105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5193 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5193  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  398  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  35.86 
 
 
216 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  36.41 
 
 
591 aa  77.4  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  33 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  31.09 
 
 
455 aa  70.1  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2928  hypothetical protein  35.27 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.796136  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  25.76 
 
 
204 aa  67.8  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0530  hypothetical protein  31.37 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2410  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.16 
 
 
194 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  29.38 
 
 
389 aa  62.8  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2921  hypothetical protein  32.85 
 
 
216 aa  62.4  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.627898 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2648  molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.37 
 
 
213 aa  62  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.01 
 
 
193 aa  62  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  21.11 
 
 
195 aa  61.2  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.44 
 
 
189 aa  58.5  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  30.65 
 
 
188 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  33 
 
 
367 aa  58.5  0.00000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4802  hypothetical protein  36.57 
 
 
198 aa  58.2  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394051  normal  0.300169 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3725  hypothetical protein  36.57 
 
 
198 aa  58.2  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  35.2 
 
 
192 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32 
 
 
533 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3432  metal dependent phosphohydrolase  30.35 
 
 
408 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.16 
 
 
202 aa  57  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2205  hypothetical protein  25.3 
 
 
242 aa  57  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1554  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
370 aa  57  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.307535  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.08 
 
 
202 aa  56.2  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1467  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  24.39 
 
 
368 aa  55.8  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700168  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1816  hypothetical protein  27.75 
 
 
200 aa  55.5  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0836  hypothetical protein  32.14 
 
 
196 aa  55.5  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1779  hypothetical protein  31.31 
 
 
186 aa  55.5  0.0000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4015  hypothetical protein  35.18 
 
 
233 aa  55.5  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  34 
 
 
201 aa  55.5  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0903  hypothetical protein  25 
 
 
216 aa  54.7  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.631928  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3547  MobA-like protein-like  34.02 
 
 
384 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871069  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  31.47 
 
 
191 aa  52.8  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0793  hypothetical protein  33.5 
 
 
207 aa  52.8  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  30.5 
 
 
534 aa  52.4  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.84 
 
 
533 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1707  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  33.55 
 
 
199 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1620  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  33.55 
 
 
199 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4741  hypothetical protein  34.39 
 
 
213 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  32.5 
 
 
534 aa  52  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1582  metal dependent phosphohydrolase  34.53 
 
 
459 aa  52.4  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4726  hypothetical protein  30.1 
 
 
195 aa  52  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.048995 
 
 
-
 
NC_003296  RS05439  hypothetical protein  36.36 
 
 
199 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232404  normal  0.0351098 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1816  metal dependent phosphohydrolase  31.51 
 
 
423 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.445922  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25820  hypothetical protein  34.17 
 
 
200 aa  51.2  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.708466  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.47 
 
 
207 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2037  hypothetical protein  30.61 
 
 
222 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0186754  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  35.03 
 
 
191 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1816  metal dependent phosphohydrolase  28.35 
 
 
372 aa  50.8  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0211  hypothetical protein  33.55 
 
 
346 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0194719  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3554  uncharacterized MobA-related protein  36.64 
 
 
194 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4813  uncharacterized MobA-related protein  36.64 
 
 
194 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.913909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5470  uncharacterized MobA-related protein  36.64 
 
 
194 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0663776 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4718  uncharacterized MobA-related protein-like protein  35.11 
 
 
194 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.819957 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5992  hypothetical protein  31.94 
 
 
195 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.361176 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2227  hypothetical protein  31.97 
 
 
195 aa  49.3  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4195  MobA-like protein-like protein  35.11 
 
 
194 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0201  hypothetical protein  35.1 
 
 
202 aa  49.3  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0890  uncharacterized MobA-related protein  39.85 
 
 
194 aa  49.3  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.28742  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  32.66 
 
 
544 aa  48.5  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2392  hypothetical protein  27.41 
 
 
207 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3555  hypothetical protein  28.57 
 
 
182 aa  48.1  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.919996  normal  0.404 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0203  hypothetical protein  31.19 
 
 
203 aa  48.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.761699  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31 
 
 
534 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  30.61 
 
 
187 aa  47.8  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3796  hypothetical protein  33.17 
 
 
185 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328726  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  26.63 
 
 
199 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  31.12 
 
 
214 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.5 
 
 
197 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1188  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.16 
 
 
197 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143953  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  29 
 
 
210 aa  46.6  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1634  MobA-like protein  34.02 
 
 
188 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.67 
 
 
197 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.134734 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4230  hypothetical protein  34.02 
 
 
188 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0228  uncharacterized MobA-related protein  28.05 
 
 
363 aa  45.8  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2563  hypothetical protein  36.36 
 
 
200 aa  46.2  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.778302  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1006  metal dependent phosphohydrolase  30.46 
 
 
373 aa  46.2  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  31.47 
 
 
534 aa  45.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  32.59 
 
 
205 aa  46.2  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0634  metal dependent phosphohydrolase  34.11 
 
 
514 aa  45.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0970853 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0984  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.66 
 
 
197 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0360339  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.64 
 
 
539 aa  45.4  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  34.34 
 
 
546 aa  44.7  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1199  hypothetical protein  35.03 
 
 
199 aa  44.3  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570343  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0036  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  30.1 
 
 
225 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3790  uncharacterized MobA-related protein  35.88 
 
 
194 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0141357 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4656  hypothetical protein  31.37 
 
 
203 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720744  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3415  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  31.31 
 
 
191 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6199  hypothetical protein  31.25 
 
 
251 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.326394  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1484  hypothetical protein  32.55 
 
 
201 aa  43.9  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205253  normal  0.364405 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.65 
 
 
194 aa  43.5  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3453  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 
216 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1894  hypothetical protein  29.17 
 
 
199 aa  43.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4167  hypothetical protein  29.56 
 
 
198 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0348908  normal  0.0855326 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2068  hypothetical protein  37.64 
 
 
189 aa  43.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0199  hypothetical protein  33.85 
 
 
213 aa  43.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182952  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  30.85 
 
 
575 aa  43.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6661  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  30.58 
 
 
483 aa  43.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>