More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2410 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2410  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  100 
 
 
194 aa  391  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1467  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  43.23 
 
 
368 aa  156  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700168  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1554  metal dependent phosphohydrolase  47.69 
 
 
370 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.307535  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1006  metal dependent phosphohydrolase  44.09 
 
 
373 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1816  hypothetical protein  43.98 
 
 
200 aa  143  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1816  metal dependent phosphohydrolase  43.01 
 
 
372 aa  137  7e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  44.21 
 
 
389 aa  135  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  42.71 
 
 
367 aa  131  6.999999999999999e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1545  metal dependent phosphohydrolase  40.72 
 
 
393 aa  123  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3432  metal dependent phosphohydrolase  40.1 
 
 
408 aa  121  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3547  MobA-like protein-like  42.41 
 
 
384 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871069  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3453  metal dependent phosphohydrolase  36.56 
 
 
216 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  36.65 
 
 
591 aa  108  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1816  metal dependent phosphohydrolase  40.85 
 
 
423 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.445922  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0228  uncharacterized MobA-related protein  35.91 
 
 
363 aa  101  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  37.7 
 
 
216 aa  100  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1582  metal dependent phosphohydrolase  33.88 
 
 
459 aa  99  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.36 
 
 
533 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  35.64 
 
 
534 aa  92.4  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  38.66 
 
 
202 aa  91.3  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0036  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  33.16 
 
 
225 aa  91.3  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  33.5 
 
 
210 aa  90.5  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.29 
 
 
533 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.96 
 
 
194 aa  87.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.69 
 
 
208 aa  85.9  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.76 
 
 
534 aa  85.1  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  32.46 
 
 
534 aa  85.1  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  31.25 
 
 
575 aa  84.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.97 
 
 
197 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.134734 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  33.51 
 
 
455 aa  82  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0825  MobA-like protein-like protein  33.16 
 
 
196 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207801  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0634  metal dependent phosphohydrolase  37.75 
 
 
514 aa  79  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0970853 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0203  hypothetical protein  36.56 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.761699  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0984  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.31 
 
 
197 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0360339  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1188  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.77 
 
 
197 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143953  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2648  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.33 
 
 
213 aa  77.8  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  36.32 
 
 
546 aa  77.8  0.00000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.29 
 
 
533 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  30.53 
 
 
200 aa  75.1  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  31.41 
 
 
534 aa  75.1  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.72 
 
 
539 aa  74.3  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.1 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.32 
 
 
202 aa  73.2  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0836  hypothetical protein  31.98 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  35.54 
 
 
205 aa  72.4  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2205  hypothetical protein  27.17 
 
 
242 aa  71.6  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0360  hypothetical protein  27.41 
 
 
190 aa  70.5  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000717889  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  30.81 
 
 
544 aa  69.7  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  30.27 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.7 
 
 
189 aa  68.9  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1757  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.53 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.92 
 
 
204 aa  67.8  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  34.04 
 
 
211 aa  67  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  31.87 
 
 
538 aa  67.4  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0464  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  26.5 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.72 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5450  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.37 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  26.13 
 
 
195 aa  65.5  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  30.88 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  33.16 
 
 
197 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.9 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  30.05 
 
 
199 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  30.26 
 
 
201 aa  64.3  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.19 
 
 
538 aa  63.2  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5992  hypothetical protein  30.16 
 
 
195 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.361176 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0903  hypothetical protein  28.87 
 
 
216 aa  63.5  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.631928  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2698  hypothetical protein  30.16 
 
 
174 aa  62  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  30.98 
 
 
214 aa  61.2  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4656  hypothetical protein  31.22 
 
 
203 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720744  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2928  hypothetical protein  36.21 
 
 
210 aa  60.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.796136  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25820  hypothetical protein  29.29 
 
 
200 aa  60.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.708466  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  30.1 
 
 
187 aa  59.7  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1165  2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase  36.45 
 
 
382 aa  60.1  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5193  hypothetical protein  31.16 
 
 
211 aa  60.1  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2474  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  31.55 
 
 
210 aa  59.7  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  34.22 
 
 
192 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0123  MobA-like protein  32.97 
 
 
190 aa  59.3  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.14106  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01478  molybdopterin guanine dinucleotide synthase  31.28 
 
 
186 aa  59.3  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2171  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  29.44 
 
 
195 aa  59.3  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.755723  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.64 
 
 
207 aa  58.5  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2977  hypothetical protein  31.79 
 
 
195 aa  58.5  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000274563  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0300  putative bifunctional molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein MobA/MobB  26.6 
 
 
392 aa  58.2  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.384307  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2695  hypothetical protein  30.46 
 
 
202 aa  57.8  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0332984  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4204  MobA-like protein-like protein  26.67 
 
 
204 aa  58.2  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212178  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03743  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  28.64 
 
 
194 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.595524  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4129  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  28.64 
 
 
194 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03692  hypothetical protein  28.64 
 
 
194 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.42744  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4741  hypothetical protein  30.23 
 
 
213 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4329  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein MobA  28.64 
 
 
194 aa  57.8  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5297  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein MobA  28.64 
 
 
194 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.267259  normal  0.668938 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2921  hypothetical protein  31.91 
 
 
216 aa  57.4  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.627898 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0793  hypothetical protein  28.21 
 
 
207 aa  56.6  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  30.21 
 
 
198 aa  56.6  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1894  hypothetical protein  31.35 
 
 
199 aa  56.6  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1746  hypothetical protein  27.63 
 
 
191 aa  56.6  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2174  molybdenum cofactor guanylyltransferase  34.65 
 
 
198 aa  56.6  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.881016  normal  0.0453218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4204  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein MobA  30.96 
 
 
194 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.489258  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2227  hypothetical protein  31.25 
 
 
195 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4225  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein MobA  30.46 
 
 
194 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0792161  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0909  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  30.96 
 
 
195 aa  57  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>