198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3415 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3415  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  100 
 
 
191 aa  367  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3196  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  66.5 
 
 
211 aa  230  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  47.92 
 
 
193 aa  138  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2977  hypothetical protein  45.95 
 
 
195 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000274563  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  44.97 
 
 
210 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2846  hypothetical protein  47.12 
 
 
193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449385  decreased coverage  0.00911048 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5126  hypothetical protein  45.51 
 
 
184 aa  114  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  46.28 
 
 
195 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4741  hypothetical protein  43.82 
 
 
213 aa  107  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  39.29 
 
 
212 aa  107  9.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0199  hypothetical protein  42.86 
 
 
213 aa  101  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182952  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13070  uncharacterized MobA-like protein  42.39 
 
 
194 aa  100  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1881  hypothetical protein  42.55 
 
 
200 aa  97.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4967  hypothetical protein  43.62 
 
 
193 aa  96.3  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3203  hypothetical protein  39.66 
 
 
197 aa  91.7  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.950597  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  35.83 
 
 
455 aa  91.3  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2979  hypothetical protein  38.55 
 
 
197 aa  89  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.220075 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  37.08 
 
 
205 aa  87.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  35.11 
 
 
534 aa  85.9  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  36.84 
 
 
211 aa  85.1  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  33.86 
 
 
200 aa  84.3  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  30.96 
 
 
204 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  36.18 
 
 
210 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0328  hypothetical protein  35.58 
 
 
227 aa  81.6  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.57 
 
 
202 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.21 
 
 
533 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2799  hypothetical protein  40.1 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  39.06 
 
 
546 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  31.91 
 
 
534 aa  79  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  32.45 
 
 
534 aa  79  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.8 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  29.69 
 
 
190 aa  77.8  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.45 
 
 
533 aa  77  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.32 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.45 
 
 
534 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1188  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.89 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143953  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  33.87 
 
 
544 aa  75.1  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  32.8 
 
 
575 aa  74.7  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  30.65 
 
 
216 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1554  metal dependent phosphohydrolase  32.11 
 
 
370 aa  74.7  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.307535  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0984  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.17 
 
 
197 aa  74.7  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0360339  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  35.47 
 
 
538 aa  73.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  36.22 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  25.65 
 
 
195 aa  73.2  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3976  hypothetical protein  38.97 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326622  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2617  hypothetical protein  34.54 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.94 
 
 
539 aa  72.8  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0203  hypothetical protein  35.11 
 
 
203 aa  71.2  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.761699  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1816  metal dependent phosphohydrolase  34.21 
 
 
372 aa  70.9  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.82 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.134734 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.94 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  33.9 
 
 
187 aa  68.6  0.00000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3029  molybdenum cofactor biosynthesis protein  38.29 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.098074  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.12 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4310  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  33.64 
 
 
228 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.707183  normal  0.580614 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1283  hypothetical protein  36.7 
 
 
181 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260926  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1300  hypothetical protein  36.7 
 
 
181 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0119759  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.33 
 
 
208 aa  63.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  29.47 
 
 
199 aa  63.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1662  hypothetical protein  38.1 
 
 
181 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  27.89 
 
 
208 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.38 
 
 
203 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4787  hypothetical protein  39.15 
 
 
175 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171606  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6199  hypothetical protein  43.01 
 
 
251 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.326394  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  30.32 
 
 
197 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2964  hypothetical protein  36.36 
 
 
196 aa  63.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0825  MobA-like protein-like protein  32.45 
 
 
196 aa  63.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207801  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.89 
 
 
208 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.95 
 
 
202 aa  62.8  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0903  hypothetical protein  29.41 
 
 
216 aa  62.4  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.631928  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4204  MobA-like protein-like protein  25.51 
 
 
204 aa  62.4  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212178  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10350  hypothetical protein  38.39 
 
 
136 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2037  hypothetical protein  35.04 
 
 
222 aa  61.2  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0186754  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2695  hypothetical protein  34.75 
 
 
202 aa  60.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0332984  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.23 
 
 
197 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2410  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.65 
 
 
194 aa  60.5  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.79 
 
 
533 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1224  MobA-like protein-like protein  20.73 
 
 
201 aa  59.7  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.607114  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0360  hypothetical protein  26.42 
 
 
190 aa  60.5  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000717889  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2648  molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.86 
 
 
213 aa  59.3  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  33.16 
 
 
191 aa  59.7  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1746  hypothetical protein  25.73 
 
 
191 aa  58.5  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2512  hypothetical protein  30.37 
 
 
221 aa  58.2  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  36.64 
 
 
192 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1495  hypothetical protein  31.06 
 
 
234 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1779  hypothetical protein  33.33 
 
 
186 aa  57  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1312  hypothetical protein  40.96 
 
 
181 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  35.68 
 
 
201 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0214  hypothetical protein  38.38 
 
 
220 aa  56.6  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4656  hypothetical protein  31.96 
 
 
203 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720744  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2091  molybdopterin binding protein  28.88 
 
 
202 aa  56.2  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.865191  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0225  hypothetical protein  39.42 
 
 
197 aa  56.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.633552  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2392  hypothetical protein  30.77 
 
 
207 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0036  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  28.27 
 
 
225 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  27.66 
 
 
389 aa  55.5  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  31.22 
 
 
187 aa  55.1  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0921  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  34.05 
 
 
200 aa  55.1  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.370175  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2658  hypothetical protein  30.3 
 
 
197 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421379  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3547  MobA-like protein-like  33.33 
 
 
384 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871069  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1438  hypothetical protein  31.61 
 
 
228 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>