128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0214 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0214  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  412  1e-114  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2695  hypothetical protein  41.67 
 
 
202 aa  115  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0332984  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  40.41 
 
 
194 aa  105  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  37.75 
 
 
210 aa  91.7  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  37.84 
 
 
534 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  30.41 
 
 
190 aa  87  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  38.46 
 
 
211 aa  85.1  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  35.5 
 
 
455 aa  84.3  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.36 
 
 
533 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  36.97 
 
 
546 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  41.5 
 
 
195 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0306  hypothetical protein  39.7 
 
 
206 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.05 
 
 
207 aa  80.9  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.5 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0317  hypothetical protein  39.7 
 
 
207 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.449595  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0328  hypothetical protein  39.7 
 
 
207 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5450  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  44.5 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  35.27 
 
 
534 aa  79.3  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.94 
 
 
533 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35 
 
 
534 aa  79  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.83 
 
 
202 aa  78.2  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  32.83 
 
 
205 aa  78.2  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.45 
 
 
533 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.96 
 
 
197 aa  77  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  34.62 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  28.71 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.85 
 
 
202 aa  75.5  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.11 
 
 
204 aa  75.1  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  32.34 
 
 
216 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  33.17 
 
 
198 aa  74.7  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.73 
 
 
538 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  36.87 
 
 
538 aa  73.2  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.99 
 
 
539 aa  70.9  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.32 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0825  MobA-like protein-like protein  33.67 
 
 
196 aa  69.3  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207801  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0984  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  47.9 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0360339  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1757  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  40.5 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1188  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  39.7 
 
 
197 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143953  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  36.06 
 
 
212 aa  67.8  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  32.44 
 
 
534 aa  67  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  43.69 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2977  hypothetical protein  36.22 
 
 
195 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000274563  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  33.17 
 
 
575 aa  64.3  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0036  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  34.78 
 
 
225 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  32.83 
 
 
200 aa  63.5  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  39.29 
 
 
197 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.134734 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32 
 
 
193 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4204  MobA-like protein-like protein  25.63 
 
 
204 aa  61.6  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212178  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1881  hypothetical protein  34.65 
 
 
200 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3215  hypothetical protein  37.63 
 
 
201 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  27.55 
 
 
199 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2846  hypothetical protein  34.5 
 
 
193 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449385  decreased coverage  0.00911048 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.56 
 
 
208 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  29.56 
 
 
208 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3196  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  35.89 
 
 
211 aa  58.9  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  27.04 
 
 
195 aa  58.5  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3415  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  38.38 
 
 
191 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3029  molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.01 
 
 
203 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.098074  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3300  hypothetical protein  35.9 
 
 
201 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20416  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0836  hypothetical protein  37.96 
 
 
196 aa  56.6  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6027  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.49 
 
 
207 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  28.78 
 
 
591 aa  56.2  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0793  hypothetical protein  32.34 
 
 
207 aa  55.8  0.0000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0123  MobA-like protein  35.08 
 
 
190 aa  55.5  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.14106  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  32.86 
 
 
544 aa  55.1  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0203  hypothetical protein  31.77 
 
 
203 aa  55.1  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.761699  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  32.98 
 
 
187 aa  54.3  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  31.96 
 
 
191 aa  53.5  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3725  hypothetical protein  35.71 
 
 
198 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1779  hypothetical protein  31.96 
 
 
186 aa  53.1  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4802  hypothetical protein  35.71 
 
 
198 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394051  normal  0.300169 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2410  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.99 
 
 
194 aa  53.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3105  hypothetical protein  35.9 
 
 
201 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.247192  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4656  hypothetical protein  30.2 
 
 
203 aa  52.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720744  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4741  hypothetical protein  31.87 
 
 
213 aa  51.6  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  25.64 
 
 
189 aa  51.2  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  33.99 
 
 
201 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1989  hypothetical protein  33.16 
 
 
208 aa  50.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1079  molybdopterin biosynthesis enzyme  28.92 
 
 
218 aa  51.2  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2512  hypothetical protein  29.44 
 
 
221 aa  50.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2037  hypothetical protein  30.96 
 
 
222 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0186754  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0201  hypothetical protein  36.5 
 
 
202 aa  50.1  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1399  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  28.37 
 
 
207 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1894  hypothetical protein  30.65 
 
 
199 aa  49.3  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  33.33 
 
 
539 aa  49.3  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0530  hypothetical protein  33.33 
 
 
207 aa  48.5  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  33.65 
 
 
197 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0360  hypothetical protein  25.26 
 
 
190 aa  48.5  0.00009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000717889  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3453  metal dependent phosphohydrolase  25.25 
 
 
216 aa  48.1  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02165  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  22.48 
 
 
289 aa  47  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.892695  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4525  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  35.57 
 
 
461 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4195  MobA-like protein-like protein  34.5 
 
 
194 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2731  hypothetical protein  34.44 
 
 
245 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0921  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  37.11 
 
 
200 aa  46.2  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.370175  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4718  uncharacterized MobA-related protein-like protein  34.5 
 
 
194 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.819957 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1628  hypothetical protein  34.44 
 
 
245 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00936248 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1433  hypothetical protein  31.72 
 
 
208 aa  45.8  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.170444 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5126  hypothetical protein  33.53 
 
 
184 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05439  hypothetical protein  36.54 
 
 
199 aa  45.8  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232404  normal  0.0351098 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1484  hypothetical protein  33.68 
 
 
201 aa  45.8  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205253  normal  0.364405 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>