909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5470  uncharacterized MobA-related protein  37.23 
 
 
194 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0663776 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0211  hypothetical protein  35.05 
 
 
346 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0194719  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5992  hypothetical protein  43.86 
 
 
195 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.361176 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2227  hypothetical protein  44.64 
 
 
195 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  32.98 
 
 
191 aa  80.9  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1894  hypothetical protein  32.09 
 
 
199 aa  79.7  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1707  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  37.57 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1620  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  37.57 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3725  hypothetical protein  39.82 
 
 
198 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25820  hypothetical protein  36.02 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.708466  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4718  uncharacterized MobA-related protein-like protein  35.64 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.819957 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4726  hypothetical protein  32.31 
 
 
195 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.048995 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4802  hypothetical protein  39.82 
 
 
198 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394051  normal  0.300169 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4195  MobA-like protein-like protein  35.64 
 
 
194 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05439  hypothetical protein  32.14 
 
 
199 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232404  normal  0.0351098 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1199  hypothetical protein  44.74 
 
 
199 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570343  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0201  hypothetical protein  46.49 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0530  hypothetical protein  31.53 
 
 
207 aa  74.3  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  34.9 
 
 
192 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0358  hypothetical protein  30.89 
 
 
198 aa  67.8  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  31.61 
 
 
575 aa  67.4  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  32.83 
 
 
199 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  35.94 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.74 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2658  hypothetical protein  31.22 
 
 
197 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421379  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  30.05 
 
 
187 aa  63.5  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  31.34 
 
 
208 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.34 
 
 
208 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  25.81 
 
 
189 aa  61.6  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1554  metal dependent phosphohydrolase  34.38 
 
 
370 aa  61.2  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.307535  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  31.12 
 
 
201 aa  59.7  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  30.48 
 
 
187 aa  59.3  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3796  hypothetical protein  34.38 
 
 
185 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328726  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2392  hypothetical protein  28.49 
 
 
207 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  35.16 
 
 
591 aa  58.9  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  35.04 
 
 
367 aa  58.5  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0793  hypothetical protein  28.65 
 
 
207 aa  58.2  0.00000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.41 
 
 
533 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  28.12 
 
 
216 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.69 
 
 
202 aa  57.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  28.93 
 
 
197 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0123  MobA-like protein  30.98 
 
 
190 aa  56.6  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.14106  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  28.87 
 
 
214 aa  56.6  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1079  molybdopterin biosynthesis enzyme  34.08 
 
 
218 aa  57  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.08 
 
 
194 aa  57  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.87 
 
 
534 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0418  hypothetical protein  29.69 
 
 
201 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159486  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1634  MobA-like protein  33.16 
 
 
188 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  33.51 
 
 
188 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4230  hypothetical protein  32.62 
 
 
188 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  29.19 
 
 
534 aa  54.7  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1779  hypothetical protein  28.95 
 
 
186 aa  55.1  0.0000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.93 
 
 
533 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.31 
 
 
204 aa  52.8  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0836  hypothetical protein  29.7 
 
 
196 aa  53.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3547  MobA-like protein-like  32.82 
 
 
384 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871069  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  29.32 
 
 
534 aa  52  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  30.1 
 
 
455 aa  52  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1757  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.65 
 
 
199 aa  52  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.81 
 
 
207 aa  51.6  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  29.41 
 
 
544 aa  51.6  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  31.78 
 
 
539 aa  50.8  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1433  hypothetical protein  29.19 
 
 
208 aa  50.1  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.170444 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  25.59 
 
 
539 aa  50.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  21.17 
 
 
195 aa  50.1  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0360  hypothetical protein  23.4 
 
 
190 aa  50.1  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000717889  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1582  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
459 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  27.84 
 
 
534 aa  49.3  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1381  MobA-like protein  35.45 
 
 
293 aa  48.5  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.223593  normal  0.271333 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0831  hypothetical protein  31.4 
 
 
171 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0815  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  31.4 
 
 
192 aa  47  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2037  hypothetical protein  28.67 
 
 
222 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0186754  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1006  metal dependent phosphohydrolase  36.84 
 
 
373 aa  46.6  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.79 
 
 
203 aa  47  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  26.61 
 
 
199 aa  47  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  29.2 
 
 
389 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02710  hypothetical protein  31.03 
 
 
192 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02672  hypothetical protein  31.03 
 
 
192 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3037  hypothetical protein  31.03 
 
 
192 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3010  hypothetical protein  31.03 
 
 
192 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5193  hypothetical protein  36.36 
 
 
211 aa  46.6  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2928  hypothetical protein  42.65 
 
 
199 aa  45.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.84 
 
 
533 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1573  hypothetical protein  42.65 
 
 
199 aa  45.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0210508  normal  0.559729 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3203  hypothetical protein  31.03 
 
 
192 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>